More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1707 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  100 
 
 		 348 aa  700    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  62.03 
 
 		 316 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  53.87 
 
 		 347 aa  359  5e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  57.19 
 
 		 328 aa  349  4e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  48.96 
 
 		 340 aa  324  1e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  50.15 
 
 		 347 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  44.8 
 
 		 342 aa  323  3e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  58.05 
 
 		 317 aa  322  4e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  47.52 
 
 		 343 aa  318  7.999999999999999e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  46.65 
 
 		 344 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  52.27 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  47.23 
 
 		 343 aa  315  5e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  54.13 
 
 		 328 aa  312  6.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  52.77 
 
 		 343 aa  308  8e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  50.5 
 
 		 323 aa  305  7e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  49.41 
 
 		 346 aa  305  7e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  47.31 
 
 		 343 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  50.97 
 
 		 320 aa  301  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  49.67 
 
 		 315 aa  301  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  47.02 
 
 		 354 aa  299  5e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  50 
 
 		 343 aa  298  9e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  46.27 
 
 		 352 aa  296  3e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  53.89 
 
 		 345 aa  296  4e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  48.53 
 
 		 343 aa  292  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  43.99 
 
 		 358 aa  291  1e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  50.79 
 
 		 326 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  52.98 
 
 		 317 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  51.31 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2746  selenide, water dikinase  48.88 
 
 		 321 aa  280  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201658  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  47.09 
 
 		 351 aa  279  5e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  48.97 
 
 		 350 aa  279  6e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  44.64 
 
 		 348 aa  277  2e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  46.06 
 
 		 354 aa  273  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  47.34 
 
 		 327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  44.77 
 
 		 351 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  46.23 
 
 		 318 aa  271  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1677  selenide, water dikinase  42.69 
 
 		 340 aa  270  2e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.309519  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  43.79 
 
 		 344 aa  270  4e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  45.06 
 
 		 355 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  45.82 
 
 		 340 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  42.56 
 
 		 360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  42.77 
 
 		 357 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  42.51 
 
 		 325 aa  260  3e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  46.3 
 
 		 316 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1684  selenide, water dikinase  44.57 
 
 		 351 aa  257  3e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.815145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  43.35 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2555  selenophosphate synthetase  43.07 
 
 		 354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  37.7 
 
 		 378 aa  253  5.000000000000001e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  42.41 
 
 		 671 aa  252  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  42.14 
 
 		 356 aa  252  7e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  42.73 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  41.84 
 
 		 356 aa  251  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1496  selenide, water dikinase  41.94 
 
 		 308 aa  251  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.258981  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2225  selenophosphate synthase  49.11 
 
 		 297 aa  249  5e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  40.88 
 
 		 337 aa  249  7e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01733  selenophosphate synthetase  40.91 
 
 		 347 aa  248  8e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00709859  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01721  hypothetical protein  40.91 
 
 		 347 aa  248  8e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0120641  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0362  selenide, water dikinase (possible start at 335663)  42.91 
 
 		 320 aa  248  9e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  49.28 
 
 		 291 aa  248  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1878  selenide, water dikinase  40.62 
 
 		 347 aa  247  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247238  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1424  selenophosphate synthetase  40.91 
 
 		 347 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.583655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1848  selenophosphate synthetase  40.62 
 
 		 347 aa  247  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000400465  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1408  selenophosphate synthetase  40.91 
 
 		 347 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00232464  normal  0.656366 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1391  selenophosphate synthetase  40.91 
 
 		 347 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.472667  normal  0.374836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1878  selenophosphate synthetase  40.91 
 
 		 347 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000766912  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2049  selenophosphate synthetase  40.91 
 
 		 347 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25484  normal  0.757262 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2019  selenophosphate synthetase  40.62 
 
 		 347 aa  246  4e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1427  selenophosphate synthetase  40.62 
 
 		 347 aa  246  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000127521  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2484  selenophosphate synthetase  40.62 
 
 		 347 aa  246  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00104614  normal  0.288495 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1868  selenophosphate synthetase  40.62 
 
 		 347 aa  246  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000994537  decreased coverage  0.00000520996 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  43.59 
 
 		 321 aa  246  4e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  44.34 
 
 		 314 aa  245  8e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1345  selenide, water dikinase  40.23 
 
 		 354 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0689  selenide, water dikinase  46.52 
 
 		 328 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00779233  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1987  selenophosphate synthetase  40.34 
 
 		 347 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00136088  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1727  selenophosphate synthetase  40 
 
 		 355 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000666487 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3267  selenide, water dikinase  39.94 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1683  selenophosphate synthetase  40.06 
 
 		 347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3860  selenophosphate synthase  40.84 
 
 		 357 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4627  selenophosphate synthetase  42.06 
 
 		 353 aa  242  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173949  normal  0.0779363 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0666  selenide, water dikinase  41.91 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  40.36 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  41.46 
 
 		 351 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  40.18 
 
 		 357 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  40.18 
 
 		 357 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  38.51 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  39.51 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  40.67 
 
 		 352 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  40.18 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  40.18 
 
 		 357 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  39.37 
 
 		 354 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  40.8 
 
 		 352 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  39.37 
 
 		 357 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  38.75 
 
 		 347 aa  236  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3330  selenide, water dikinase  41.5 
 
 		 348 aa  236  4e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.456858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5279  selenide, water dikinase  44.74 
 
 		 335 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  38.73 
 
 		 353 aa  236  6e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  40.49 
 
 		 352 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  40.52 
 
 		 346 aa  236  6e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  39.58 
 
 		 357 aa  235  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>