More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1383 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1383  ATPase  100 
 
 
614 aa  1254    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.267423 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0373  ABC transporter-related protein  51.11 
 
 
594 aa  631  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.257292  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  34.92 
 
 
600 aa  382  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0617  ABC transporter related protein  37.48 
 
 
611 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.10554  normal  0.226298 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2172  ABC transporter related  35.86 
 
 
610 aa  363  6e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2355  ABC transporter related  36.73 
 
 
603 aa  360  3e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.916251  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0788  ABC transporter related  36.66 
 
 
600 aa  355  1e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1562  ABC transporter related  35.43 
 
 
605 aa  351  2e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.36588  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2321  ABC transporter related  34.49 
 
 
625 aa  347  4e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.100334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5187  ABC transporter related  35.7 
 
 
585 aa  341  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0523  ABC transporter related  35.94 
 
 
571 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2624  ABC transporter related  34.99 
 
 
596 aa  337  5.999999999999999e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2847  ABC transporter related  35.43 
 
 
586 aa  335  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.682439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2654  ABC transporter related  35.39 
 
 
596 aa  333  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161952  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2068  ABC transporter related  36.53 
 
 
583 aa  331  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561392  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0652  efflux ABC transporter ATP-binding protein  33.62 
 
 
599 aa  329  8e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0177211  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29930  ABC transporter protein  32.48 
 
 
613 aa  322  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0292656  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0122  ABC transporter related  34.13 
 
 
628 aa  320  3e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2527  ABC transporter related protein  35.42 
 
 
599 aa  317  4e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0489223 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3900  ABC transporter related  35.45 
 
 
568 aa  316  7e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1250  ABC transporter, ATP-binding protein/permease, glycan transport  32.23 
 
 
564 aa  311  2e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1312  ATPase  36.14 
 
 
600 aa  311  2.9999999999999997e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.05 
 
 
564 aa  307  5.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2356  ABC transporter related  32.46 
 
 
583 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.64 
 
 
564 aa  299  1e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.22 
 
 
564 aa  296  6e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1117  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.09 
 
 
601 aa  296  7e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0898  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  31.76 
 
 
601 aa  295  1e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4465  ABC transporter related  34.06 
 
 
585 aa  289  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269199 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14091  hypothetical protein  31.68 
 
 
599 aa  289  9e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3273  ABC transporter related  31.22 
 
 
607 aa  268  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1411  ATPase  31.79 
 
 
611 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01101  hypothetical protein  31.62 
 
 
611 aa  260  4e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08650  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter with N-terminal double-glycine peptidase domain  29.88 
 
 
606 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.83944 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00581  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  29.72 
 
 
610 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.779768  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14231  hypothetical protein  29.82 
 
 
586 aa  247  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3683  ATPase  30.89 
 
 
603 aa  246  8e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.3 
 
 
587 aa  244  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01541  hypothetical protein  29.27 
 
 
552 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.29572  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0410  ABC transporter related  29.77 
 
 
610 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.01 
 
 
587 aa  241  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3896  ABC transporter related  31.94 
 
 
626 aa  234  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.227189  normal  0.0393821 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0168  ATPase  29.39 
 
 
612 aa  225  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.334889  normal  0.167658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2397  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.82 
 
 
574 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.894313  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1332  ATPase  28.7 
 
 
576 aa  221  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00148661  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1128  ABC transporter related protein  30.6 
 
 
613 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.05 
 
 
592 aa  220  6e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2002  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.61 
 
 
574 aa  220  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393049  normal  0.619669 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2533  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.33 
 
 
590 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611222  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  31.3 
 
 
592 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0757  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.86 
 
 
594 aa  217  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00726386  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  31.08 
 
 
598 aa  215  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  32.14 
 
 
607 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.22 
 
 
600 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1198  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.9 
 
 
575 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1045  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.9 
 
 
596 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378722  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0328  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.9 
 
 
575 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1357  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.9 
 
 
575 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0823  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.9 
 
 
596 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1207  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.9 
 
 
574 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1912  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.9 
 
 
574 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0734969  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1830  ABC transporter related  40.28 
 
 
596 aa  213  9e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25671  putative ABC transporter  30.55 
 
 
605 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0985  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.9 
 
 
596 aa  212  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426098  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.14 
 
 
602 aa  210  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0787  lipid export ABC transport protein  29.2 
 
 
572 aa  209  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  29.14 
 
 
609 aa  209  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1519  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.81 
 
 
581 aa  208  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3782  ABC transporter related  35.94 
 
 
676 aa  209  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253912  normal  0.646389 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0198  ATPase  28.71 
 
 
613 aa  207  5e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.312948  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  28.4 
 
 
613 aa  206  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2803  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.68 
 
 
589 aa  206  9e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  28.93 
 
 
556 aa  206  9e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.98 
 
 
597 aa  206  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1962  ABC transporter related  44.87 
 
 
589 aa  206  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1979  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.96 
 
 
589 aa  205  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  29.14 
 
 
618 aa  205  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1982  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.7 
 
 
594 aa  205  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14501  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  27.36 
 
 
586 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  30.07 
 
 
598 aa  204  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2054  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.02 
 
 
593 aa  204  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1722  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.92 
 
 
594 aa  204  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.031974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  31.72 
 
 
613 aa  203  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  28.67 
 
 
588 aa  203  7e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0154  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.02 
 
 
585 aa  203  8e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3270  ABC transporter related  36.79 
 
 
594 aa  203  8e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.255104  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.96 
 
 
578 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1454  ABC transporter related  25.86 
 
 
600 aa  202  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0894  ABC transporter, ATP-binding protein/permease MsbA, putative  28.84 
 
 
580 aa  202  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0824  ABC transporter, ATP-binding protein/permease MsbA, putative  28.84 
 
 
580 aa  202  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.370431  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0152  ABC transporter related protein  28.42 
 
 
602 aa  201  3.9999999999999996e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  29.13 
 
 
566 aa  201  3.9999999999999996e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2507  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.44 
 
 
579 aa  200  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.91 
 
 
583 aa  200  5e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0347  ABC transporter related  29.23 
 
 
647 aa  200  6e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.836066 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.57 
 
 
587 aa  200  7e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1207  putative ABC transporter, ATP-binding protein/permease MsbA  29.21 
 
 
580 aa  200  7.999999999999999e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.272032  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  30.02 
 
 
575 aa  199  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6767  ABC transporter related  38.08 
 
 
589 aa  199  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406129  normal  0.504103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2691  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.96 
 
 
573 aa  199  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0993753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>