More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2540 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 464 aa  941    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  62.8 
 
 		 466 aa  565  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  59.35 
 
 		 462 aa  545  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  58.96 
 
 		 466 aa  542  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  52.28 
 
 		 461 aa  475  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  50.76 
 
 		 470 aa  477  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  50.11 
 
 		 470 aa  461  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  49.89 
 
 		 470 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  50.11 
 
 		 470 aa  464  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  50.33 
 
 		 470 aa  464  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  50.33 
 
 		 470 aa  465  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  52.28 
 
 		 462 aa  464  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.77 
 
 		 457 aa  462  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  49.89 
 
 		 470 aa  462  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  50.33 
 
 		 470 aa  462  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  50.11 
 
 		 470 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  50.98 
 
 		 461 aa  464  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  49.56 
 
 		 457 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  48.15 
 
 		 472 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  50.33 
 
 		 470 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  49.67 
 
 		 470 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  50.11 
 
 		 462 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  50 
 
 		 457 aa  456  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  50.22 
 
 		 460 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.3 
 
 		 460 aa  442  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.3 
 
 		 461 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1994  FAD linked oxidase domain protein  49.02 
 
 		 461 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  42.95 
 
 		 459 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  43.94 
 
 		 459 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  43.51 
 
 		 459 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  43.94 
 
 		 459 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.37 
 
 		 464 aa  402  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.56 
 
 		 469 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.69 
 
 		 459 aa  398  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  43.1 
 
 		 466 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  42.83 
 
 		 461 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4382  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.38 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.29 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  41.09 
 
 		 461 aa  386  1e-106  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.17 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  43.19 
 
 		 456 aa  385  1e-105  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.74 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.98 
 
 		 460 aa  378  1e-103  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  41.18 
 
 		 460 aa  378  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.91 
 
 		 460 aa  372  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.91 
 
 		 460 aa  371  1e-101  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  46.24 
 
 		 459 aa  372  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.91 
 
 		 460 aa  371  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.08 
 
 		 462 aa  369  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.75 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  40.93 
 
 		 460 aa  362  7.0000000000000005e-99  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.91 
 
 		 496 aa  348  1e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  40.17 
 
 		 499 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  40.17 
 
 		 499 aa  346  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  40.44 
 
 		 457 aa  346  4e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0369  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.27 
 
 		 468 aa  343  5e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388764  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.23 
 
 		 486 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  39.74 
 
 		 474 aa  340  5e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.9 
 
 		 461 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.61 
 
 		 457 aa  338  9e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.83 
 
 		 890 aa  338  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  41.74 
 
 		 461 aa  338  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.09 
 
 		 494 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  39.13 
 
 		 503 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  38.96 
 
 		 499 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  38.49 
 
 		 483 aa  335  1e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  38.02 
 
 		 462 aa  332  8e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  38.24 
 
 		 462 aa  332  9e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  38.24 
 
 		 462 aa  332  9e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  37.28 
 
 		 499 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  38.96 
 
 		 499 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  38.83 
 
 		 499 aa  332  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.43 
 
 		 499 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  38.07 
 
 		 499 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.05 
 
 		 501 aa  331  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  37.72 
 
 		 499 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  37.8 
 
 		 499 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.44 
 
 		 475 aa  330  4e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  37.2 
 
 		 484 aa  329  8e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  37.17 
 
 		 485 aa  328  9e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.6 
 
 		 887 aa  328  9e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  39.56 
 
 		 455 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  38.16 
 
 		 481 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1870  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.68 
 
 		 502 aa  327  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.200444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  39 
 
 		 495 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2833  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.74 
 
 		 484 aa  327  3e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2581  FAD linked oxidase  37.72 
 
 		 497 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.209325 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  38.44 
 
 		 485 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  38.2 
 
 		 499 aa  327  4.0000000000000003e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  39 
 
 		 495 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  40.05 
 
 		 498 aa  325  9e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2652  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.31 
 
 		 497 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0510945 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3978  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.61 
 
 		 497 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  38.29 
 
 		 499 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4091  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.34 
 
 		 492 aa  325  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  40.17 
 
 		 460 aa  324  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1695  FAD linked oxidase domain protein  38.1 
 
 		 495 aa  325  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.84126 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  38.74 
 
 		 499 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0250  FAD linked oxidase-like  37.88 
 
 		 497 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.88 
 
 		 497 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>