76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4566 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4566  O-methyltransferase family 2  100 
 
 
355 aa  739    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3883  O-methyltransferase family protein  68.66 
 
 
354 aa  516  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.181684 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4796  O-methyltransferase, family 2  67.24 
 
 
352 aa  509  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2873  O-methyltransferase family protein  52.14 
 
 
360 aa  392  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2107  putative O-methyltransferase  52.27 
 
 
379 aa  394  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1718  O-methyltransferase, putative  52.01 
 
 
357 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000763077 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1680  O-methyltransferase, putative  51.44 
 
 
357 aa  384  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.275559  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2384  O-methyltransferase family protein  53.74 
 
 
355 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00401072 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2905  O-methyltransferase, putative  50 
 
 
357 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004060  SAM-dependent methyltransferase  51.87 
 
 
355 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2765  O-methyltransferase family protein  50.86 
 
 
363 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.974745  hitchhiker  0.00708299 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1499  methyltransferase type 12  49.44 
 
 
357 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00534816 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1566  methyltransferase type 12  49.16 
 
 
357 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2128  O-methyltransferase, putative  51.01 
 
 
359 aa  371  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1560  methyltransferase type 12  49.16 
 
 
357 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2686  O-methyltransferase family protein  50.57 
 
 
357 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0445752  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2371  O-methyltransferase family protein  50.56 
 
 
359 aa  368  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1698  O-methyltransferase family 2  50.57 
 
 
357 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000510936 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2121  SAM-dependent methyltransferase  48.16 
 
 
356 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.212274  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1862  Methyltransferase type 12  47.44 
 
 
355 aa  360  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1505  O-methyltransferase, putative  50.86 
 
 
359 aa  348  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.538539  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2096  Methyltransferase type 12  45.85 
 
 
357 aa  325  1e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0717  O-methyltransferase family 2  45.14 
 
 
365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5794  Methyltransferase type 12  46.15 
 
 
352 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0204  O-methyltransferase family protein  27.56 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3121  O-methyltransferase family protein  24.67 
 
 
368 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2758  C-20 methyltransferase BchU  28.28 
 
 
339 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.160488  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  23.51 
 
 
328 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6286  O-methyltransferase family 2  29.78 
 
 
361 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2402  methyltransferase type 12  27.41 
 
 
350 aa  57  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09490  putative phenazine-specific methyltransferase  21.65 
 
 
334 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4003  O-methyltransferase, family 2  21.43 
 
 
380 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.414327  decreased coverage  0.000643794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2361  Methyltransferase type 12  30.19 
 
 
337 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0232  O-methyltransferase family protein  27.39 
 
 
338 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2050  O-methyltransferase family 2  26.47 
 
 
377 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141136 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0115  CrtF-related protein  25.98 
 
 
338 aa  54.3  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0181  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  23.95 
 
 
378 aa  54.7  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  25.81 
 
 
335 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2038  O-methyltransferase family protein  25.96 
 
 
379 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.309417  normal  0.146139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  26.45 
 
 
335 aa  53.1  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  27.43 
 
 
334 aa  53.1  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2253  C-20 methyltransferase BchU  26.97 
 
 
339 aa  52.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0616  O-methyltransferase family protein  20.71 
 
 
346 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2661  O-methyltransferase family protein  24.86 
 
 
331 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0889  putative phenazine-specific methyltransferase  22.08 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1211  C-20 methyltransferase BchU  30.84 
 
 
354 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.40685  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  23.81 
 
 
381 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2512  C-20 methyltransferase BchU  25.32 
 
 
339 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.669224  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2496  C-20 methyltransferase BchU  28.28 
 
 
339 aa  49.3  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.409107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  25.64 
 
 
411 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2752  C-20 methyltransferase BchU  26.35 
 
 
339 aa  48.9  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1725  O-methyltransferase family 2  23.93 
 
 
329 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3758  O-methyltransferase family protein  22.7 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542752 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  24.55 
 
 
333 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1908  O-methyltransferase family protein  23.99 
 
 
379 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0280821  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6439  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.76 
 
 
381 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1816  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.38 
 
 
334 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2103  CrtF-related protein  28.97 
 
 
339 aa  47  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2312  O-methyltransferase family 2  26.37 
 
 
353 aa  46.2  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1291  O-methyltransferase family protein  22.26 
 
 
381 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.419968  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2714  O-methyltransferase family protein  25.71 
 
 
339 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0330772  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  26.4 
 
 
358 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6962  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  28.04 
 
 
336 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797096  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0264  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  23.65 
 
 
379 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2184  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.84 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235517  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2230  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.84 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392557  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1418  Methyltransferase type 12  28.81 
 
 
328 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.12101  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2173  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.84 
 
 
363 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190617 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3515  hydroxyneurosporene methyltransferase  22.18 
 
 
376 aa  43.9  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.758284 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1708  O-methyltransferase family 2  20.6 
 
 
373 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4546  O-methyltransferase family 2  26.61 
 
 
352 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2815  O-methyltransferase family protein  27.88 
 
 
341 aa  43.5  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.330603  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2537  O-methyltransferase family 2  26.14 
 
 
339 aa  43.5  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  25.32 
 
 
352 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4077  O-methyltransferase family 2  25.69 
 
 
356 aa  42.7  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0325026  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  24.7 
 
 
356 aa  42.7  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>