More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0546 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0546  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  619  1e-176  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1566  hypothetical protein  48.01 
 
 		 321 aa  280  3e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1632  hypothetical protein  48.01 
 
 		 321 aa  280  3e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1519  hypothetical protein  46.31 
 
 		 331 aa  278  1e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1482  hypothetical protein  37 
 
 		 324 aa  209  4e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  31.7 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  31.7 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  31.7 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  31.7 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  23.31 
 
 		 383 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  31.7 
 
 		 361 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  31.7 
 
 		 361 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  30.29 
 
 		 371 aa  89.7  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  30.49 
 
 		 361 aa  89.4  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  30.8 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  30.8 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  30.8 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  30.49 
 
 		 361 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  26.62 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  29.18 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  29.91 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  25.39 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  28.09 
 
 		 355 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  27.8 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  27.8 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  24.77 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  24.77 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  24.77 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  24.77 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  24.77 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  24.44 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  27.56 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  26.63 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  25.4 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  25.31 
 
 		 345 aa  78.2  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  24.77 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5351  protein of unknown function UPF0118  30.87 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0138969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  25.42 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  27.3 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  25.08 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2806  hypothetical protein  26.9 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.217461  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  23.9 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  33.8 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  28.33 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  25.45 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  24.85 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  24.9 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.75 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  26.95 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  23.27 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  25.4 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  23.27 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  23.27 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  23.27 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  33.58 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1434  hypothetical protein  23.46 
 
 		 338 aa  72.8  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  23.27 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1480  hypothetical protein  23.46 
 
 		 338 aa  72.8  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  23.27 
 
 		 373 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1491  protein of unknown function UPF0118  22.94 
 
 		 340 aa  72.4  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.961051  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2382  membrane protein  23.91 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  27.2 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  27.2 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  26.74 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  29.87 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  24.17 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  24.17 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  24.17 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  24.17 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  24.17 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  25.08 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  25.69 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2311  hypothetical protein  27.98 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  26.19 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  24.37 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  27.42 
 
 		 435 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4216  hypothetical protein  30.34 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.329203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0642  protein of unknown function UPF0118  27.01 
 
 		 390 aa  69.3  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02385  predicted inner membrane protein  23.84 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1176  protein of unknown function UPF0118  23.84 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1183  hypothetical protein  23.84 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2867  putative permease, PerM family  23.84 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.697689  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3715  putative permease, PerM family  23.84 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2627  PerM family permease  23.84 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2775  PerM family permease  23.84 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0215248  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2640  PerM family permease  23.84 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02347  hypothetical protein  23.84 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.106827  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3023  putative permease transmembrane transport protein  28.77 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  22.97 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  23.37 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  25.48 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  25.23 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  23.29 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  29.3 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  23.46 
 
 		 371 aa  67  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3128  putative permease PerM  25.78 
 
 		 354 aa  67  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00611871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1240  putative permease PerM  25.78 
 
 		 354 aa  67  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00935863  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  27.89 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  23.89 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1357  hypothetical protein  25.78 
 
 		 354 aa  67  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>