More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2490 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2490  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 454 aa  951    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0219656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0687  coproporphyrinogen III oxidase  58.84 
 
 		 452 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1144  coproporphyrinogen III oxidase  57.72 
 
 		 459 aa  544  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5318  coproporphyrinogen III oxidase  55.63 
 
 		 454 aa  514  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.05938 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2542  coproporphyrinogen III oxidase  51.22 
 
 		 454 aa  493  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.846593  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1957  coproporphyrinogen III oxidase  50.45 
 
 		 454 aa  486  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0598  coproporphyrinogen III oxidase  48.12 
 
 		 475 aa  472  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0614  coproporphyrinogen III oxidase  48.99 
 
 		 472 aa  473  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.546946  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1952  coproporphyrinogen III oxidase  48.34 
 
 		 473 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0253288  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0285  coproporphyrinogen III oxidase  47.46 
 
 		 475 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1579  coproporphyrinogen III oxidase  47.9 
 
 		 474 aa  468  9.999999999999999e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00577188 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0740  coproporphyrinogen III oxidase  47.9 
 
 		 472 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3571  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  52.15 
 
 		 460 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.71012 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0658  coproporphyrinogen III oxidase  47.32 
 
 		 473 aa  451  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1429  coproporphyrinogen III oxidase  40.4 
 
 		 469 aa  320  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  37.76 
 
 		 484 aa  320  5e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  39.73 
 
 		 465 aa  318  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  37.83 
 
 		 460 aa  312  6.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.41 
 
 		 458 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  38.2 
 
 		 462 aa  312  7.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  37.19 
 
 		 456 aa  312  9e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0019  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.92 
 
 		 464 aa  311  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2783  coproporphyrinogen III oxidase  38.95 
 
 		 460 aa  311  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.682554  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2824  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.78 
 
 		 470 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0116483  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  37 
 
 		 482 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1531  coproporphyrinogen III oxidase  37.81 
 
 		 460 aa  311  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.304653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  38.46 
 
 		 468 aa  311  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.33 
 
 		 478 aa  310  5e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1511  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.33 
 
 		 462 aa  308  9e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.641455  hitchhiker  0.00827535 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  36.77 
 
 		 463 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3368  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.38 
 
 		 457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852365  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0026  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  37.44 
 
 		 468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  37.33 
 
 		 461 aa  307  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  38.08 
 
 		 460 aa  307  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  38.08 
 
 		 460 aa  307  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.76 
 
 		 462 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  38.29 
 
 		 487 aa  306  6e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  37.36 
 
 		 463 aa  306  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  37.5 
 
 		 463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1162  coproporphyrinogen III oxidase  37.61 
 
 		 460 aa  304  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  36.67 
 
 		 463 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  36.67 
 
 		 463 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  36.89 
 
 		 461 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1217  coproporphyrinogen III oxidase  36.56 
 
 		 458 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  38.06 
 
 		 453 aa  300  4e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2470  coproporphyrinogen III oxidase  38.64 
 
 		 476 aa  300  5e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1148  coproporphyrinogen III oxidase  36.34 
 
 		 458 aa  299  6e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  37.05 
 
 		 470 aa  299  6e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0797  coproporphyrinogen III oxidase  36.24 
 
 		 451 aa  299  8e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  36.22 
 
 		 463 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  36.45 
 
 		 464 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1089  coproporphyrinogen III oxidase  36.34 
 
 		 458 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  36.45 
 
 		 464 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  36.58 
 
 		 465 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  36.6 
 
 		 463 aa  298  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1010  coproporphyrinogen III oxidase  36.14 
 
 		 451 aa  297  3e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0750771  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01054  coproporphyrinogen III oxidase  38.63 
 
 		 458 aa  297  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.299097  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1072  coproporphyrinogen III oxidase  35.92 
 
 		 451 aa  296  6e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.202644  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  36.22 
 
 		 464 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  36.45 
 
 		 464 aa  295  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  36.22 
 
 		 464 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  36.22 
 
 		 464 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  36.22 
 
 		 464 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  36.22 
 
 		 464 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3828  coproporphyrinogen III oxidase  36.1 
 
 		 460 aa  294  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  36.64 
 
 		 473 aa  293  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  36.55 
 
 		 500 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  35.91 
 
 		 449 aa  292  8e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0305  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.22 
 
 		 463 aa  292  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0548818  hitchhiker  0.000383686 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  35.68 
 
 		 449 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  35.83 
 
 		 449 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1695  coproporphyrinogen III oxidase  36.55 
 
 		 452 aa  291  1e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0134  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  36.22 
 
 		 463 aa  292  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3582  coproporphyrinogen III oxidase  37.5 
 
 		 460 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  36.99 
 
 		 489 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  36.36 
 
 		 481 aa  289  6e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1129  coproporphyrinogen III oxidase  36.24 
 
 		 460 aa  289  7e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0669659  decreased coverage  0.00210018 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3829  coproporphyrinogen III oxidase  37.07 
 
 		 460 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.919193 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  37 
 
 		 457 aa  289  8e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37 
 
 		 457 aa  289  8e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  37 
 
 		 457 aa  289  8e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  37 
 
 		 457 aa  289  8e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  37 
 
 		 457 aa  289  8e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  37 
 
 		 457 aa  289  8e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  37 
 
 		 457 aa  289  8e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  37 
 
 		 457 aa  289  8e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  35.98 
 
 		 451 aa  288  1e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0207  coproporphyrinogen III oxidase  35.87 
 
 		 455 aa  288  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.58 
 
 		 465 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  34.58 
 
 		 465 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0472  coproporphyrinogen III oxidase  36.97 
 
 		 455 aa  287  2e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.953637  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0086  coproporphyrinogen III oxidase  36.91 
 
 		 446 aa  287  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.652683  normal  0.197179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0024  coproporphyrinogen III oxidase  38.08 
 
 		 457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0201476  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4192  coproporphyrinogen III oxidase  38.08 
 
 		 457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.799407  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4251  coproporphyrinogen III oxidase  36.77 
 
 		 457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  0.0658119 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0026  coproporphyrinogen III oxidase  38.08 
 
 		 457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0394693  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4264  coproporphyrinogen III oxidase  37.31 
 
 		 460 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  35.4 
 
 		 465 aa  286  5e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1048  coproporphyrinogen III oxidase  36.53 
 
 		 471 aa  286  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1604  coproporphyrinogen III oxidase  37.31 
 
 		 460 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0165321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>