287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0330 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2189  glycogen synthase  75.61 
 
 		 489 aa  798    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0220  glycogen synthase  72.07 
 
 		 489 aa  746    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1808  glycogen synthase  66.74 
 
 		 489 aa  698    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0330  glycogen synthase  100 
 
 		 489 aa  1013    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0476444  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2377  glycogen synthase  77.71 
 
 		 489 aa  797    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.698809  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2020  glycogen synthase  60 
 
 		 491 aa  627  1e-178  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0349477 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2246  glycogen synthase  58.49 
 
 		 491 aa  601  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1457  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  36.89 
 
 		 480 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0282  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  35.17 
 
 		 480 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  36.18 
 
 		 587 aa  309  6.999999999999999e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1322  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.92 
 
 		 500 aa  298  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.56 
 
 		 486 aa  296  4e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.243503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0032  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.56 
 
 		 486 aa  296  4e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464637  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06900  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.2 
 
 		 478 aa  296  6e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0451  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.12 
 
 		 496 aa  295  9e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3257  glycogen synthase  33.2 
 
 		 484 aa  295  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0658305  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1334  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.6 
 
 		 481 aa  291  1e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000402724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5025  glycogen synthase  33.74 
 
 		 476 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0241  glycogen synthase  32.53 
 
 		 480 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0326908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4996  glycogen synthase  33.2 
 
 		 476 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4758  glycogen synthase  33 
 
 		 498 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5120  glycogen synthase  32.93 
 
 		 476 aa  286  7e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5006  glycogen synthase  33 
 
 		 480 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1284  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  32.6 
 
 		 488 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000203443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0821  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.33 
 
 		 482 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.173093 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4618  glycogen synthase  33.33 
 
 		 498 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4707  glycogen synthase  32.53 
 
 		 480 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3175  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  32.51 
 
 		 484 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.182797  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4977  glycogen synthase  33 
 
 		 498 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0082  glycogen synthase  31.98 
 
 		 477 aa  282  9e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2954  glycogen synthase  31.77 
 
 		 484 aa  281  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4596  glycogen synthase  33 
 
 		 498 aa  280  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3196  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  35.32 
 
 		 467 aa  280  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0077  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  32.79 
 
 		 481 aa  280  4e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0139  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.2 
 
 		 475 aa  279  7e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.959612  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3400  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.88 
 
 		 486 aa  279  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.628192  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1936  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  33.47 
 
 		 487 aa  277  3e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  hitchhiker  0.00000030545 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3463  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.88 
 
 		 486 aa  277  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3501  glycogen synthase  33.06 
 
 		 478 aa  276  7e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1839  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  29.76 
 
 		 503 aa  275  9e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3349  glycogen synthase  33.47 
 
 		 484 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0561  glycogen synthase  32.65 
 
 		 485 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0858  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  32.16 
 
 		 484 aa  272  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.335238  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0388  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.85 
 
 		 507 aa  270  4e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2113  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  33.82 
 
 		 488 aa  270  5.9999999999999995e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437191  unclonable  0.0000100698 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0142  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  32.92 
 
 		 475 aa  269  7e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1696  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  32.6 
 
 		 497 aa  269  7e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0135  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  32.92 
 
 		 475 aa  269  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.990604  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2496  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  32.04 
 
 		 478 aa  268  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00278  glycogen synthase  32.92 
 
 		 474 aa  267  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0293  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  30.5 
 
 		 506 aa  266  8e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2664  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.38 
 
 		 480 aa  264  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.381394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0874  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.6 
 
 		 483 aa  264  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.13432  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0707  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.3 
 
 		 502 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0856  glycogen synthase  30.25 
 
 		 476 aa  260  3e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00244208  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2145  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.26 
 
 		 473 aa  260  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.619939  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0555  glycogen synthase  32.59 
 
 		 478 aa  260  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1476  glycogen synthase  33.33 
 
 		 493 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1888  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.06 
 
 		 490 aa  260  5.0000000000000005e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.590252  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0567  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.35 
 
 		 518 aa  259  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0580  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.51 
 
 		 534 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000776916 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0153  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  33.13 
 
 		 477 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0771  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.71 
 
 		 491 aa  257  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1521  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  31.24 
 
 		 481 aa  254  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0870  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  29.3 
 
 		 477 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.758112  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2787  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.05 
 
 		 509 aa  253  6e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1982  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.3 
 
 		 489 aa  251  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4501  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.92 
 
 		 460 aa  250  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1221  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.69 
 
 		 482 aa  250  4e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.085382  normal  0.2089 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0306  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.01 
 
 		 485 aa  248  1e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.467404  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0726  glycogen synthase  31.93 
 
 		 492 aa  249  1e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1081  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.57 
 
 		 504 aa  248  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1023  glycogen synthase  29.58 
 
 		 501 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3035  glycogen synthase  32.27 
 
 		 488 aa  246  9e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1047  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.2 
 
 		 499 aa  245  9.999999999999999e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1134  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.66 
 
 		 494 aa  245  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.658418  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1472  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  28.74 
 
 		 499 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  30.91 
 
 		 488 aa  243  3.9999999999999997e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0814  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.63 
 
 		 488 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.598674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17040  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  32.92 
 
 		 491 aa  243  6e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0512  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  30.92 
 
 		 494 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1798  glycogen synthase  30.4 
 
 		 486 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2147  glycogen synthase  31.16 
 
 		 460 aa  240  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0541405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1890  glycogen synthase  30.24 
 
 		 487 aa  240  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.601172 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2120  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.05 
 
 		 491 aa  239  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.475623  normal  0.0408655 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5314  glycogen synthase  31.94 
 
 		 533 aa  239  9e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0542  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.22 
 
 		 490 aa  237  4e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1241  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.12 
 
 		 476 aa  237  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0998  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  30.39 
 
 		 489 aa  237  4e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2057  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  32.14 
 
 		 498 aa  236  6e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0784111  normal  0.49835 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0841  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.8 
 
 		 488 aa  236  6e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0251481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4775  glycogen synthase  30.06 
 
 		 472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2286  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.66 
 
 		 487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0256  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  30.58 
 
 		 497 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0015526  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0940  glycogen synthase  30.45 
 
 		 556 aa  234  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1279  glycogen synthase  31.26 
 
 		 529 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0781  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  31.39 
 
 		 463 aa  233  5e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0080  glycogen synthase  29.34 
 
 		 476 aa  233  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572578  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1949  glycogen synthase  29.92 
 
 		 477 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.327128 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1128  glycogen synthase  30.93 
 
 		 477 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>