74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0425 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0425  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 197 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3274  HEAT repeat-containing PBS lyase  58.06 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000494855  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0133  HEAT repeat-containing PBS lyase  48.19 
 
 		 197 aa  161  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000842725  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0288  HEAT repeat-containing PBS lyase  48.69 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4092  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  51.69 
 
 		 178 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3997  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  49.37 
 
 		 168 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  36.65 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  31.22 
 
 		 1148 aa  87  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.49 
 
 		 1343 aa  85.9  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  28.95 
 
 		 593 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1094 aa  62  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.79 
 
 		 395 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  31.79 
 
 		 395 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  33.33 
 
 		 501 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.61 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.63 
 
 		 1438 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.16 
 
 		 399 aa  55.8  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  27.81 
 
 		 546 aa  55.1  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.57 
 
 		 490 aa  55.1  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.31 
 
 		 1181 aa  55.1  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  31.53 
 
 		 838 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.78 
 
 		 510 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.48 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  24.52 
 
 		 958 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  26.2 
 
 		 644 aa  52.8  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.89 
 
 		 395 aa  52.8  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.73 
 
 		 670 aa  52  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.03 
 
 		 666 aa  52  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  25.13 
 
 		 1328 aa  51.6  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.51 
 
 		 285 aa  51.2  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  25.4 
 
 		 493 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2596  Scaffold protein Nfu/NifU  35.16 
 
 		 381 aa  48.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.14 
 
 		 1412 aa  47.8  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0578  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.89 
 
 		 492 aa  47.8  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.94571  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  31.4 
 
 		 959 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.95 
 
 		 223 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.43 
 
 		 320 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  27.37 
 
 		 319 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  30.11 
 
 		 320 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  30.16 
 
 		 773 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.34 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4537  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.83 
 
 		 400 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.77 
 
 		 370 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.54 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.67 
 
 		 408 aa  47  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.9 
 
 		 1139 aa  46.6  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  30.23 
 
 		 886 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.19 
 
 		 642 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3276  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.86 
 
 		 557 aa  45.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257764  normal  0.485312 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  32.59 
 
 		 1133 aa  45.4  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2515  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.12 
 
 		 101 aa  45.1  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.808601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0029  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.67 
 
 		 264 aa  44.7  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.158294  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0156  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.58 
 
 		 284 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00291683 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.03 
 
 		 641 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2754  HEAT domain containing protein  28.4 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202465  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.14 
 
 		 321 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.46 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.82 
 
 		 831 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2190  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.62 
 
 		 411 aa  42.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.42 
 
 		 668 aa  42.4  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.9 
 
 		 667 aa  42  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  25 
 
 		 643 aa  42  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.67 
 
 		 325 aa  42  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.58 
 
 		 313 aa  42  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  28.3 
 
 		 299 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2123  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.31 
 
 		 635 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.209503  normal  0.0989309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1224 aa  41.6  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4450  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.22 
 
 		 438 aa  41.6  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.03 
 
 		 524 aa  41.6  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1681  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.58 
 
 		 388 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.741729 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.47 
 
 		 220 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2563  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.51 
 
 		 220 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2001  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.28 
 
 		 334 aa  41.2  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>