44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2193 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2193  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1032  hypothetical protein  74.65 
 
 		 213 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0995  hypothetical protein  72.77 
 
 		 213 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3063  hypothetical protein  78.87 
 
 		 213 aa  258  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2181  hypothetical protein  59.62 
 
 		 213 aa  235  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5130  protein of unknown function DUF1109  52.58 
 
 		 213 aa  216  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5017  hypothetical protein  52.58 
 
 		 213 aa  204  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5143  protein of unknown function DUF1109  55.87 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1215  protein of unknown function DUF1109  46.73 
 
 		 213 aa  186  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.344789  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4687  hypothetical protein  51.64 
 
 		 213 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2177  hypothetical protein  49.77 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2034  putative transmembrane protein DUF1109  49.77 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2589  hypothetical protein  47.42 
 
 		 213 aa  165  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5126  protein of unknown function DUF1109  40.85 
 
 		 213 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1521  hypothetical protein  44.88 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2176  hypothetical protein  43.19 
 
 		 236 aa  138  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2033  putative transmembrane protein DUF1109  42.72 
 
 		 213 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4407  hypothetical protein  38.5 
 
 		 213 aa  131  9e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2667  protein of unknown function DUF1109  49.77 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  41.1 
 
 		 212 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  38.5 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0063  hypothetical protein  38.28 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.495811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  37.04 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4812  protein of unknown function DUF1109  40.09 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  37.09 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  40.91 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0019  hypothetical protein  38.39 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0022  hypothetical protein  37.91 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909042  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  40.28 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0957  hypothetical protein  32.39 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2572  protein of unknown function DUF1109  37.26 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0108126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4102  hypothetical protein  34.6 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0818  hypothetical protein  42.28 
 
 		 128 aa  86.3  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0760  hypothetical protein  38.43 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167226  normal  0.389046 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2035  hypothetical protein  34.9 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0955586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3134  hypothetical protein  37.38 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3008  hypothetical protein  33.03 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1911  hypothetical protein  28.83 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0306  protein of unknown function DUF1109  34.11 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2017  protein of unknown function DUF1109  27.19 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1741  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3554  hypothetical protein  28.28 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30328  normal  0.787659 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0046  hypothetical protein  52.38 
 
 		 81 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2681  hypothetical protein  34.78 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.76812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>