More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2628 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2628  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 356 aa  731    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2354  transcriptional regulator, LacI family  92.7 
 
 		 356 aa  681    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1610  transcriptional regulator, LacI family  68.82 
 
 		 356 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.42043  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1641  transcriptional regulator, LacI family  65.73 
 
 		 357 aa  498  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.236948  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1314  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  60.39 
 
 		 357 aa  454  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.499254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3600  LacI family transcription regulator  59.89 
 
 		 360 aa  440  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0280148  normal  0.188315 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03519  putative transcriptional regulator  57.02 
 
 		 364 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0979  LacI family transcription regulator  56.67 
 
 		 360 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0927  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  56.67 
 
 		 360 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03470  hypothetical protein  57.02 
 
 		 356 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3362  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  56.67 
 
 		 360 aa  422  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3669  transcriptional regulator, LacI family  31.71 
 
 		 349 aa  143  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.555961  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1883  transcriptional regulator, LacI family  32.39 
 
 		 350 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1697  transcriptional regulator, LacI family  32.65 
 
 		 351 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0717  transcriptional regulator, LacI family  31.87 
 
 		 344 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3520  transcriptional regulator, LacI family  32.18 
 
 		 349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0665  transcriptional regulator, LacI family  32.07 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0509948  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4007  transcriptional regulator, LacI family  30.41 
 
 		 343 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4336  transcriptional regulator, LacI family  30.99 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563264  hitchhiker  0.000141472 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3579  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.95 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  28.02 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5764  transcriptional regulator LacI family  26.81 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.73775  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5365  transcriptional regulator, LacI family  25.49 
 
 		 345 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000864241  normal  0.850622 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5085  transcriptional regulator, LacI family  26.3 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.127627 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1277  LacI family transcription regulator  28.19 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0780915  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1873  LacI family response repressor  27 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.845568  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  27.33 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1559  alanine racemase  26.82 
 
 		 333 aa  101  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000066632  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0524  alanine racemase  27.3 
 
 		 339 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  24.49 
 
 		 332 aa  100  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  24.78 
 
 		 328 aa  99.8  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  27.94 
 
 		 338 aa  99.8  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2511  transcriptional regulator, LacI family  26.98 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  26.79 
 
 		 333 aa  98.6  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.91 
 
 		 352 aa  96.7  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  24.78 
 
 		 331 aa  96.7  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.59 
 
 		 330 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.59 
 
 		 343 aa  95.9  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.59 
 
 		 343 aa  95.9  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  25.59 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  25.59 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  25.59 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  26.24 
 
 		 359 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.59 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.59 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  28.09 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.59 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  27.19 
 
 		 330 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  27.51 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4573  LacI family transcription regulator  25.73 
 
 		 326 aa  94  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0936264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  28.66 
 
 		 347 aa  93.2  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  27.43 
 
 		 330 aa  93.2  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  24.21 
 
 		 338 aa  92.4  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4039  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.39 
 
 		 341 aa  92.8  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  22.45 
 
 		 336 aa  92.4  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8463  transcriptional regulator, LacI family  29.03 
 
 		 350 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  23.95 
 
 		 348 aa  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0695  transcriptional regulator, LacI family  27.07 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0821691  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.16 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.07 
 
 		 342 aa  91.3  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  38.01 
 
 		 338 aa  90.5  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  24.78 
 
 		 337 aa  90.5  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  24.93 
 
 		 332 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  26 
 
 		 350 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  22.67 
 
 		 347 aa  90.1  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  25.8 
 
 		 339 aa  90.1  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1063  LacI family transcription regulator  27.07 
 
 		 325 aa  89.7  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3491  transcriptional regulator, LacI family  27.67 
 
 		 349 aa  89.7  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.201292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  24.04 
 
 		 332 aa  89.7  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3324  LacI family transcription regulator  26.8 
 
 		 347 aa  89.7  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370251  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  26.53 
 
 		 340 aa  89.7  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.61 
 
 		 333 aa  89.4  8e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  26.55 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  24.92 
 
 		 355 aa  89  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  26.45 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5756  transcriptional regulator, LacI family  31.28 
 
 		 347 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  25.73 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  27.1 
 
 		 353 aa  87.8  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  24.63 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  25.14 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  23.46 
 
 		 341 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  25.21 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2353  LacI family transcription regulator  25.34 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000399478  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  26.43 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  24.63 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  24.63 
 
 		 332 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  24.63 
 
 		 332 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.75 
 
 		 335 aa  87.8  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.25 
 
 		 328 aa  87.8  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0150  transcriptional regulator, LacI family  28.49 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0509  transcriptional regulator, LacI family  24.35 
 
 		 335 aa  87.8  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000057395  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  26.8 
 
 		 337 aa  87  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2290  transcriptional regulator, LacI family  27.86 
 
 		 344 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.950174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3511  transcriptional regulator, LacI family  26.78 
 
 		 341 aa  87  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0677107  normal  0.351268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4438  transcriptional regulator, LacI family  29.39 
 
 		 342 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4339  LacI family transcription regulator  33.98 
 
 		 373 aa  86.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20530  transcriptional regulator, LacI family  23.58 
 
 		 341 aa  87  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1962  transcriptional regulator, LacI family  33.5 
 
 		 352 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  26.65 
 
 		 335 aa  87  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>