More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1046 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0688  ABC transporter related  59.37 
 
 
559 aa  657    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1046  ABC transporter related  100 
 
 
554 aa  1107    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1437  ABC transporter related protein  31.72 
 
 
552 aa  270  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0343  ABC transporter related  28.73 
 
 
544 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0501517  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  28.84 
 
 
594 aa  230  6e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  28.49 
 
 
578 aa  225  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  29.1 
 
 
597 aa  221  3e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  29.29 
 
 
581 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  29.1 
 
 
597 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  30.19 
 
 
580 aa  217  5e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.54 
 
 
600 aa  216  8e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  24.82 
 
 
721 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  26.41 
 
 
741 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  26.59 
 
 
581 aa  212  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  27.19 
 
 
720 aa  213  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2258  type I secretion system ATPase  28.89 
 
 
712 aa  212  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  26.23 
 
 
739 aa  210  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0591  ABC transporter-related protein  29.76 
 
 
566 aa  210  5e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  28.71 
 
 
712 aa  207  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2002  type I secretion system ATPase  28.71 
 
 
712 aa  206  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.99 
 
 
598 aa  206  8e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  26.84 
 
 
582 aa  206  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.84 
 
 
582 aa  206  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.84 
 
 
582 aa  206  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.61 
 
 
598 aa  206  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.84 
 
 
582 aa  206  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.84 
 
 
582 aa  206  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  26.79 
 
 
631 aa  206  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.84 
 
 
582 aa  206  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  29.31 
 
 
727 aa  205  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  26.84 
 
 
582 aa  206  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.84 
 
 
582 aa  206  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.84 
 
 
582 aa  206  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  26.34 
 
 
602 aa  205  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  28.98 
 
 
617 aa  204  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.61 
 
 
598 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.22 
 
 
582 aa  204  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.22 
 
 
582 aa  204  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.22 
 
 
582 aa  204  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.22 
 
 
582 aa  204  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.22 
 
 
582 aa  204  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.55 
 
 
581 aa  203  7e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.61 
 
 
598 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  27.09 
 
 
582 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  28.78 
 
 
651 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  25.47 
 
 
585 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.21 
 
 
637 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.72 
 
 
671 aa  201  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.77 
 
 
602 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  27.21 
 
 
636 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  25.48 
 
 
595 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.48 
 
 
597 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  28.84 
 
 
573 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  29.79 
 
 
618 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  25.36 
 
 
618 aa  200  7e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  28.08 
 
 
588 aa  200  7e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.84 
 
 
637 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  27.92 
 
 
747 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  27.66 
 
 
1040 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.03 
 
 
582 aa  198  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  25.99 
 
 
592 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  26.92 
 
 
614 aa  197  5.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  27.59 
 
 
601 aa  197  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  27.55 
 
 
589 aa  197  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  26.64 
 
 
582 aa  197  6e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  27.72 
 
 
598 aa  197  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  26.5 
 
 
600 aa  196  7e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  27.6 
 
 
598 aa  196  8.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  28.51 
 
 
582 aa  196  9e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  25.48 
 
 
587 aa  196  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  27.47 
 
 
556 aa  196  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  26.06 
 
 
627 aa  196  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  26.06 
 
 
597 aa  196  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  28.15 
 
 
607 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2199  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.39 
 
 
600 aa  196  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  27.72 
 
 
605 aa  195  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.28 
 
 
586 aa  195  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  24.62 
 
 
579 aa  194  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  25.18 
 
 
717 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1274  ABC transporter related protein  26.75 
 
 
572 aa  194  4e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3379  ABC transporter transmembrane region  25.98 
 
 
646 aa  194  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  27.33 
 
 
727 aa  194  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1091  ABC transporter related  26.53 
 
 
870 aa  194  5e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  30.65 
 
 
716 aa  194  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.58 
 
 
634 aa  193  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  28.87 
 
 
598 aa  193  6e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  29.57 
 
 
571 aa  193  6e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0787  lipid export ABC transport protein  27.67 
 
 
572 aa  193  7e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  29.81 
 
 
566 aa  193  9e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  25.67 
 
 
622 aa  193  9e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.09 
 
 
586 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  28.22 
 
 
628 aa  192  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  24.1 
 
 
638 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1056  putative toxin secretion transporter  28.96 
 
 
719 aa  192  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  27.77 
 
 
598 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  27.77 
 
 
598 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  24.44 
 
 
571 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.77 
 
 
598 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  28.71 
 
 
1018 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0807  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.36 
 
 
605 aa  192  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>