More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2064 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 260 aa  514  1.0000000000000001e-145  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  42.45 
 
 		 270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  44.06 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  41.95 
 
 		 257 aa  178  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  41.63 
 
 		 257 aa  178  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  44.81 
 
 		 257 aa  174  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  40.85 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  43.56 
 
 		 256 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  42.08 
 
 		 256 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  41.28 
 
 		 257 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  41.09 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  46.31 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  45.32 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  47.03 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  44 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  43.4 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2886  ABC-type transporter inner membrane protein  41.01 
 
 		 234 aa  166  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.201575  normal  0.797194 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  42.31 
 
 		 263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  42.31 
 
 		 263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  43.65 
 
 		 264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  39.91 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  40.59 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  39.91 
 
 		 267 aa  162  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  37.87 
 
 		 245 aa  162  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  39.41 
 
 		 260 aa  162  7e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  41.71 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  42.79 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  42.79 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  41.15 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  41.15 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  44.39 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  39.02 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  42.44 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0889  protein of unknown function DUF140  39.81 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  40.65 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  38.43 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  40.71 
 
 		 260 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  40.74 
 
 		 261 aa  159  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  39.13 
 
 		 258 aa  159  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  39.81 
 
 		 261 aa  159  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  40.36 
 
 		 257 aa  158  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  39.09 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  40.98 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  36.25 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  39.82 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0760  protein of unknown function DUF140  37.08 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  35.83 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  40.65 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  42.57 
 
 		 249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  37.04 
 
 		 260 aa  155  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  37.04 
 
 		 260 aa  155  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03185  putative transport protein (ABC superfamily, membrane)  39.81 
 
 		 258 aa  155  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  37.92 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0904  hypothetical protein  36.65 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0873  hypothetical protein  36.65 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3401  hypothetical protein  39.81 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  42.79 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03210  toluene tolerance protein  39.08 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  38.35 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  34.6 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  38.42 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  37.55 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  38.49 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  40.98 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  40.98 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0980  hypothetical protein  36.17 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  40.98 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  35.39 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  37.5 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  40.98 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4232  hypothetical protein  37.85 
 
 		 260 aa  152  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  39.9 
 
 		 264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  35 
 
 		 265 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1817  toluene tolerance protein  38.17 
 
 		 249 aa  151  8e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1749  hypothetical protein  38.17 
 
 		 249 aa  151  8e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.627131  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  36.1 
 
 		 265 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  35 
 
 		 265 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  39.6 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  34.18 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  37.91 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3630  hypothetical protein  35 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485791  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4017  protein of unknown function DUF140  37.39 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0789567  normal  0.274799 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0734  hypothetical protein  39.62 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.336602 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  36.24 
 
 		 258 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  36.29 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3953  hypothetical protein  40.49 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  36.36 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  39.46 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0722  hypothetical protein  40.49 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  40.87 
 
 		 269 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  34.18 
 
 		 265 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0238  hypothetical protein  39.05 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  35.44 
 
 		 265 aa  149  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  33.76 
 
 		 265 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  38.05 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  35.61 
 
 		 265 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0680  hypothetical protein  40 
 
 		 261 aa  149  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3342  hypothetical protein  40 
 
 		 261 aa  149  6e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0679  hypothetical protein  40 
 
 		 261 aa  149  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876279  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3080  hypothetical protein  39.32 
 
 		 260 aa  149  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>