239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0490 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0490  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  100 
 
 
283 aa  582  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2352  MaoC-like dehydratase  55.24 
 
 
286 aa  332  5e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137792  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3605  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  55.24 
 
 
286 aa  331  6e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.253459  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3386  MaoC-like dehydratase  54.9 
 
 
286 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263784  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3113  MaoC-like dehydratase  53.5 
 
 
286 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107347  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5004  putative dehydratase  57.69 
 
 
286 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.914523  normal  0.133052 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5282  MaoC-like dehydratase  50.18 
 
 
285 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1597  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  51.7 
 
 
286 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1135  MaoC-like dehydratase  49.07 
 
 
290 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4366  hypothetical protein  43.62 
 
 
288 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.253028  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5520  acyl dehydratase (MaoC-like domain)  44.6 
 
 
291 aa  241  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0195  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  42.28 
 
 
315 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51160  hypothetical protein  42.05 
 
 
288 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000524092 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3404  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  41.2 
 
 
286 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3807  putative dehydratase  41.78 
 
 
297 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0121  dehydratase  40.88 
 
 
297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7330  MaoC-like dehydratase  41.24 
 
 
291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881634  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0139  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  40.54 
 
 
297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6855  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  42.66 
 
 
289 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.28 
 
 
710 aa  200  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13571  dehydrogenase  40.28 
 
 
286 aa  195  7e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000153727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5046  dehydratase  40.64 
 
 
286 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4663  MaoC-like dehydratase  40.64 
 
 
286 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4751  dehydratase  40.64 
 
 
286 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1518  dehydratase  40.49 
 
 
286 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1180  MaoC-like dehydratase  43.7 
 
 
289 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.637996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1197  dehydratase  43.7 
 
 
289 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.72908  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5238  dehydratase  39.93 
 
 
286 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.263636 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1207  dehydratase  43.31 
 
 
289 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273063  normal  0.0226898 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3852  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  41.09 
 
 
285 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0894  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  41.88 
 
 
287 aa  186  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5896  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  40.69 
 
 
285 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1528  dehydratase  38.57 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4895  dehydratase  42.62 
 
 
291 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0215667 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13423  dehydrogenase  40.83 
 
 
290 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.012910000000001e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2580  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  39.37 
 
 
289 aa  175  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2677  dehydratase  39.06 
 
 
276 aa  175  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211797  normal  0.0433405 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1800  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  41.05 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3478  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  39.16 
 
 
265 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02530  peroxisomal hydratase-dehydrogenase-epimerase (hde), putative  37.14 
 
 
893 aa  168  8e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874708  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2781  dehydratase  39.35 
 
 
282 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3224  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  36.97 
 
 
283 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2885  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  39.08 
 
 
278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.409095  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4199  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  40.73 
 
 
288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5305  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  40.55 
 
 
283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0297084  normal  0.691461 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07111  peroxisomal multifunctional beta-oxidation protein (MFP), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03900)  38.69 
 
 
903 aa  161  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.928702 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4033  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  35.64 
 
 
283 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54590  predicted protein  33.21 
 
 
901 aa  150  3e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.900491  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0577  dehydratase  35.21 
 
 
283 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2346  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
283 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00138691  normal  0.0743617 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09041  conserved hypothetical protein  33.98 
 
 
295 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.238331  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02577  peroxisomal dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G00640)  31.9 
 
 
316 aa  112  6e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.560987 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1830  3-alpha,7-alpha,12-alpha-trihydroxy-5-beta- chole st-24-enoyl-CoAhydratase  28.8 
 
 
290 aa  99.8  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.288038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2340  dehydratase  31.69 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321088  decreased coverage  0.00219714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  32.02 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43519  predicted protein  25.94 
 
 
361 aa  63.5  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3371  MaoC domain-containing protein  33.33 
 
 
141 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0580  MaoC-like dehydratase  24.09 
 
 
317 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  27.18 
 
 
337 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6351  MaoC-like dehydratase  35.38 
 
 
144 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040058  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  31.71 
 
 
141 aa  56.6  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  24.8 
 
 
335 aa  55.8  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2189  MaoC-like dehydratase  28.19 
 
 
284 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  33.61 
 
 
154 aa  55.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3597  dehydratase  32.09 
 
 
158 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.43263 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03381  conserved hypothetical protein  26.95 
 
 
1872 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.888019  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4363  MaoC domain protein dehydratase  34.44 
 
 
145 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2532  dehydratase  29.45 
 
 
3087 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4356  MaoC-like dehydratase  34.29 
 
 
156 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2939  MaoC domain protein dehydratase  30.69 
 
 
300 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  39.13 
 
 
150 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4125  dehydratase  29.05 
 
 
3097 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  46.67 
 
 
142 aa  53.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3812  MaoC-like dehydratase  36.26 
 
 
140 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0106778  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1760  MaoC domain protein dehydratase  28.19 
 
 
284 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  35.71 
 
 
144 aa  52.8  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0741  MaoC-like dehydratase  25.17 
 
 
148 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244833  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2305  MaoC family protein  39.74 
 
 
147 aa  52.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  34.48 
 
 
137 aa  52.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0980  dehydratase  39.74 
 
 
147 aa  52.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.528408  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2195  dehydratase  39.74 
 
 
147 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4238  dehydratase  37 
 
 
143 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2497  MaoC domain protein dehydratase  33.33 
 
 
134 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0197  MaoC domain protein dehydratase  27.67 
 
 
297 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38940  acyl dehydratase  29.19 
 
 
286 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2779  MaoC domain protein dehydratase  36.36 
 
 
135 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2686  MaoC-like dehydratase  36.36 
 
 
146 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4076  MaoC-like dehydratase  37.36 
 
 
137 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3364  MaoC-like dehydratase  31.86 
 
 
147 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.975509  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1822  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30160  3-Re enoyl-CoA hydratase PhaJ  32.38 
 
 
156 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0426  MaoC domain protein dehydratase  33.09 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.252327  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1039  dehydratase  34.82 
 
 
147 aa  50.4  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0115  MaoC domain protein dehydratase  32.67 
 
 
141 aa  50.4  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.527256  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  41.43 
 
 
141 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1777  MaoC domain protein dehydratase  33.66 
 
 
133 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3648  fatty acid synthase  27.11 
 
 
3077 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21310  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288859  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  35.23 
 
 
138 aa  50.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3721  fatty acid synthase  27.11 
 
 
3077 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.875058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>