More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2531 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2102  aldehyde dehydrogenase  73.32 
 
 		 471 aa  714    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0577073  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2531  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 492 aa  1020    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0677  aldehyde dehydrogenase  64.4 
 
 		 462 aa  632  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  0.53339 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2205  hypothetical protein  63.3 
 
 		 465 aa  630  1e-179  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2177  hypothetical protein  62.86 
 
 		 465 aa  630  1e-179  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4672  Aldehyde Dehydrogenase  58.86 
 
 		 489 aa  592  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0771  Aldehyde Dehydrogenase  59.52 
 
 		 462 aa  576  1.0000000000000001e-163  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.57 
 
 		 466 aa  573  1.0000000000000001e-162  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2793  aldehyde dehydrogenase  56.48 
 
 		 464 aa  552  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145836  normal  0.229577 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2389  aldehyde dehydrogenase  55.26 
 
 		 487 aa  526  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3882  aldehyde dehydrogenase  54.29 
 
 		 461 aa  505  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2632  Aldehyde Dehydrogenase  52.97 
 
 		 461 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.440837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2892  Aldehyde Dehydrogenase  52.97 
 
 		 461 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1869  aldehyde dehydrogenase  53.41 
 
 		 461 aa  491  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0287764  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2129  aldehyde dehydrogenase  52.97 
 
 		 461 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2782  aldehyde dehydrogenase  52.76 
 
 		 460 aa  486  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1611  aldehyde dehydrogenase  52.31 
 
 		 462 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.917545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4548  aldehyde dehydrogenase  52.76 
 
 		 462 aa  459  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.676442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2318  putative aldehyde dehydrogenase  51.43 
 
 		 462 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0992  aldehyde dehydrogenase  51.43 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0680  aldehyde dehydrogenase  50.99 
 
 		 459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429817  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07141  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein (Eurofung)  45.45 
 
 		 466 aa  418  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.549697 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01720  aldehyde dehydrogenase, putative  44.83 
 
 		 477 aa  396  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.265916  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4025  Aldehyde Dehydrogenase  43.49 
 
 		 463 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4702  aldehyde dehydrogenase  37.44 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1238  Aldehyde Dehydrogenase  37 
 
 		 454 aa  276  5e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  35.75 
 
 		 455 aa  272  1e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0107  aldehyde dehydrogenase  35.28 
 
 		 455 aa  264  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08406  succinate-semialdehyde dehydrogenase  33.1 
 
 		 449 aa  248  2e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1940  aldehyde dehydrogenase  33.56 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.613178  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1971  aldehyde dehydrogenase  33.11 
 
 		 460 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  36.48 
 
 		 533 aa  241  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0222  aldehyde dehydrogenase  33.03 
 
 		 456 aa  240  5e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  33.56 
 
 		 457 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  33.76 
 
 		 510 aa  236  6e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1159  Aldehyde Dehydrogenase  33.56 
 
 		 466 aa  236  9e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2100  Aldehyde Dehydrogenase  31.8 
 
 		 457 aa  236  9e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.773732  normal  0.123203 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15470  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  33.77 
 
 		 458 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.580059  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2695  Aldehyde Dehydrogenase  34.27 
 
 		 453 aa  234  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0816293  normal  0.880648 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0821  aldehyde dehydrogenase  33.18 
 
 		 457 aa  234  3e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.376923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4057  Aldehyde Dehydrogenase  31.41 
 
 		 457 aa  234  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2321  Aldehyde Dehydrogenase  32.17 
 
 		 466 aa  231  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1006  Aldehyde Dehydrogenase  32.43 
 
 		 463 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  34.62 
 
 		 479 aa  231  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0984  aldehyde dehydrogenase  32.43 
 
 		 463 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  34.62 
 
 		 479 aa  230  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1018  aldehyde dehydrogenase  32.43 
 
 		 463 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.752265  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  34.4 
 
 		 479 aa  229  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0395  betaine-aldehyde dehydrogenase  33.65 
 
 		 475 aa  230  6e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  34.4 
 
 		 479 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3357  aldehyde dehydrogenase  32.43 
 
 		 463 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  33.98 
 
 		 479 aa  229  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  34.4 
 
 		 479 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4269  Aldehyde Dehydrogenase  33.47 
 
 		 496 aa  229  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2660  aldehyde dehydrogenase family protein  32.51 
 
 		 463 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.349181  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2400  Aldehyde Dehydrogenase  34.13 
 
 		 463 aa  228  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  33.49 
 
 		 522 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  34.4 
 
 		 479 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  34.4 
 
 		 479 aa  227  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2946  aldehyde dehydrogenase  32.21 
 
 		 463 aa  227  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  32.47 
 
 		 482 aa  228  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  34.17 
 
 		 479 aa  227  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  34.17 
 
 		 479 aa  227  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1321  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  34.78 
 
 		 443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  33.26 
 
 		 490 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.97 
 
 		 482 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  33.48 
 
 		 485 aa  225  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0333  Aldehyde Dehydrogenase  32.31 
 
 		 452 aa  225  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.909996  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1098  Aldehyde Dehydrogenase  33.47 
 
 		 476 aa  225  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3527  aldehyde dehydrogenase  34.81 
 
 		 495 aa  225  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000694209  normal  0.0931426 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  32.47 
 
 		 501 aa  224  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  34.4 
 
 		 477 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1442  hypothetical protein  31.73 
 
 		 462 aa  224  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  31.96 
 
 		 461 aa  224  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1541  hypothetical protein  31.51 
 
 		 462 aa  223  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  35.73 
 
 		 504 aa  223  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1120  aldehyde dehydrogenase  32.37 
 
 		 485 aa  222  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000801479 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0508  aldehyde dehydrogenase  31.22 
 
 		 456 aa  222  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1887  aldehyde dehydrogenase  31.73 
 
 		 456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  31.73 
 
 		 465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.909574  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  33.26 
 
 		 498 aa  221  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  31.91 
 
 		 493 aa  220  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4244  aldehyde dehydrogenase  30.21 
 
 		 452 aa  219  7e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2448  aldehyde dehydrogenase  29.75 
 
 		 452 aa  219  7e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.39 
 
 		 540 aa  219  7.999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2711  Aldehyde Dehydrogenase  31.82 
 
 		 464 aa  219  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.275428  hitchhiker  0.000000324245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3276  aldehyde dehydrogenase  30.68 
 
 		 463 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0875007 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9222  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  32.66 
 
 		 463 aa  219  8.999999999999998e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4095  Aldehyde Dehydrogenase  32.92 
 
 		 531 aa  218  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4876  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  31.67 
 
 		 456 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3815  aldehyde dehydrogenase  32.95 
 
 		 501 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.397992 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  32.68 
 
 		 490 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2488  succinic-semialdehyde dehydrogenase, putative  32.05 
 
 		 463 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4853  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  31.67 
 
 		 456 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  28.76 
 
 		 484 aa  218  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  31.34 
 
 		 473 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0756  aldehyde dehydrogenase  32.8 
 
 		 479 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000284676  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63844  mitochondrial aldehyde dehydrogenase  31.83 
 
 		 501 aa  217  2.9999999999999998e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.704992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1749  lactaldehyde dehydrogenase  33.8 
 
 		 481 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.451931  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0388  Aldehyde Dehydrogenase_  32.03 
 
 		 458 aa  217  4e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000227501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>