More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4548 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2129  aldehyde dehydrogenase  67.83 
 
 		 461 aa  647    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2318  putative aldehyde dehydrogenase  76.19 
 
 		 462 aa  683    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2632  Aldehyde Dehydrogenase  66.3 
 
 		 461 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.440837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1611  aldehyde dehydrogenase  75.76 
 
 		 462 aa  680    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.917545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0992  aldehyde dehydrogenase  76.19 
 
 		 462 aa  684    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2892  Aldehyde Dehydrogenase  65.86 
 
 		 461 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4548  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 462 aa  939    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.676442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2782  aldehyde dehydrogenase  65.73 
 
 		 460 aa  628  1e-179  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1869  aldehyde dehydrogenase  66.08 
 
 		 461 aa  623  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0287764  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0680  aldehyde dehydrogenase  65.29 
 
 		 459 aa  561  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429817  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3882  aldehyde dehydrogenase  59.26 
 
 		 461 aa  543  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0771  Aldehyde Dehydrogenase  58.46 
 
 		 462 aa  522  1e-147  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0677  aldehyde dehydrogenase  58.04 
 
 		 462 aa  509  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  0.53339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2793  aldehyde dehydrogenase  55.39 
 
 		 464 aa  498  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145836  normal  0.229577 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2177  hypothetical protein  51.74 
 
 		 465 aa  482  1e-135  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2102  aldehyde dehydrogenase  52.95 
 
 		 471 aa  483  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0577073  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4672  Aldehyde Dehydrogenase  53.28 
 
 		 489 aa  481  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.8 
 
 		 466 aa  481  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2531  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  52.76 
 
 		 492 aa  481  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2205  hypothetical protein  50.87 
 
 		 465 aa  478  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2389  aldehyde dehydrogenase  54.95 
 
 		 487 aa  457  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07141  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein (Eurofung)  41.85 
 
 		 466 aa  372  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.549697 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01720  aldehyde dehydrogenase, putative  42.37 
 
 		 477 aa  365  1e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.265916  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4025  Aldehyde Dehydrogenase  43.44 
 
 		 463 aa  330  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4702  aldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 		 457 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0107  aldehyde dehydrogenase  38.44 
 
 		 455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1238  Aldehyde Dehydrogenase  36.44 
 
 		 454 aa  280  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  38.7 
 
 		 522 aa  263  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  32.89 
 
 		 455 aa  249  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  38.2 
 
 		 510 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  36.54 
 
 		 533 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  35.33 
 
 		 521 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4269  Aldehyde Dehydrogenase  35.48 
 
 		 496 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.09 
 
 		 487 aa  230  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  36.34 
 
 		 505 aa  229  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08406  succinate-semialdehyde dehydrogenase  30.31 
 
 		 449 aa  230  5e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6908  aldehyde dehydrogenase  34.3 
 
 		 483 aa  229  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2321  Aldehyde Dehydrogenase  31.88 
 
 		 466 aa  228  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1620  aldehyde dehydrogenase  29.61 
 
 		 454 aa  228  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  37.39 
 
 		 504 aa  229  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0821  aldehyde dehydrogenase  33.56 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.376923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1834  aldehyde dehydrogenase  30.91 
 
 		 469 aa  227  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.235892  normal  0.722777 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2457  aldehyde dehydrogenase  32.36 
 
 		 463 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1299  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  30.09 
 
 		 470 aa  226  7e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410405  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2008  Aldehyde Dehydrogenase  34.68 
 
 		 465 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1442  hypothetical protein  30.02 
 
 		 462 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04229  5-carboxy-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  33.33 
 
 		 488 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04195  hypothetical protein  33.33 
 
 		 488 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1940  aldehyde dehydrogenase  29.82 
 
 		 454 aa  224  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.613178  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3703  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  33.56 
 
 		 488 aa  224  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1971  aldehyde dehydrogenase  31.5 
 
 		 460 aa  224  4e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2446  aldehyde dehydrogenase  34.27 
 
 		 478 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1177  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  33.56 
 
 		 488 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.585771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1212  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  33.56 
 
 		 488 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.55 
 
 		 496 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1197  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  33.56 
 
 		 488 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1061  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  33.56 
 
 		 488 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1166  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  33.33 
 
 		 488 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal  0.856893 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1541  hypothetical protein  29.8 
 
 		 462 aa  223  6e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4889  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  33.33 
 
 		 488 aa  223  8e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4583  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  33.33 
 
 		 488 aa  223  8e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0222  aldehyde dehydrogenase  32.5 
 
 		 456 aa  222  9.999999999999999e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3463  aldehyde dehydrogenase  36.08 
 
 		 497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506857  normal  0.23094 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5835  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.6 
 
 		 488 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  34.3 
 
 		 473 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2306  aldehyde dehydrogenase  36.08 
 
 		 497 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3276  aldehyde dehydrogenase  33.92 
 
 		 463 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0875007 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  38.86 
 
 		 518 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.62 
 
 		 521 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2222  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  42.19 
 
 		 489 aa  220  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0132587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6328  Aldehyde Dehydrogenase  33.93 
 
 		 460 aa  220  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0373532  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  34.75 
 
 		 494 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4188  aldehyde dehydrogenase  33.33 
 
 		 452 aa  219  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3589  aldehyde dehydrogenase  32.61 
 
 		 475 aa  219  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.927653  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2260  Phenylacetaldehyde dehydrogenase  34.9 
 
 		 499 aa  219  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218221  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2474  aldehyde dehydrogenase  35.65 
 
 		 497 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0523  putative aldehyde dehydrogenase  32.51 
 
 		 460 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0293  aldehyde dehydrogenase  33.41 
 
 		 477 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1570  phenylacetaldehyde dehydrogenase  34.9 
 
 		 499 aa  219  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  31.78 
 
 		 490 aa  219  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2459  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  32.96 
 
 		 488 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10225  aldehyde dehydrogenase  33.33 
 
 		 487 aa  218  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.749667  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3151  aldehyde dehydrogenase family protein  32.87 
 
 		 461 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3135  aldehyde dehydrogenase  30.68 
 
 		 463 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1425  aldehyde dehydrogenase  32.17 
 
 		 484 aa  218  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2894  aldehyde dehydrogenase  32.64 
 
 		 461 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1646  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  34.37 
 
 		 462 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00984812  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  36.36 
 
 		 461 aa  216  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1708  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.42 
 
 		 494 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  32.18 
 
 		 490 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2946  aldehyde dehydrogenase  35.02 
 
 		 497 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.264552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9116  Betaine-aldehyde dehydrogenase  37.03 
 
 		 484 aa  216  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2363  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  32.74 
 
 		 488 aa  216  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.702786  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  32.68 
 
 		 490 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4860  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  36.99 
 
 		 491 aa  216  8e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0955697 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  35.19 
 
 		 493 aa  216  9e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2270  phenylacetaldehyde dehydrogenase  34.68 
 
 		 499 aa  216  9e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1759  aldehyde dehydrogenase B  32.15 
 
 		 486 aa  216  9e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.78 
 
 		 494 aa  216  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1188  aldehyde dehydrogenase  35.68 
 
 		 461 aa  216  9e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>