More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2139 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2139  CheY-like chemotaxis protein, response regulator receiver  100 
 
 		 155 aa  311  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.109074  normal  0.326223 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2469  response regulator receiver/diguanylate phosphodiesterase  47.18 
 
 		 407 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.456711  normal  0.0660939 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0483  cyclic-di-GMP regulatory protein  37.4 
 
 		 406 aa  87  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0908  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  36.29 
 
 		 405 aa  84.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1555  response regulator receiver/diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1161  two-component response regulator  32.8 
 
 		 392 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.079041  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12810  two-component response regulator  32.8 
 
 		 392 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0434149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2710  response regulator of RpoS  42.11 
 
 		 337 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.317611  hitchhiker  0.000232648 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3750  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  32.8 
 
 		 397 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1483  response regulator/EAL domain protein  31.58 
 
 		 429 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1020  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 		 399 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  35.34 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3039  diguanylate phosphodiesterase  30.33 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0303288  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  33.83 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  34.59 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1923  response regulator receiver domain-containing protein  32.88 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  33.83 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  33.83 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  33.83 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  33.83 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  33.83 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  33.83 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  33.83 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  33.83 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  33.83 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  33.08 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  33.08 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  33.08 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  33.08 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  33.08 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  29.92 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0555  response regulator receiver  30.47 
 
 		 266 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.502991  normal  0.361132 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0999  response regulator receiver protein  32.81 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0302  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00186383  normal  0.501704 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0334  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.238286 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  32.33 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  32.33 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  32.33 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0435  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00876892  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  32.03 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0227  response regulator receiver/diguanylate phosphodiesterase  26.77 
 
 		 843 aa  60.8  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2521  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.97 
 
 		 457 aa  60.8  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2330  response regulator  28.57 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  36.78 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0809  putative diguanylate phosphodiesterase  27.64 
 
 		 411 aa  60.5  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.95 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  32.03 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1698  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.8 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000740904 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0915  CheA signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 584 aa  60.1  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2230  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 707 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  28.91 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1777  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 465 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3704  response regulator receiver domain-containing protein  34.4 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.600519  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0443  lipoprotein  36.49 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.81181  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1381  response regulator receiver protein  34.69 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3985  signal transduction histidine protein kinase  32.48 
 
 		 1156 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0386149 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1198  putative chemotaxis protein CheY-like protein  38.75 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  29.69 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1258  two component Fis family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 486 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3594  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  31.06 
 
 		 404 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0242855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2245  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.86 
 
 		 460 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0961  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 454 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3079  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  28 
 
 		 403 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713986  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  29.69 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  30.77 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0516  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 468 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000971097  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3311  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0651  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.747314  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1940  response regulator  28.33 
 
 		 397 aa  58.2  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249901  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3295  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.6 
 
 		 514 aa  58.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.836784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3016  two component response regulator  30.17 
 
 		 399 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1391  response regulator receiver protein  38.64 
 
 		 368 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0031  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 243 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59790  two component response regulator  27.59 
 
 		 399 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000119799  hitchhiker  4.43105e-18 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3596  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.6 
 
 		 515 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.363783 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3108  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 461 aa  58.2  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3272  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  31.06 
 
 		 404 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00166163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2580  putative diguanylate phosphodiesterase  27.87 
 
 		 413 aa  57.4  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.465232 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  29.37 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 		 1193 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  28.91 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 810 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4175  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  45.83 
 
 		 1083 aa  57.4  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06210  chemotaxis response regulator CheY  30.95 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00956  chemotaxis response regulator CheY  30.95 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.328186  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  32 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5232  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 294 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.240509 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1959  response regulator of RpoS  36.59 
 
 		 338 aa  57  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1971  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.79 
 
 		 473 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1293  EAL:response regulator receiver  33.06 
 
 		 453 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.532656  normal  0.518355 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2056  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.79 
 
 		 473 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.732718  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1258  response regulator VieA  28.68 
 
 		 584 aa  57  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.204001  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06170  sensory transduction protein kinase  26.87 
 
 		 380 aa  57  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>