More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2548 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2548  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 205 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.552166  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  27.81 
 
 		 211 aa  84.7  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  26.47 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.64 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  32.56 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6040  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.52 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  25.87 
 
 		 213 aa  71.2  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  26.51 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.95 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  25.31 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3064  lysine exporter protein LysE/YggA  30.16 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  31.53 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4042  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.58 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3720  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.58 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4164  RhtB family transporter  30 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  27.16 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  27.67 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2238  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.43 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.44653  normal  0.0272312 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  27.67 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  30.69 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  27.67 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  25.38 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  26.22 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2786  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.38 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8263  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.89 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0435022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14510  putative threonine efflux protein  33.11 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.93793  normal  0.0749541 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  29.78 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  29.05 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0614  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.62 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.355661  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  27.67 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  29.69 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  25.77 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  27.04 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  27.04 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  27.04 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1483  lysine exporter protein LysE/YggA  24.67 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  27.04 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  26.71 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1744  lysine exporter protein LysE/YggA  28.26 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0257251  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4824  lysine exporter protein LysE/YggA  27.54 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.322328  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  28.47 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0356  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.404606 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.91 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  27.91 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  27.4 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  27.91 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  31.16 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  25.38 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  24.5 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  25 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  24.5 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  24.5 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  27.84 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  24.5 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0088  lysine exporter protein LysE/YggA  28.86 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  24.5 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3625  amino acid transporter LysE  27.21 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.22 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  25.13 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1701  amino acid transporter LysE  24.37 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  25.77 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  26.49 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2291  lysine exporter protein LysE/YggA  25.57 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2495  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.57 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000331121  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2237  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.12 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0264903 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.22 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2416  RhtB family transporter  33.1 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  25 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1752  homoserine/threonine efflux protein  26.43 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000289008  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2276  amino acid transporter  23.57 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1890  homoserine/threonine efflux protein  26.43 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.131548  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0074  LysE family amino acid efflux protein  28.86 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2108  lysine exporter protein LysE/YggA  26.53 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.451447 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1925  putative homoserine/threonine efflux protein  24.37 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82308e-38 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.77 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  28.4 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  26.62 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  27.21 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3116  hypothetical protein  32.2 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  27.21 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  27.21 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  27.21 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  27.21 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3843  hypothetical protein  32.2 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.27 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  27.48 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  27.48 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2183  lysine exporter protein LysE/YggA  23.57 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0747  hypothetical protein  32.2 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  25.48 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  27.48 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  30.52 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04744  putative threonine efflux protein  29.23 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  27.48 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  22.75 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  29.25 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29500  putative threonine efflux protein  25.4 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.585854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4435  lysine exporter protein LysE/YggA  31.5 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2805  lysine exporter protein LysE/YggA  25.95 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0593  lysine exporter protein LysE/YggA  29.85 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>