56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2491 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2491  UspA domain protein  100 
 
 		 273 aa  553  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2161  UspA domain-containing protein  53.99 
 
 		 280 aa  279  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.551312  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2089  UspA domain protein  55.47 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0297  hypothetical protein  52.01 
 
 		 273 aa  263  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164486 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2124  hypothetical protein  44.93 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00183225 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1921  UspA domain protein  42.03 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0824  UspA domain protein  41.21 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0929025  normal  0.400518 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1928  hypothetical protein  32.97 
 
 		 263 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.101794  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1016  UspA domain-containing protein  33.49 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  33.18 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0741  hypothetical protein  45.83 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560909 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1516  UspA domain-containing protein  27.5 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.360246  normal  0.6745 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1718  UspA domain-containing protein  27.54 
 
 		 281 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  28.48 
 
 		 164 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  28.42 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 147 aa  50.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  32.68 
 
 		 157 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  32.97 
 
 		 288 aa  49.7  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  27.15 
 
 		 150 aa  48.9  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  28.89 
 
 		 294 aa  48.9  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  27.15 
 
 		 145 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  28.75 
 
 		 150 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 		 141 aa  48.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 145 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  27.15 
 
 		 145 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  32.05 
 
 		 157 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  26.62 
 
 		 145 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 156 aa  46.6  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  26.35 
 
 		 142 aa  45.8  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  25.41 
 
 		 283 aa  45.8  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  30.71 
 
 		 301 aa  45.8  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  30.2 
 
 		 157 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  25.64 
 
 		 157 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  26.99 
 
 		 161 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  34.43 
 
 		 309 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  29.03 
 
 		 153 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2888  UspA domain protein  31.58 
 
 		 141 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  31.62 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  27.62 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  37.04 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  32.59 
 
 		 147 aa  43.9  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  28.66 
 
 		 147 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  30.17 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  31.64 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  29.38 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  30 
 
 		 147 aa  43.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  24.68 
 
 		 145 aa  42.7  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  29.95 
 
 		 271 aa  42.7  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  29.03 
 
 		 139 aa  42.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  30.83 
 
 		 415 aa  42.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  23.41 
 
 		 282 aa  42.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  27.63 
 
 		 147 aa  42.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  29.3 
 
 		 153 aa  42  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0990  hypothetical protein  27.96 
 
 		 277 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1008  UspA domain-containing protein  27.96 
 
 		 277 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1018  UspA domain-containing protein  27.96 
 
 		 277 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.921974 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>