35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0988 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0988  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 186 aa  370  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  41.48 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1688  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  37.5 
 
 		 167 aa  97.8  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04305  putative outer membrane protein  38.76 
 
 		 169 aa  93.6  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1359  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.59 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3263  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.68 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.49 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  35.44 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.19 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0783  hypothetical protein  29.05 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08486  cationic outer membrane protein OmpH  26.47 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  27.6 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  29.14 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0193  cationic outer membrane protein OmpH  32.05 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.757024 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.68 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.54 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.26 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3414  ompH family outer membrane protein  25.54 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.556312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  25.62 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0987  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.12 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1053  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.29 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.093719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0410  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.25 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547835  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1448  outer membrane protein OmpH  27.27 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.15 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.09 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.81 
 
 		 165 aa  45.1  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000628638  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1957  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.93 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.396318  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  25 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2449  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.86 
 
 		 172 aa  43.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2626  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.48 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.905788 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2876  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.24 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195839  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.98 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.08 
 
 		 211 aa  41.2  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00195183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.75 
 
 		 168 aa  41.2  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000148222  normal  0.601214 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03228  hypothetical protein  26.24 
 
 		 166 aa  41.2  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>