52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4754 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4754  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  906    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.512063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1793  putative signal peptide  51.1 
 
 		 448 aa  418  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11444 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  47.06 
 
 		 451 aa  405  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0438  hypothetical protein  46.8 
 
 		 448 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5264  hypothetical protein  47.25 
 
 		 452 aa  395  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1224  hypothetical protein  46.8 
 
 		 448 aa  394  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0371  hypothetical protein  46.8 
 
 		 448 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  46.74 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4733  hypothetical protein  48.14 
 
 		 454 aa  391  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0107  hypothetical protein  46.1 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4785  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  44.1 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432202  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1723  hypothetical protein  47.72 
 
 		 464 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.532519  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1841  hypothetical protein  45.41 
 
 		 451 aa  375  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3903  hypothetical protein  45.43 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4103  hypothetical protein  44.78 
 
 		 451 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.901263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3317  periplasmic protein  48.63 
 
 		 473 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3050  hypothetical protein  45.56 
 
 		 458 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1281  hypothetical protein  46.03 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0797  putative signal peptide protein  45.19 
 
 		 452 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.532583 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1319  hypothetical protein  44.55 
 
 		 452 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1247  hypothetical protein  45.05 
 
 		 452 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171773  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1100  hypothetical protein  44.34 
 
 		 452 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  36.85 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  36.85 
 
 		 441 aa  318  2e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  39.14 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  39.39 
 
 		 415 aa  217  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  38.86 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  33.99 
 
 		 457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  33.77 
 
 		 457 aa  199  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.93 
 
 		 769 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4473  putative signal peptide protein  47.34 
 
 		 208 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  30.35 
 
 		 487 aa  127  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.15 
 
 		 1027 aa  119  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  47.73 
 
 		 1372 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1103  protein of unknown function DUF1555  29.05 
 
 		 501 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428306  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49693  predicted protein  25.83 
 
 		 525 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1074  protein of unknown function DUF1555  28.51 
 
 		 501 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1822  hypothetical protein  29.25 
 
 		 451 aa  54.3  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.430536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0611  hypothetical protein  35.34 
 
 		 470 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1211  hypothetical protein  28.5 
 
 		 504 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.816612  normal  0.530795 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1903  hypothetical protein  27.37 
 
 		 494 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000927643 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6147  hypothetical protein  27.46 
 
 		 494 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4265  hypothetical protein  26.67 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223589  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2094  hypothetical protein  29.37 
 
 		 451 aa  48.5  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1229  hypothetical protein  27.1 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3233  hypothetical protein  26.74 
 
 		 495 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4876  hypothetical protein  25.49 
 
 		 457 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1010  hypothetical protein  24.83 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4951  hypothetical protein  26.76 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0822619 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1224  hypothetical protein  26.35 
 
 		 472 aa  44.3  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2450  hypothetical protein  25.69 
 
 		 461 aa  44.3  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3529  hypothetical protein  30.3 
 
 		 495 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0210661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>