More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0975 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  100 
 
 		 361 aa  741    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  95.84 
 
 		 361 aa  717    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  65.83 
 
 		 361 aa  484  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  61.77 
 
 		 369 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  60.94 
 
 		 368 aa  448  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  60.94 
 
 		 368 aa  448  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  60.39 
 
 		 360 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1322  ABC transporter related protein  60.11 
 
 		 360 aa  441  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  60.94 
 
 		 366 aa  443  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2512  ABC transporter ATP-binding protein  58.1 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.408974  normal  0.94843 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  55.9 
 
 		 367 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  55.52 
 
 		 369 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  56.63 
 
 		 360 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  55.52 
 
 		 368 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  55.52 
 
 		 368 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  55.96 
 
 		 360 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  57.18 
 
 		 351 aa  396  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  55 
 
 		 369 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  55.19 
 
 		 369 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  55.83 
 
 		 369 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.46 
 
 		 365 aa  395  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  60.57 
 
 		 369 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.8 
 
 		 370 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  55.8 
 
 		 370 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  52.66 
 
 		 372 aa  391  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  53.83 
 
 		 369 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.8 
 
 		 370 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.8 
 
 		 370 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.8 
 
 		 370 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.8 
 
 		 388 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  55.8 
 
 		 370 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3324  ABC transporter related  55.77 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  54.37 
 
 		 369 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0699  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.19 
 
 		 370 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0789  ABC transporter  55.74 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3481  ABC transporter related  56.5 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  55.07 
 
 		 369 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  52.1 
 
 		 368 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  54.17 
 
 		 357 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.83 
 
 		 369 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.87 
 
 		 351 aa  383  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7445  ABC transporter related  52.35 
 
 		 371 aa  381  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3840  ABC transporter related  55.06 
 
 		 351 aa  380  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  51.25 
 
 		 367 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  55.18 
 
 		 376 aa  378  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  54.47 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  54.75 
 
 		 358 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  53.33 
 
 		 369 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  52.89 
 
 		 370 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  52.23 
 
 		 395 aa  375  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  54.62 
 
 		 380 aa  376  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  53.06 
 
 		 357 aa  378  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.65 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  52.63 
 
 		 364 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.08 
 
 		 365 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.35 
 
 		 365 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0359  ABC transporter related  52.78 
 
 		 362 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  53.46 
 
 		 354 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  52.92 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  53.28 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  52.78 
 
 		 333 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  52.46 
 
 		 366 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3324  ABC transporter-related protein  53.24 
 
 		 378 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  53.22 
 
 		 368 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  52.92 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  54.29 
 
 		 359 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.27 
 
 		 365 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.46 
 
 		 333 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6242  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (maltose/maltodextrin)  49.32 
 
 		 377 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  54.12 
 
 		 359 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  51.25 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4584  ABC transporter related  50.94 
 
 		 384 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  53.14 
 
 		 365 aa  366  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3941  ABC transporter related  51.69 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.254931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  50.69 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  52.11 
 
 		 353 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5678  ABC transporter related  53.55 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209131  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2858  ABC transporter related  54.79 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3198  ABC transporter related  51.35 
 
 		 382 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  53.02 
 
 		 391 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3412  ABC transporter related  54.12 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  53.59 
 
 		 333 aa  364  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  50.69 
 
 		 370 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4470  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  51.4 
 
 		 369 aa  364  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  52.35 
 
 		 353 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 		 367 aa  363  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  49.18 
 
 		 371 aa  364  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2353  ABC transporter related  51.62 
 
 		 383 aa  363  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175243  normal  0.108483 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.19 
 
 		 333 aa  363  4e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3556  ABC transporter related  53.78 
 
 		 359 aa  362  5.0000000000000005e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  52.08 
 
 		 353 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  52.51 
 
 		 361 aa  362  6e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  51.8 
 
 		 375 aa  362  6e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  51.38 
 
 		 356 aa  361  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0391  ABC transporter related  51.67 
 
 		 362 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53752  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  50.98 
 
 		 333 aa  360  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  51.39 
 
 		 333 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  52.38 
 
 		 332 aa  360  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  52.11 
 
 		 368 aa  359  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.51 
 
 		 369 aa  360  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>