189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3167 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 98 aa  196  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  69.79 
 
 		 104 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  68.09 
 
 		 104 aa  140  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  68.09 
 
 		 104 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  69.47 
 
 		 104 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  64.58 
 
 		 104 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.68 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21560  hypothetical protein  43.68 
 
 		 104 aa  72  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.47 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.1 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.12 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  49.06 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  37.5 
 
 		 96 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.67 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.54 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  35.53 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  36.36 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.88 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.62 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.88 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.88 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 		 99 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  33.75 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.47 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.98 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.94 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.7 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  44.44 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  38.75 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  45.65 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  38.75 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.18 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0966  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472175  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1803  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  42.86 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.78 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.7 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.26 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.9 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  32.95 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.89 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.72 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0214  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.67 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.189579 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.56 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.47 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.38 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.04 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3835  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 		 101 aa  51.6  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.409935  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  37.1 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  31.82 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.24 
 
 		 96 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  23.53 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5778  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.03 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1296  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.05 
 
 		 102 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0851  hypothetical protein  24.73 
 
 		 98 aa  50.4  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  30.99 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1575  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  36.11 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.66 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.14 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.78 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1910  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.65 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.43 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.62 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  40.82 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2802  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.28 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200278 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4464  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.97 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.293182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.17 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2308  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.68 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.28 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2292  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.28 
 
 		 99 aa  48.9  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  25 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.29 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3005  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.94 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38325  predicted protein  29.35 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.35 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  29.69 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.11 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3201  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.47 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0130262  unclonable  0.0000000000117168 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.82 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3638  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1513  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.289391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2207  hypothetical protein  25 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000589169  hitchhiker  6.1187300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  25 
 
 		 97 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.68 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>