70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0539 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0539  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 391 aa  797    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  28.97 
 
 		 423 aa  166  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  23.02 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  24.32 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  22.56 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1472  ATPase-like protein  51.67 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0862565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1704  hypothetical protein  87.1 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.766621  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  25.44 
 
 		 382 aa  53.5  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  40.38 
 
 		 392 aa  53.1  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  23.08 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  22.7 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  22.03 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  23.35 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  21.48 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  21.93 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  22.08 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  22.08 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  34.92 
 
 		 410 aa  50.4  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  32 
 
 		 411 aa  50.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  42.31 
 
 		 386 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  44 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  28.26 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  22.76 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  21.04 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  29.51 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  40.38 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  43.18 
 
 		 367 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  38.46 
 
 		 395 aa  47.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  43.18 
 
 		 367 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  34.43 
 
 		 362 aa  47  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  38.46 
 
 		 390 aa  46.6  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  33.33 
 
 		 385 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  31.67 
 
 		 382 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  38.46 
 
 		 390 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  38.46 
 
 		 390 aa  46.6  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  38.46 
 
 		 390 aa  46.2  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  38.46 
 
 		 390 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  26.23 
 
 		 584 aa  46.2  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  38.46 
 
 		 390 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  34.62 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0748  hypothetical protein  34.43 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  40 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  38.81 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  36.54 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  40.38 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  29.41 
 
 		 483 aa  46.2  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  23.74 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  36 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  38.81 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1413  hypothetical protein  40.74 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0112  hypothetical protein  24.14 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  27.2 
 
 		 409 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  38.46 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  38.46 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  38.46 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  39.58 
 
 		 573 aa  44.7  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  38.46 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  35.48 
 
 		 388 aa  43.9  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  37.5 
 
 		 357 aa  43.9  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0003  DNA replication and repair protein RecF  44.68 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  36.54 
 
 		 393 aa  43.5  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  32.26 
 
 		 381 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  38.46 
 
 		 385 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  44.23 
 
 		 365 aa  43.1  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  38.46 
 
 		 387 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  38.46 
 
 		 387 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  34 
 
 		 384 aa  43.1  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  32.69 
 
 		 387 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  37.7 
 
 		 377 aa  42.7  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  32.69 
 
 		 387 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>