225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2142 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2142  protein of unknown function DUF179  100 
 
 		 187 aa  383  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0885  hypothetical protein  82.89 
 
 		 187 aa  338  2.9999999999999998e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0777  protein of unknown function DUF179  78.07 
 
 		 187 aa  325  2.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1601  hypothetical protein  76.47 
 
 		 188 aa  312  1.9999999999999998e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0943857  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0637  hypothetical protein  75.94 
 
 		 189 aa  308  4e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.500132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0776  protein of unknown function DUF179  71.12 
 
 		 187 aa  294  6e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1688  protein of unknown function DUF179  70.05 
 
 		 187 aa  290  8e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4074  protein of unknown function DUF179  39.23 
 
 		 186 aa  156  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499752  hitchhiker  0.00807045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0197  protein of unknown function DUF179  42.39 
 
 		 183 aa  154  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7071  protein of unknown function DUF179  38.67 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3626  protein of unknown function DUF179  35.36 
 
 		 186 aa  147  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0140  hypothetical protein  38.04 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1896  protein of unknown function DUF179  35.96 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.56007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1773  transcriptional regulator  36.26 
 
 		 182 aa  131  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09628  putative transcriptional regulator  37.7 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.770481  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0483  hypothetical protein  36.67 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.195339  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3774  hypothetical protein  35.56 
 
 		 198 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0367  protein of unknown function DUF179  33.67 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3882  protein of unknown function DUF179  35.23 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1432  protein of unknown function DUF179  33.52 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.914919  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1704  hypothetical protein  32.42 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.77077  hitchhiker  0.00529814 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0726  hypothetical protein  29.94 
 
 		 186 aa  101  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58244  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03293  Transcription regulator  31.93 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.856515  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0090  protein of unknown function DUF179  32.63 
 
 		 182 aa  95.5  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0924  hypothetical protein  32.49 
 
 		 193 aa  95.5  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.127262  normal  0.648252 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88895  predicted protein  34.44 
 
 		 288 aa  95.5  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0380911  hitchhiker  0.00603627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1710  hypothetical protein  31.44 
 
 		 192 aa  94.4  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2389  hypothetical protein  35.82 
 
 		 198 aa  94.4  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.468382  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03574  hypothetical protein  33.53 
 
 		 189 aa  92.8  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0567  hypothetical protein  33.55 
 
 		 190 aa  91.7  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0331  protein of unknown function DUF179  31.84 
 
 		 198 aa  91.7  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502019  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4027  hypothetical protein  31.46 
 
 		 187 aa  91.7  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375113  hitchhiker  0.00119286 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0619  hypothetical protein  33.55 
 
 		 190 aa  91.3  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39570  hypothetical protein  31.91 
 
 		 198 aa  91.3  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.336935 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0675  hypothetical protein  31.74 
 
 		 190 aa  90.1  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02000  hypothetical protein  32.3 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1153  hypothetical protein  34.13 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2743  hypothetical protein  31.18 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5076  protein of unknown function DUF179  28.87 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48166  predicted protein  31.12 
 
 		 393 aa  89.7  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118816  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0705  hypothetical protein  31.07 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0850  hypothetical protein  29.63 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0019  hypothetical protein  30.59 
 
 		 200 aa  89.4  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2472  putative transcriptional regulator  29.73 
 
 		 189 aa  88.6  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.888778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2659  hypothetical protein  30.81 
 
 		 184 aa  89  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.679405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0705  hypothetical protein  30.59 
 
 		 193 aa  88.6  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0999  hypothetical protein  30.81 
 
 		 184 aa  88.6  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5633  protein of unknown function DUF179  31.94 
 
 		 146 aa  88.6  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591685  normal  0.939371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6057  hypothetical protein  29.05 
 
 		 201 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229198  normal  0.563539 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002461  hypothetical protein  32.52 
 
 		 174 aa  88.6  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0532  hypothetical protein  30.17 
 
 		 201 aa  88.2  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1237  hypothetical protein  29.14 
 
 		 186 aa  87.8  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.198149 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1179  protein of unknown function DUF179  29.35 
 
 		 184 aa  87.8  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0188247  normal  0.235234 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5392  hypothetical protein  27.32 
 
 		 204 aa  87.4  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.891404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5481  hypothetical protein  27.32 
 
 		 204 aa  87.4  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478764  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5768  hypothetical protein  27.32 
 
 		 204 aa  87.4  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.802117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3962  hypothetical protein  31.74 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000136745 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0226  hypothetical protein  29.65 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0738315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1286  hypothetical protein  29.71 
 
 		 197 aa  86.7  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7076  hypothetical protein  31.67 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3346  hypothetical protein  30 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0469  hypothetical protein  32.14 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3811  hypothetical protein  32.76 
 
 		 221 aa  85.9  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2674  hypothetical protein  30.29 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000779921  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10037  hypothetical protein  26.29 
 
 		 202 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.739012 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1356  protein of unknown function DUF179  29.89 
 
 		 216 aa  85.5  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0868  hypothetical protein  32.76 
 
 		 192 aa  85.5  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0761346 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0837  hypothetical protein  31.06 
 
 		 187 aa  85.1  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.01957  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0718  hypothetical protein  32.95 
 
 		 205 aa  85.1  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236313 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1132  hypothetical protein  28.33 
 
 		 190 aa  85.1  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3712  hypothetical protein  31.36 
 
 		 187 aa  85.1  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.081023  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0835  hypothetical protein  31.06 
 
 		 187 aa  85.1  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3695  protein of unknown function DUF179  33.33 
 
 		 191 aa  85.5  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0940  hypothetical protein  29.19 
 
 		 188 aa  84.7  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335136  normal  0.481513 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0544  hypothetical protein  28.81 
 
 		 197 aa  84.7  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0299176  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1199  hypothetical protein  29.17 
 
 		 187 aa  84.7  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000139258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1270  hypothetical protein  29.17 
 
 		 187 aa  84.7  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000905389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1200  hypothetical protein  29.17 
 
 		 187 aa  84.7  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0314769  normal  0.527879 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0923  hypothetical protein  30.6 
 
 		 196 aa  84.3  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3341  hypothetical protein  31.06 
 
 		 187 aa  84.3  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3893  hypothetical protein  31.82 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1289  hypothetical protein  32.43 
 
 		 191 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1337  hypothetical protein  28.41 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0174957  hitchhiker  0.000402511 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3637  argininosuccinate lyase  28.02 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.755097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0983  hypothetical protein  32.02 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1428  hypothetical protein  32.72 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1069  hypothetical protein  28.57 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.848418  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2681  hypothetical protein  26.82 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0732107  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1361  hypothetical protein  32.1 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6933  protein of unknown function DUF179  31.72 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1144  hypothetical protein  28 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.496045  normal  0.0336297 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2910  protein of unknown function DUF179  27.17 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3962  hypothetical protein  27.43 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3910  hypothetical protein  30.77 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0230557  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5037  hypothetical protein  28.75 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2327  hypothetical protein  31.58 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0686759 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0987  hypothetical protein  30.6 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1344  protein of unknown function DUF179  26.82 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0111665  hitchhiker  0.000000000584431 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1997  hypothetical protein  32.08 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.938009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3170  hypothetical protein  32.08 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>