More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3544 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  100 
 
 		 288 aa  583  1.0000000000000001e-165  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  61.67 
 
 		 292 aa  350  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  60.35 
 
 		 297 aa  347  1e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  59.58 
 
 		 293 aa  336  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  57.14 
 
 		 299 aa  334  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  57.6 
 
 		 298 aa  330  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  57.24 
 
 		 298 aa  328  4e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  57.24 
 
 		 298 aa  328  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  54.42 
 
 		 299 aa  329  4e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  57.24 
 
 		 298 aa  328  4e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  57.24 
 
 		 298 aa  328  4e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  54.77 
 
 		 293 aa  328  5.0000000000000004e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  57.24 
 
 		 298 aa  328  8e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  57.24 
 
 		 298 aa  328  8e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  57.24 
 
 		 298 aa  328  8e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  57.24 
 
 		 298 aa  328  9e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  54.42 
 
 		 299 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  54.74 
 
 		 292 aa  327  1.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  56.89 
 
 		 298 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  54.42 
 
 		 299 aa  326  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  53.71 
 
 		 299 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  53.71 
 
 		 299 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  53.71 
 
 		 299 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  53.71 
 
 		 299 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  53.71 
 
 		 299 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  53.71 
 
 		 299 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  53.36 
 
 		 299 aa  325  6e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  53.71 
 
 		 299 aa  324  9e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  57.84 
 
 		 293 aa  323  1e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  56.83 
 
 		 288 aa  323  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  54.84 
 
 		 293 aa  320  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  54.04 
 
 		 288 aa  317  1e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  56.16 
 
 		 299 aa  316  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  54.42 
 
 		 291 aa  317  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  55.07 
 
 		 299 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  54.39 
 
 		 287 aa  301  1e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  53.68 
 
 		 287 aa  300  3e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  52.3 
 
 		 290 aa  298  5e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  52.96 
 
 		 295 aa  299  5e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  53.33 
 
 		 287 aa  294  1e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  52.3 
 
 		 295 aa  287  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  51.94 
 
 		 289 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  50.53 
 
 		 286 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  52.3 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  50.18 
 
 		 288 aa  279  4e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  50.18 
 
 		 292 aa  276  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  49.12 
 
 		 286 aa  271  8.000000000000001e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  47.02 
 
 		 297 aa  267  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  49.47 
 
 		 292 aa  265  5e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  47.48 
 
 		 282 aa  255  5e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  47.7 
 
 		 347 aa  255  8e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  46.29 
 
 		 303 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  46.48 
 
 		 304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  45.77 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  45.42 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  43.4 
 
 		 307 aa  209  5e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  43.49 
 
 		 307 aa  205  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  41.1 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  39.52 
 
 		 307 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  44.13 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0549  branched-chain amino acid aminotransferase  39.58 
 
 		 303 aa  202  5e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000680418  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  41.79 
 
 		 308 aa  202  7e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  40.28 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  42.25 
 
 		 317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2744  aminotransferase class IV  40.74 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2654  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  41.08 
 
 		 307 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  40.75 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  38.19 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706765  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2839  aminotransferase class IV  41.08 
 
 		 307 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0464301  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3631  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  39.38 
 
 		 308 aa  198  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  41.88 
 
 		 306 aa  196  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0716  branched-chain amino acid aminotransferase  38.19 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.470563  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1601  branched-chain amino acid aminotransferase  38.75 
 
 		 303 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.720294 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  40 
 
 		 298 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  41.55 
 
 		 306 aa  195  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  36.64 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  38.73 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0147  branched-chain amino acid aminotransferase  37.76 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.65778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  39.58 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1779  branched-chain amino acid aminotransferase  38.19 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.059153  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  37.5 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  39.93 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0607  branched-chain amino acid aminotransferase  37.76 
 
 		 303 aa  192  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000582891  decreased coverage  0.00306589 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  38.97 
 
 		 307 aa  192  7e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  37.86 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  37.89 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  40.07 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  41.64 
 
 		 306 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  37.85 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  38.3 
 
 		 312 aa  188  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  41.05 
 
 		 307 aa  188  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  37.54 
 
 		 312 aa  188  9e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  37.28 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1215  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  40.99 
 
 		 299 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  36.68 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0388  branched-chain amino acid aminotransferase  38.11 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1218  branched-chain amino acid aminotransferase  38.87 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.204453 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3367  Branched-chain-amino-acid transaminase  38.08 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  39.15 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  37.89 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>