More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3504 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3504  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 482 aa  993    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3131  carbohydrate kinase FGGY  60.17 
 
 		 481 aa  600  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.735218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2261  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.37 
 
 		 520 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0868353 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3019  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.26 
 
 		 520 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3017  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.26 
 
 		 520 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.232483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2981  autoinducer-2 (AI-2) kinase  24.48 
 
 		 520 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  24.6 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  24.6 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2977  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.67 
 
 		 520 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000047226 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2718  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.67 
 
 		 522 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2698  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.67 
 
 		 522 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1477  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.46 
 
 		 520 aa  107  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0166671  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3538  autoinducer-2 (AI-2) kinase  27.94 
 
 		 530 aa  106  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  21.62 
 
 		 496 aa  106  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2768  FGGY family of carbohydrate  24.19 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0823721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2774  autoinducer-2 (AI-2) kinase  23.67 
 
 		 520 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.235174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2147  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.95 
 
 		 530 aa  104  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2135  carbohydrate kinase FGGY  25.63 
 
 		 530 aa  103  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0411416  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  23.4 
 
 		 497 aa  103  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1712  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.63 
 
 		 530 aa  103  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1661  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.63 
 
 		 530 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.68331 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1593  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.63 
 
 		 530 aa  103  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  24.14 
 
 		 506 aa  101  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  24.7 
 
 		 505 aa  99.4  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  25.56 
 
 		 486 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  23.47 
 
 		 501 aa  99.4  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4470  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26.03 
 
 		 516 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4403  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26.03 
 
 		 516 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00650936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4288  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26.03 
 
 		 516 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3648  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.24 
 
 		 530 aa  99.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4400  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26.03 
 
 		 516 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4318  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26.03 
 
 		 516 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3518  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.56 
 
 		 530 aa  98.6  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3745  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26.45 
 
 		 525 aa  98.6  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0855  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.24 
 
 		 530 aa  97.8  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1382  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25.24 
 
 		 521 aa  95.9  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  25.6 
 
 		 500 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  23.4 
 
 		 502 aa  94.7  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  23.41 
 
 		 481 aa  92.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  22.65 
 
 		 519 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  25.69 
 
 		 499 aa  90.1  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2124  autoinducer-2 (AI-2) kinase  28.18 
 
 		 530 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359272  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  23.94 
 
 		 513 aa  88.2  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  24.46 
 
 		 505 aa  87.8  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  23.71 
 
 		 488 aa  88.2  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  22.27 
 
 		 500 aa  87.8  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  23.63 
 
 		 494 aa  87.8  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  26.47 
 
 		 508 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  27.31 
 
 		 538 aa  87.4  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  22.24 
 
 		 517 aa  86.7  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  22.24 
 
 		 517 aa  86.7  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  26.47 
 
 		 508 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  23.08 
 
 		 489 aa  84.7  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  22.39 
 
 		 489 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  22.85 
 
 		 474 aa  84.7  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  22.94 
 
 		 530 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1269  carbohydrate kinase FGGY  21.87 
 
 		 512 aa  83.2  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.237373  normal  0.4507 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2470  carbohydrate kinase FGGY  22.78 
 
 		 515 aa  83.2  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2596  carbohydrate kinase, FGGY  22.06 
 
 		 520 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184923 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1866  carbohydrate kinase FGGY  22.66 
 
 		 520 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0049  autoinducer-2 (AI-2) kinase  26.03 
 
 		 517 aa  82.4  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4826  carbohydrate kinase, FGGY family  25.23 
 
 		 502 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3151  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25 
 
 		 509 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3506  autoinducer-2 (AI-2) kinase  25 
 
 		 509 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0218  glycerol kinase  24.84 
 
 		 505 aa  80.1  0.00000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  24.13 
 
 		 499 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4007  putative sugar  27.08 
 
 		 494 aa  80.1  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4112  putative sugar kinase  27.08 
 
 		 494 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.189365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1584  carbohydrate kinase FGGY  26.07 
 
 		 449 aa  79.7  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1070  carbohydrate kinase FGGY  25.11 
 
 		 481 aa  79  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.395236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3991  putative sugar kinase  27.08 
 
 		 494 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.858143 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  23.1 
 
 		 487 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4062  carbohydrate kinase FGGY family protein  27.08 
 
 		 494 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.901874  normal  0.925843 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  24.28 
 
 		 512 aa  78.2  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  22.15 
 
 		 518 aa  78.2  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  21.82 
 
 		 511 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  23.86 
 
 		 515 aa  77.4  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  21.82 
 
 		 511 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  21.82 
 
 		 511 aa  77  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0470  glycerol kinase  24 
 
 		 499 aa  77  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3503  carbohydrate kinase FGGY  27.18 
 
 		 484 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  28.05 
 
 		 528 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  24.42 
 
 		 503 aa  75.9  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  20.7 
 
 		 512 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  20.7 
 
 		 511 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  22.2 
 
 		 505 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  23.56 
 
 		 500 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  29.3 
 
 		 506 aa  74.7  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  24.69 
 
 		 513 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3770  carbohydrate kinase  24.92 
 
 		 502 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  22.52 
 
 		 497 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  21.62 
 
 		 511 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  24.67 
 
 		 498 aa  73.6  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  24.9 
 
 		 513 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  27.31 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  27.11 
 
 		 506 aa  73.6  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  23.88 
 
 		 512 aa  73.2  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1697  carbohydrate kinase, FGGY  24.66 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.667396  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2441  carbohydrate kinase, FGGY  28.19 
 
 		 487 aa  72.8  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  26.87 
 
 		 484 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>