More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4188 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3997  adenylosuccinate lyase  98.46 
 
 		 454 aa  925    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00709346  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0215  adenylosuccinate lyase  88.05 
 
 		 454 aa  833    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.314002  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4188  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 454 aa  937    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0170  adenylosuccinate lyase  88.27 
 
 		 454 aa  835    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00265741  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3210  adenylosuccinate lyase  45.72 
 
 		 452 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1630  adenylosuccinate lyase  43.33 
 
 		 477 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18830  adenylosuccinate lyase  42.79 
 
 		 477 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0801563 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0280  adenylosuccinate lyase  41.28 
 
 		 454 aa  368  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1483  fumarate lyase  41.08 
 
 		 450 aa  359  7e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.151746  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21250  adenylosuccinate lyase  41.31 
 
 		 452 aa  354  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0991556  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1393  adenylosuccinate lyase  41.43 
 
 		 455 aa  350  3e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00268576  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1582  adenylosuccinate lyase  41.43 
 
 		 455 aa  350  4e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0014  fumarate lyase  40.41 
 
 		 450 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000353189  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0757  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  40.22 
 
 		 457 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0005  adenylosuccinate lyase  40.62 
 
 		 454 aa  338  1.9999999999999998e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1439  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  39.64 
 
 		 460 aa  332  6e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4374  adenylosuccinate lyase  39.5 
 
 		 451 aa  331  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.25048e-22 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4598  fumarate lyase  37.7 
 
 		 458 aa  322  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.604906  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2745  fumarate lyase  36.97 
 
 		 473 aa  318  9e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.632463  normal  0.0578708 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3487  fumarate lyase  36.49 
 
 		 450 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4409  fumarate lyase  36.12 
 
 		 446 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1121  adenylosuccinate lyase  40.13 
 
 		 447 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2418  fumarate lyase  36.04 
 
 		 448 aa  307  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.259458 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0824  adenylosuccinate lyase  37.67 
 
 		 446 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4557  fumarate lyase  35.59 
 
 		 449 aa  302  9e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3811  fumarate lyase  37.25 
 
 		 449 aa  301  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0794  adenylosuccinate lyase  37.17 
 
 		 449 aa  300  3e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.652976  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4837  fumarate lyase  39.06 
 
 		 450 aa  299  8e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.616525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1631  adenylosuccinate lyase  35.75 
 
 		 483 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1072  adenylosuccinate lyase  39.12 
 
 		 455 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18850  adenylosuccinate lyase  36.12 
 
 		 483 aa  295  9e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.110706 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0986  adenylosuccinate lyase  36.28 
 
 		 448 aa  295  1e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00836427  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2341  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.7 
 
 		 453 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0673  adenylosuccinate lyase  36.97 
 
 		 448 aa  293  4e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0781  adenylosuccinate lyase  37.81 
 
 		 446 aa  289  7e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0994774  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4818  fumarate lyase  38.51 
 
 		 451 aa  289  8e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.327057  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04011  conserved hypothetical protein  35.37 
 
 		 476 aa  287  2.9999999999999996e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.981247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2125  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.84 
 
 		 453 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1160  adenylosuccinate lyase  35.86 
 
 		 446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3622  fumarate lyase  37.21 
 
 		 456 aa  283  6.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1906  putative lyase  34.92 
 
 		 445 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0645  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.16 
 
 		 459 aa  280  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0741414 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2958  adenylosuccinate lyase  34.64 
 
 		 471 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121926  hitchhiker  0.00625137 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1555  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.9 
 
 		 452 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1701  adenylosuccinate lyase  36.61 
 
 		 445 aa  277  3e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.259986  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0048  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.9 
 
 		 452 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1485  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.9 
 
 		 452 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0058  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.9 
 
 		 452 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.593603  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1202  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.9 
 
 		 452 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0069  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.9 
 
 		 452 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.675451  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3127  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.02 
 
 		 457 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0056  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.67 
 
 		 452 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0457569  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0216  adenylosuccinate lyase  36.73 
 
 		 449 aa  274  3e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.595584 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1684  adenylosuccinate lyase  36.5 
 
 		 449 aa  274  3e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.29073  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0294  adenylosuccinate lyase  36.95 
 
 		 449 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.437352  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4459  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.9 
 
 		 476 aa  273  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1273  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.15 
 
 		 454 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4314  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.93 
 
 		 459 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.417348  normal  0.728676 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3160  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.02 
 
 		 457 aa  270  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5054  fumarate lyase  33.03 
 
 		 456 aa  269  8e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0605282  normal  0.269052 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4344  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.15 
 
 		 450 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.339693  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5019  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.02 
 
 		 460 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1379  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.15 
 
 		 450 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.449914  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38190  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.19 
 
 		 450 aa  263  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569484  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1019  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.33 
 
 		 450 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531997 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1218  adenylosuccinate lyase  38.15 
 
 		 445 aa  263  6e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5748  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.56 
 
 		 452 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.955684  normal  0.122503 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0048  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.99 
 
 		 465 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1162  adenylosuccinate lyase  33.63 
 
 		 446 aa  258  1e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1446  adenylosuccinate lyase  33.25 
 
 		 431 aa  257  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.149725  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0393  adenylosuccinate lyase  35.08 
 
 		 430 aa  258  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.623936  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4475  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.02 
 
 		 452 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5023  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.05 
 
 		 462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.261629  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5286  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.33 
 
 		 451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.335784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0255  adenylosuccinate lyase  34.46 
 
 		 431 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00422824  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23110  adenylosuccinate lyase  33.1 
 
 		 431 aa  249  6e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1131  adenylosuccinate lyase  34.62 
 
 		 431 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2151  adenylosuccinate lyase  33.03 
 
 		 431 aa  249  7e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1118  adenylosuccinate lyase  36.3 
 
 		 446 aa  249  7e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.984181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5111  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.91 
 
 		 406 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4015  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.75 
 
 		 490 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0773124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16551  adenylosuccinate lyase  33.97 
 
 		 431 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1963  adenylosuccinate lyase  32.78 
 
 		 431 aa  247  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.739677  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1997  adenylosuccinate lyase  32.78 
 
 		 431 aa  247  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.035377  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2505  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  35.57 
 
 		 452 aa  247  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0315  adenylosuccinate lyase  32.48 
 
 		 431 aa  246  8e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2251  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  36.1 
 
 		 453 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.001838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02830  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.19 
 
 		 459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289129 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16671  adenylosuccinate lyase  34.21 
 
 		 431 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4435  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  37.18 
 
 		 450 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.115184  normal  0.0129696 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4874  fumarate lyase  33.56 
 
 		 456 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0760075  normal  0.0695852 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1558  adenylosuccinate lyase  34.45 
 
 		 431 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4928  adenylosuccinate lyase  33.97 
 
 		 433 aa  243  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000014766  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0316  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  38.55 
 
 		 459 aa  243  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0307  adenylosuccinate lyase  36.52 
 
 		 430 aa  242  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.141521  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0819  adenylosuccinate lyase  35.44 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1536  3-carboxy-cis,cis-muconate cycloisomerase  34.71 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0157227  normal  0.182398 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4233  adenylosuccinate lyase  32.85 
 
 		 431 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273894 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16451  adenylosuccinate lyase  34.29 
 
 		 431 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.721255  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1446  adenylosuccinate lyase  35.07 
 
 		 433 aa  239  1e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000278594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>