More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0272 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0272  trigger factor  100 
 
 		 436 aa  890    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.576701 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2137  trigger factor  65.48 
 
 		 427 aa  587  1e-166  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2564  trigger factor domain  65.01 
 
 		 426 aa  580  1e-164  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2292  trigger factor  64.17 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1954  trigger factor  61.65 
 
 		 428 aa  547  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.657393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2189  trigger factor  57.14 
 
 		 427 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.981322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0238  trigger factor  55.13 
 
 		 440 aa  510  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2406  trigger factor  28.67 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.32784  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  25.94 
 
 		 432 aa  109  8.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  24.45 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  25.34 
 
 		 436 aa  103  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000644844  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  23.64 
 
 		 434 aa  97.4  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  23.22 
 
 		 434 aa  97.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  23.22 
 
 		 434 aa  97.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353037  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  23.22 
 
 		 434 aa  97.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000166473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2566  trigger factor  23.22 
 
 		 435 aa  96.7  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  23.22 
 
 		 432 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  23.22 
 
 		 432 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  23.22 
 
 		 432 aa  94  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000626608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  26.3 
 
 		 430 aa  94  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  23.22 
 
 		 432 aa  94  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182354  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  23.22 
 
 		 432 aa  94  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000095414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1886  trigger factor  25.25 
 
 		 449 aa  93.6  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  25.89 
 
 		 435 aa  93.2  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  23.02 
 
 		 440 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  24.31 
 
 		 434 aa  92.4  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000061134  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  23.2 
 
 		 434 aa  91.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  23.9 
 
 		 444 aa  91.3  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  26.11 
 
 		 441 aa  90.5  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1379  trigger factor  24.38 
 
 		 451 aa  90.5  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20716  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  22.76 
 
 		 432 aa  90.5  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  24.59 
 
 		 469 aa  89.7  8e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1870  trigger factor  23.82 
 
 		 447 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.359537  normal  0.0257731 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  22.3 
 
 		 447 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  23.8 
 
 		 447 aa  89  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  24.18 
 
 		 433 aa  88.2  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  23.48 
 
 		 434 aa  87.8  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2644  trigger factor  22.09 
 
 		 436 aa  88.2  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156375 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  22.63 
 
 		 432 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  22.63 
 
 		 436 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  23.58 
 
 		 434 aa  87.8  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  22.63 
 
 		 432 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  22.63 
 
 		 432 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  22.63 
 
 		 432 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  22.63 
 
 		 432 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  22.63 
 
 		 432 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  22.63 
 
 		 432 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  22.63 
 
 		 432 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  23.17 
 
 		 437 aa  87  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  21.99 
 
 		 432 aa  86.7  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325154  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  24.87 
 
 		 434 aa  86.7  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  23.24 
 
 		 461 aa  86.7  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  23.38 
 
 		 434 aa  86.3  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000148222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1537  trigger factor  23.53 
 
 		 447 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2341  trigger factor  21.82 
 
 		 435 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0955017  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  25 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  22.22 
 
 		 445 aa  86.3  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0722  trigger factor domain-containing protein  23.62 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000704861  hitchhiker  0.0000000324572 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  23.43 
 
 		 437 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  25.07 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000131318  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  23.17 
 
 		 431 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  23.46 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000736756  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  23.46 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000959254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  23.46 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000981502  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  23.46 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000172139  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  25.06 
 
 		 500 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  19.76 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  22.87 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2545  trigger factor  21.97 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0171608 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  22.87 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377099  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  22.87 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1710  trigger factor  23.23 
 
 		 449 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  0.0467647 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  23.99 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1291  trigger factor  21.76 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0308812 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  21.16 
 
 		 448 aa  83.6  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  21.45 
 
 		 437 aa  83.2  0.000000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  21.75 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4984  trigger factor  20.9 
 
 		 448 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2878  trigger factor  25 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  22.05 
 
 		 436 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  22.58 
 
 		 437 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  26.16 
 
 		 485 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  23.95 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  22.87 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1719  trigger factor  21.85 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1348  trigger factor  21.72 
 
 		 448 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514517  normal  0.0597463 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  22.94 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  21.78 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000617295  decreased coverage  0.000000421874 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  22.6 
 
 		 435 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  24.16 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  20.75 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6155  trigger factor  21.77 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1924  trigger factor  21.77 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.317146  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  23.64 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  21.13 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  22.92 
 
 		 443 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2510  trigger factor  22.05 
 
 		 437 aa  79.7  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0323  trigger factor  25.67 
 
 		 440 aa  79  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  25.89 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4370  trigger factor  20.79 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.345895  normal  0.276031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>