291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_5060 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_5060  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 		 483 aa  950    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  49.79 
 
 		 484 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  50.1 
 
 		 485 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4096  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  48.98 
 
 		 488 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  42.71 
 
 		 488 aa  364  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  40.13 
 
 		 492 aa  358  9.999999999999999e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  41.88 
 
 		 488 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  42.08 
 
 		 488 aa  355  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  46.65 
 
 		 493 aa  354  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  41.67 
 
 		 488 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.67 
 
 		 488 aa  354  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  41.67 
 
 		 488 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.67 
 
 		 488 aa  354  2e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  41.67 
 
 		 488 aa  354  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  42.65 
 
 		 488 aa  353  4e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.12 
 
 		 493 aa  346  6e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  42.86 
 
 		 498 aa  342  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  45.55 
 
 		 493 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  41.86 
 
 		 497 aa  332  7.000000000000001e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  39.38 
 
 		 490 aa  331  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  42.47 
 
 		 490 aa  331  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.14 
 
 		 486 aa  331  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.71 
 
 		 497 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  39 
 
 		 487 aa  329  6e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  50 
 
 		 487 aa  329  8e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  40.62 
 
 		 486 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  40.62 
 
 		 486 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  40.62 
 
 		 486 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.62 
 
 		 486 aa  327  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  40.62 
 
 		 486 aa  327  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  40.41 
 
 		 486 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  40.41 
 
 		 486 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  49.52 
 
 		 498 aa  326  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  49.52 
 
 		 489 aa  326  6e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  49.52 
 
 		 489 aa  326  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  49.29 
 
 		 489 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  49.29 
 
 		 489 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  49.29 
 
 		 489 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  49.29 
 
 		 489 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.55 
 
 		 490 aa  325  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  40.55 
 
 		 490 aa  325  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  40.41 
 
 		 486 aa  324  3e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.96 
 
 		 495 aa  323  5e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  42.58 
 
 		 488 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  49.51 
 
 		 505 aa  321  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  44.47 
 
 		 510 aa  321  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  40.3 
 
 		 486 aa  318  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  39.7 
 
 		 490 aa  318  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3245  D-mannonate oxidoreductase  40.42 
 
 		 490 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  42.16 
 
 		 488 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3321  D-mannonate oxidoreductase  40.42 
 
 		 490 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  39.83 
 
 		 490 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  48.51 
 
 		 491 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  45 
 
 		 485 aa  317  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  40.55 
 
 		 490 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.39 
 
 		 495 aa  318  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.09 
 
 		 486 aa  317  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  42.16 
 
 		 488 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  41.56 
 
 		 490 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  42.16 
 
 		 488 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  42.16 
 
 		 488 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.51 
 
 		 486 aa  317  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  41.56 
 
 		 490 aa  316  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  41.56 
 
 		 490 aa  316  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  41.56 
 
 		 490 aa  316  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  40.3 
 
 		 486 aa  316  7e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.55 
 
 		 494 aa  316  8e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  41.56 
 
 		 490 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  40.09 
 
 		 486 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  39.87 
 
 		 486 aa  313  4.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  39.87 
 
 		 486 aa  312  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  39.87 
 
 		 486 aa  312  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  39.66 
 
 		 486 aa  312  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.5 
 
 		 490 aa  311  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  39.24 
 
 		 487 aa  310  2.9999999999999997e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  38.38 
 
 		 491 aa  310  4e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  42.86 
 
 		 492 aa  309  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.65 
 
 		 497 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  41.03 
 
 		 499 aa  307  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  43.01 
 
 		 496 aa  307  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.38 
 
 		 488 aa  303  6.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  38.59 
 
 		 488 aa  301  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  42.65 
 
 		 478 aa  301  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1859  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  48.13 
 
 		 470 aa  299  7e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0096  mannitol dehydrogenase  42.73 
 
 		 477 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.027752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  40.58 
 
 		 491 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1732  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.73 
 
 		 477 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0789  mannitol dehydrogenase family protein  45.61 
 
 		 358 aa  296  6e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000484963  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.97 
 
 		 493 aa  295  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.49 
 
 		 491 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  47.83 
 
 		 509 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.26 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.26 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1685  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.62 
 
 		 477 aa  289  7e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.13 
 
 		 490 aa  286  5.999999999999999e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  42.4 
 
 		 459 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  39.05 
 
 		 489 aa  284  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  38.52 
 
 		 520 aa  283  6.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  40.82 
 
 		 470 aa  282  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2353  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.79 
 
 		 494 aa  282  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0871118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>