41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0987 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0987  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 		 176 aa  362  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1053  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  46.55 
 
 		 178 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.093719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  37.79 
 
 		 211 aa  141  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00195183  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  40.59 
 
 		 174 aa  138  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  39.88 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4435  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  37.58 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  37.11 
 
 		 177 aa  114  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1689  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  34.5 
 
 		 341 aa  110  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04310  cationic outer membrane protein precursor  32.57 
 
 		 275 aa  107  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.07 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1358  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.21 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.567069  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04305  putative outer membrane protein  27.75 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.58 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.87 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.99 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1359  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.73 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.82 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.17 
 
 		 221 aa  54.3  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08486  cationic outer membrane protein OmpH  27.65 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  24.84 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0783  hypothetical protein  20.9 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1688  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.71 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.92 
 
 		 193 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.92 
 
 		 193 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0988  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.12 
 
 		 186 aa  50.8  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.89 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.5 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1453  outer membrane protein, OmpH family  24.5 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0170758  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0410  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.33 
 
 		 182 aa  48.9  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547835  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.23 
 
 		 192 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0193  cationic outer membrane protein OmpH  25 
 
 		 163 aa  47.8  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.757024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.9 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.98 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03228  hypothetical protein  29.21 
 
 		 166 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  20.83 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0794  putative outer membrane protein  25.97 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.31836 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002755  outer membrane chaperone Skp (OmpH) precursor  28.09 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3414  ompH family outer membrane protein  22.35 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.556312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.57 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  22.98 
 
 		 172 aa  41.6  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  21.79 
 
 		 190 aa  40.8  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>