More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0149 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0149  Trans-hexaprenyltranstransferase  100 
 
 		 338 aa  692    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  40.06 
 
 		 322 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  39.1 
 
 		 322 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  39.1 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  39.1 
 
 		 322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  38.14 
 
 		 322 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  38.71 
 
 		 343 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  39.42 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  36.91 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  38.41 
 
 		 322 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  39.05 
 
 		 322 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  40.06 
 
 		 330 aa  216  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  38.56 
 
 		 322 aa  216  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  37.93 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  36.28 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  37.92 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  37.5 
 
 		 322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  36.91 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  37.58 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  39.38 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  37.75 
 
 		 337 aa  212  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  39.18 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  39.18 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  36.56 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  37.85 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  38.01 
 
 		 332 aa  210  3e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  37.94 
 
 		 322 aa  209  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  36.56 
 
 		 323 aa  208  9e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  37.74 
 
 		 333 aa  208  9e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  37.69 
 
 		 332 aa  208  1e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  39.18 
 
 		 333 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.39 
 
 		 324 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  35.78 
 
 		 324 aa  206  4e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  37.2 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2582  hypothetical protein  35.24 
 
 		 322 aa  206  6e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2996  octaprenyl-diphosphate synthase  37.69 
 
 		 340 aa  205  7e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  36.39 
 
 		 326 aa  205  9e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  37.27 
 
 		 333 aa  205  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  36.74 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  36.59 
 
 		 341 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  36.28 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  36 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  35.03 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2709  hypothetical protein  35.03 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  34.8 
 
 		 320 aa  203  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  38.68 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0978  trans-hexaprenyltranstransferase  37.19 
 
 		 331 aa  203  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234439  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  33.96 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3653  octaprenyl-diphosphate synthase  37.5 
 
 		 323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0657  polyprenyl synthetase  35.78 
 
 		 333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  35.78 
 
 		 324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.03 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0742  trans-hexaprenyltranstransferase  35.78 
 
 		 333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.247757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  35.96 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  35.67 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  37.94 
 
 		 322 aa  199  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  36.79 
 
 		 322 aa  199  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3126  trans-hexaprenyltranstransferase  37.19 
 
 		 331 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000273118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  37.14 
 
 		 344 aa  199  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  35.44 
 
 		 322 aa  199  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  35.71 
 
 		 322 aa  199  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3006  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.64 
 
 		 324 aa  199  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  36.88 
 
 		 359 aa  199  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  35.96 
 
 		 322 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  35.22 
 
 		 322 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  35.62 
 
 		 348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  34.06 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1454  Polyprenyl synthetase  34.23 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.322683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0894  trans-hexaprenyltranstransferase  37.19 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000238398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  34.29 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.48 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  36.88 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  35.31 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  37.94 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3220  polyprenyl synthetase  37.19 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000594957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  38.41 
 
 		 336 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  38.08 
 
 		 332 aa  194  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  38.13 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  35.42 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104163  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  37.11 
 
 		 323 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  35 
 
 		 323 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  34.88 
 
 		 323 aa  195  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  37.11 
 
 		 323 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0636  polyprenyl synthetase  39.71 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  34.7 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  37.11 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2899  octaprenyl-diphosphate synthase  35.96 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2517  Polyprenyl synthetase  35.96 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  37.16 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  35.31 
 
 		 322 aa  193  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  34.77 
 
 		 326 aa  193  4e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  35.17 
 
 		 323 aa  192  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  36.86 
 
 		 313 aa  192  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.98 
 
 		 320 aa  192  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  35.49 
 
 		 323 aa  192  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  34.57 
 
 		 323 aa  192  8e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>