67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1591 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1591  hypothetical protein  100 
 
 
632 aa  1304    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0429  hypothetical protein  33.44 
 
 
636 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248798  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1886  hypothetical protein  35.54 
 
 
637 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4000  transglutaminase domain protein  33.76 
 
 
642 aa  355  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000741085  normal  0.0455178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0511  hypothetical protein  32.29 
 
 
635 aa  337  5e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06990  hypothetical protein  30.55 
 
 
621 aa  292  2e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0438321  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  23.33 
 
 
664 aa  143  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  24.44 
 
 
1225 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  23.09 
 
 
659 aa  104  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.97 
 
 
1256 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4359  hypothetical protein  29.41 
 
 
633 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.12 
 
 
1256 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  28.22 
 
 
1433 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0237  tetratricopeptide protein  21.29 
 
 
1256 aa  80.9  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0363  hypothetical protein  28.44 
 
 
633 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0259  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 
1253 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2424  hypothetical protein  25.89 
 
 
753 aa  79  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.415243  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2939  putative transmembrane protein  25.87 
 
 
639 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.494843  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 
1096 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  26.38 
 
 
1433 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  26.38 
 
 
1431 aa  75.5  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3557  hypothetical protein  23.81 
 
 
638 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.406534  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2161  hypothetical protein  29.21 
 
 
621 aa  72.8  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1820  hypothetical protein  29.21 
 
 
621 aa  72.8  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3963  hypothetical protein  23.81 
 
 
638 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.333433  normal  0.0412099 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  24.06 
 
 
647 aa  71.2  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0705  hypothetical protein  24.01 
 
 
636 aa  70.5  0.00000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  26.95 
 
 
1257 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0794  hypothetical protein  24.01 
 
 
636 aa  70.5  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110832  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06127  hypothetical protein  25.63 
 
 
637 aa  68.6  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.343201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01039  hypothetical protein  25.63 
 
 
637 aa  68.6  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.503003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0428  transglutaminase domain protein  19.35 
 
 
678 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5291  hypothetical protein  22.29 
 
 
634 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1801  putative transmembrane protein  27.71 
 
 
632 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.360897  normal  0.364515 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  29.75 
 
 
647 aa  67.8  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  31.34 
 
 
616 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5118  hypothetical protein  23.24 
 
 
641 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303321  normal  0.0401569 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2607  hypothetical protein  24.89 
 
 
647 aa  67.8  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2994  hypothetical protein  24.89 
 
 
647 aa  67.8  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2566  hypothetical protein  29.84 
 
 
635 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.84597  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3469  hypothetical protein  24.73 
 
 
634 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632167  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  33.54 
 
 
342 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  25.89 
 
 
673 aa  64.7  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1538  putative transmembrane protein  25.87 
 
 
637 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  24.88 
 
 
1028 aa  63.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3999  hypothetical protein  20.66 
 
 
672 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102362  normal  0.153544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5703  transglutaminase domain protein  23.71 
 
 
856 aa  57.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411569  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3243  hypothetical protein  24.12 
 
 
624 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.379789  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38080  hypothetical protein  25.73 
 
 
624 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1887  transglutaminase domain protein  21.8 
 
 
656 aa  55.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  24.32 
 
 
1042 aa  54.7  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  20.63 
 
 
672 aa  54.7  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06985  hypothetical protein  21.04 
 
 
678 aa  53.5  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.56041  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3609  TPR repeat-containing protein  20.9 
 
 
1338 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1592  transglutaminase domain protein  20.16 
 
 
667 aa  50.8  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0828  hypothetical protein  23.12 
 
 
840 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  19.81 
 
 
658 aa  50.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  21.62 
 
 
672 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2606  hypothetical protein  23.62 
 
 
613 aa  49.7  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2993  hypothetical protein  23.62 
 
 
613 aa  49.7  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0260  hypothetical protein  20.42 
 
 
1241 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0379172  normal  0.583733 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21980  hypothetical protein  22.1 
 
 
667 aa  47  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0540  hypothetical protein  20 
 
 
655 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920015  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0838  hypothetical protein  23.81 
 
 
704 aa  46.2  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.827538  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2330  hypothetical protein  21.43 
 
 
898 aa  45.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630984  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0857  hypothetical protein  22.31 
 
 
684 aa  44.3  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.121274 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0248  putative lipoprotein  21.32 
 
 
665 aa  43.9  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>