55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1458 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  100 
 
 		 480 aa  944    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0233  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 		 457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  38.18 
 
 		 422 aa  298  2e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 459 aa  209  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 459 aa  207  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 454 aa  193  5e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 450 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 446 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 446 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  22.93 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 462 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 453 aa  106  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  23.78 
 
 		 470 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 504 aa  102  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 531 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 427 aa  87.8  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  21.41 
 
 		 513 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  21.29 
 
 		 471 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  25.78 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  21.8 
 
 		 468 aa  81.6  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  24.23 
 
 		 474 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  23.26 
 
 		 474 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  23.98 
 
 		 474 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  24.31 
 
 		 491 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0793  major facilitator transporter  20.57 
 
 		 482 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 495 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  25.53 
 
 		 461 aa  73.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 472 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  25.06 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1907  major facilitator transporter  22.57 
 
 		 469 aa  70.1  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000193036  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 472 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 482 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 472 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  23.55 
 
 		 471 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  22.7 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  23.86 
 
 		 476 aa  63.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2212  hypothetical protein  23.98 
 
 		 490 aa  59.7  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.814869  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5604  major facilitator superfamily MFS_1  20.92 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.638903  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  22.88 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  22.37 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  20.83 
 
 		 408 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1026  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 407 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1791  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 420 aa  46.6  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  21.15 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  22.92 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 441 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>