More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3584 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3584  peptidase M23B  100 
 
 		 174 aa  352  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02339  M23 peptidase domain protein  66.43 
 
 		 238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213861  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3011  Peptidase M23  68.84 
 
 		 223 aa  197  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0127254 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3804  peptidase M23B  51.3 
 
 		 199 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.019155 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0146  Peptidase M23  45.71 
 
 		 230 aa  106  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6234  Peptidase M23  44.17 
 
 		 446 aa  100  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3409  Peptidase M23  45.76 
 
 		 183 aa  98.6  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2227  peptidase M23B  46.15 
 
 		 172 aa  90.5  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4508  Peptidase M23  37.12 
 
 		 392 aa  86.3  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1360  Peptidase M23  37.16 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01485  peptidase  33.56 
 
 		 377 aa  81.6  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01987  peptidase  41.8 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3990  peptidase M23B  36.55 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0435  Peptidase M23  39.55 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  44.23 
 
 		 503 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2717  Peptidase M23  36.62 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153286  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  43.16 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1921  metallopeptidase peptidase  38.89 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318807 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  43.22 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2214  peptidase M23B  38.89 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.250038 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0489  peptidase M23B  40 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  38.39 
 
 		 402 aa  75.1  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0464  peptidase M23B  44.79 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1351  Peptidase M23  44.79 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.749113  hitchhiker  0.00315116 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  43.16 
 
 		 390 aa  70.9  0.000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  43.86 
 
 		 523 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  42.11 
 
 		 441 aa  69.7  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  31.21 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  36.49 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  37.21 
 
 		 420 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  38.1 
 
 		 425 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  37.21 
 
 		 400 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  37.21 
 
 		 421 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  37.21 
 
 		 421 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  36.04 
 
 		 430 aa  67.8  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  41.24 
 
 		 465 aa  67.4  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  44.68 
 
 		 385 aa  67.4  0.00000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  36.7 
 
 		 353 aa  67  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  41.49 
 
 		 477 aa  67  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  41.49 
 
 		 477 aa  67.4  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  41.24 
 
 		 439 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  37.39 
 
 		 646 aa  67  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  40.17 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0898  peptidase M23B  37.93 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.206308 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  38.05 
 
 		 527 aa  65.5  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  37.78 
 
 		 473 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  37.78 
 
 		 475 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  38.3 
 
 		 479 aa  65.5  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  37.78 
 
 		 473 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  40 
 
 		 298 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5231  peptidase M23B  41 
 
 		 298 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.347786  normal  0.103229 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5110  M24/M37 family peptidase  35.29 
 
 		 327 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  37.78 
 
 		 472 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4841  M24/M37 family peptidase  35.29 
 
 		 333 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.024057  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  38.74 
 
 		 389 aa  65.1  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4683  M24/M37 family peptidase  35.29 
 
 		 333 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5206  M23/37 family peptidase  35.29 
 
 		 327 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5115  peptidase, M23/M37 family  35.29 
 
 		 327 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000714252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5077  peptidase, M23/M37 family  35.29 
 
 		 327 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  33.91 
 
 		 741 aa  65.1  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  37.3 
 
 		 425 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4699  M24/M37 family peptidase  35.29 
 
 		 327 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0776348  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4797  peptidase M23B  35.29 
 
 		 327 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0231137  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5117  peptidase, M23/M37 family  35.29 
 
 		 327 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00753294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  35.54 
 
 		 464 aa  64.7  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0123  peptidase, M23/M37 family  35.29 
 
 		 327 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0859179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  41.41 
 
 		 319 aa  64.3  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  32.61 
 
 		 472 aa  64.3  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  38.46 
 
 		 468 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.04 
 
 		 441 aa  64.3  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  38.14 
 
 		 533 aa  63.9  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  39.17 
 
 		 376 aa  64.3  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5323  M24/M37 family peptidase  40 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  32.48 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  35.9 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  40.91 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3569  peptidase M23B  34.56 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3052  Peptidase M23  34.68 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  39.39 
 
 		 517 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  34.68 
 
 		 651 aa  63.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  34.68 
 
 		 651 aa  63.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  37.89 
 
 		 475 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2907  Peptidase M23  33.59 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  35.71 
 
 		 438 aa  63.2  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0504  peptidase M23B  40.22 
 
 		 419 aa  63.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  35.9 
 
 		 453 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  34.31 
 
 		 490 aa  63.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  38.71 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  36.94 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1433  peptidase M23B  35.24 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.484783  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  37.89 
 
 		 569 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  41.49 
 
 		 386 aa  62.4  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  34.29 
 
 		 480 aa  62.4  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  37.5 
 
 		 468 aa  62.4  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  36.96 
 
 		 475 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  38.05 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  42.55 
 
 		 386 aa  62.8  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  38.95 
 
 		 513 aa  62.4  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  37.89 
 
 		 474 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0798  Peptidase M23  46.81 
 
 		 281 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>