More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1213 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
282 aa  560  1.0000000000000001e-159  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  88.3 
 
 
282 aa  520  1e-146  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  82.62 
 
 
282 aa  489  1e-137  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  81.21 
 
 
294 aa  481  1e-135  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  53.71 
 
 
283 aa  297  1e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  49.47 
 
 
286 aa  291  1e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  48.59 
 
 
285 aa  279  4e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  37.54 
 
 
284 aa  191  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  36.4 
 
 
282 aa  191  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  37.29 
 
 
294 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  38.43 
 
 
284 aa  186  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  39.72 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  37.28 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  39.36 
 
 
293 aa  183  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  40.43 
 
 
285 aa  180  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  34.98 
 
 
282 aa  180  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  40.28 
 
 
300 aa  177  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  39.93 
 
 
292 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  35.23 
 
 
286 aa  176  6e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
306 aa  171  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 
288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  33.67 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
288 aa  163  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  30.9 
 
 
288 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  35.81 
 
 
296 aa  157  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  36.99 
 
 
290 aa  154  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  36.75 
 
 
285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  34.86 
 
 
284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  32.29 
 
 
295 aa  151  1e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  34.25 
 
 
291 aa  143  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  34.06 
 
 
284 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  32.16 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 
289 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 
284 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67165  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase) (ATP-PRT)  35.74 
 
 
304 aa  138  8.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 
291 aa  137  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 
291 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
292 aa  136  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  31.8 
 
 
294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  33.21 
 
 
283 aa  135  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  32.49 
 
 
294 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  31.67 
 
 
281 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  31.8 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 
287 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1657  ATP phosphoribosyltransferase  31.99 
 
 
298 aa  133  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22344  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2454  ATP phosphoribosyltransferase  39.68 
 
 
214 aa  133  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 
294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  32.29 
 
 
294 aa  132  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
287 aa  132  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  33.69 
 
 
285 aa  132  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  33.11 
 
 
307 aa  132  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  32.73 
 
 
280 aa  132  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  31.9 
 
 
287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  32.74 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  32.63 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
282 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  32.43 
 
 
294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02190  ATP phosphoribosyltransferase  36.95 
 
 
223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0242064  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 
294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  31.54 
 
 
281 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 
290 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0883  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  38.03 
 
 
211 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.332563  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 
299 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  32.3 
 
 
289 aa  128  9.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 
299 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  30.74 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5072  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.04 
 
 
215 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.746363 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  32.86 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 
299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 
297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  29.35 
 
 
299 aa  126  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0502  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.11 
 
 
223 aa  126  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  31.38 
 
 
293 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3496  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  36.98 
 
 
215 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2525  ATP phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 
299 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3169  ATP phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 
299 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0405  ATP phosphoribosyltransferase  30.85 
 
 
299 aa  124  1e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  32.29 
 
 
289 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01118  ATP phosphoribosyltransferase  32.77 
 
 
300 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2428  ATP phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 
299 aa  124  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  31.42 
 
 
299 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0743  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.11 
 
 
216 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881106  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1890  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  36.61 
 
 
220 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.930921  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  31.42 
 
 
299 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  31.42 
 
 
299 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 
299 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2764  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  38.1 
 
 
211 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216973  hitchhiker  0.00563618 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06151  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  36.61 
 
 
220 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.515801 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3353  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  38.1 
 
 
211 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4439  ATP phosphoribosyltransferase  39.68 
 
 
211 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>