146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0807 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0807  peptidase A24A prepilin type IV  100 
 
 		 292 aa  567  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0652  hypothetical protein  58.92 
 
 		 246 aa  237  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0792  Type II secretory pathway prepilin signal peptidase  61.67 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.83713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  31.02 
 
 		 289 aa  87  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2002  leader peptidase PilD  33.66 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00673434  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  29.82 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  37.41 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2632  type IV prepilin peptidase PilD (type IV-A prepilin peptidase PilD) (leader peptidase PilD)  36.31 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  38.41 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0843  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.32 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120524  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  36.88 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  39.44 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3682  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  41.22 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3178  Prepilin peptidase  36.23 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3259  prepilin peptidase  33.77 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000482568  hitchhiker  0.0000000000000925794 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  34.97 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.97 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0963  type IV prepilin peptidase  33.77 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1014  prepilin peptidase  33.77 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  36.5 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  38.57 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.16 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  35.77 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1481  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  29.22 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  30 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1527  peptidase A24A domain protein  35.07 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.295629 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  31.47 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  37.68 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  33.33 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.36 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0184  peptidase A24A, prepilin type IV  32.17 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0397814  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  35.71 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  37.23 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  37.68 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2029  peptidase A24A domain-containing protein  36.5 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250506  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4449  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme PilD  37.67 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  37.65 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  37.14 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1309  Prepilin peptidase  38.81 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  39.39 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2107  prepilin peptidase  36.5 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  37.14 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  30.28 
 
 		 259 aa  57  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  28.17 
 
 		 274 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1288  putative Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase  34.38 
 
 		 163 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0693178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  36.96 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  28.38 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  26.76 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  37.12 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1480  Prepilin peptidase  37.69 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0200  peptidase A24A prepilin type IV  32.12 
 
 		 166 aa  55.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.267087 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  29.86 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3454  Prepilin peptidase  40.2 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110375  hitchhiker  0.0033362 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.09 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  34.51 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  41.41 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3072  Prepilin peptidase  37.25 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.373458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  33.33 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0245  type 4 prepilin peptidase PilD  31.3 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3342  prepilin peptidase  32.39 
 
 		 300 aa  53.1  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.501054  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  33.97 
 
 		 308 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08281  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  28.32 
 
 		 267 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0910585  hitchhiker  0.0000457532 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  34.81 
 
 		 304 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  33.75 
 
 		 297 aa  53.1  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  33.97 
 
 		 308 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3661  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  35.34 
 
 		 303 aa  52.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5019  peptidase A24A prepilin type IV  37.14 
 
 		 246 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  31.3 
 
 		 286 aa  52.8  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0094  prepilin peptidase  36.09 
 
 		 303 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0576  prepilin peptidase  36.09 
 
 		 303 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251238  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4241  prepilin peptidase  32.12 
 
 		 287 aa  52.4  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  36.36 
 
 		 289 aa  52.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  36.09 
 
 		 303 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  32.93 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2081  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  37.96 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587572 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2707  Prepilin peptidase  36.08 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0924  type IV pilus prepilin peptidase PilD  36.43 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.39 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  34.53 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2533  type IV pilus prepilin peptidase PilD  41.57 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0796  prepilin peptidase  35.71 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3529  peptidase A24 N- domain-containing protein  41.57 
 
 		 351 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1134  type IV pilus prepilin peptidase PilD  41.49 
 
 		 351 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0013  Peptidase A24 N- domain protein  37.5 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.846368 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0455  type IV pilus prepilin peptidase PilD  41.57 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1313  type IV pilus prepilin peptidase PilD  41.57 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3508  type IV prepilin leader peptidase  41.57 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3249  type IV pilus prepilin peptidase PilD  41.57 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  25.69 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1027  peptidase A24A domain-containing protein  26.39 
 
 		 240 aa  50.8  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.773434  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  30.05 
 
 		 296 aa  50.4  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3533  type IV prepilin leader peptidase  41.57 
 
 		 304 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0149  peptidase A24A domain-containing protein  35.61 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0671  peptidase A24A domain protein  36.56 
 
 		 299 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3785  prepilin peptidase  34.75 
 
 		 308 aa  49.7  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  30.86 
 
 		 296 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2902  peptidase A24A prepilin type IV  36.36 
 
 		 233 aa  49.7  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4222  Prepilin peptidase  40.2 
 
 		 321 aa  48.9  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0861  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.27 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  28.67 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>