More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2102 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2531  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  73.32 
 
 		 492 aa  714    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0677  aldehyde dehydrogenase  64.99 
 
 		 462 aa  641    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  0.53339 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2102  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 471 aa  978    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0577073  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2177  hypothetical protein  63.32 
 
 		 465 aa  632  1e-180  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2205  hypothetical protein  63.32 
 
 		 465 aa  630  1e-179  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4672  Aldehyde Dehydrogenase  60.65 
 
 		 489 aa  607  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.87 
 
 		 466 aa  590  1e-167  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0771  Aldehyde Dehydrogenase  59.52 
 
 		 462 aa  572  1.0000000000000001e-162  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2793  aldehyde dehydrogenase  57.77 
 
 		 464 aa  565  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145836  normal  0.229577 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3882  aldehyde dehydrogenase  53.83 
 
 		 461 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2389  aldehyde dehydrogenase  53.58 
 
 		 487 aa  514  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2892  Aldehyde Dehydrogenase  53.58 
 
 		 461 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2129  aldehyde dehydrogenase  53.8 
 
 		 461 aa  506  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2632  Aldehyde Dehydrogenase  53.36 
 
 		 461 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.440837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2782  aldehyde dehydrogenase  52.94 
 
 		 460 aa  503  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1869  aldehyde dehydrogenase  53.61 
 
 		 461 aa  504  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0287764  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2318  putative aldehyde dehydrogenase  51.97 
 
 		 462 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0680  aldehyde dehydrogenase  52.74 
 
 		 459 aa  461  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429817  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0992  aldehyde dehydrogenase  51.97 
 
 		 462 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1611  aldehyde dehydrogenase  51.75 
 
 		 462 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.917545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4548  aldehyde dehydrogenase  55.24 
 
 		 462 aa  461  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.676442  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07141  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein (Eurofung)  45.69 
 
 		 466 aa  414  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.549697 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01720  aldehyde dehydrogenase, putative  43.68 
 
 		 477 aa  395  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.265916  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4025  Aldehyde Dehydrogenase  41.79 
 
 		 463 aa  323  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4702  aldehyde dehydrogenase  36.3 
 
 		 457 aa  296  6e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1238  Aldehyde Dehydrogenase  34.66 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0107  aldehyde dehydrogenase  33.92 
 
 		 455 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  33.48 
 
 		 455 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0821  aldehyde dehydrogenase  33.92 
 
 		 457 aa  256  6e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.376923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08406  succinate-semialdehyde dehydrogenase  32.97 
 
 		 449 aa  254  3e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2100  Aldehyde Dehydrogenase  32.61 
 
 		 457 aa  253  6e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.773732  normal  0.123203 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0391  aldehyde dehydrogenase  36.19 
 
 		 454 aa  250  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.641534  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1971  aldehyde dehydrogenase  32.82 
 
 		 460 aa  248  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1940  aldehyde dehydrogenase  34.77 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.613178  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2363  putative aldehyde dehydrogenase  32.54 
 
 		 460 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.97252  normal  0.760818 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0508  aldehyde dehydrogenase  31.51 
 
 		 456 aa  239  5.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2946  aldehyde dehydrogenase  32.61 
 
 		 463 aa  239  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3357  aldehyde dehydrogenase  32.46 
 
 		 463 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0160  aldehyde dehydrogenase  33.62 
 
 		 456 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0395  betaine-aldehyde dehydrogenase  33.93 
 
 		 475 aa  238  2e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0462  aldehyde dehydrogenase  32.62 
 
 		 526 aa  237  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.433916  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1321  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  34.5 
 
 		 443 aa  236  6e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00454  aldehyde-dehydrogenase like protein YneI  32.4 
 
 		 454 aa  236  7e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0760178  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  30.94 
 
 		 466 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1006  Aldehyde Dehydrogenase  32.68 
 
 		 463 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0984  aldehyde dehydrogenase  32.68 
 
 		 463 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2695  Aldehyde Dehydrogenase  34.73 
 
 		 453 aa  233  6e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0816293  normal  0.880648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1018  aldehyde dehydrogenase  32.68 
 
 		 463 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.752265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4244  aldehyde dehydrogenase  31.93 
 
 		 452 aa  232  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0139  Aldehyde Dehydrogenase  32.53 
 
 		 451 aa  232  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2400  Aldehyde Dehydrogenase  33.17 
 
 		 463 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1188  aldehyde dehydrogenase  34.7 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417271  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3276  aldehyde dehydrogenase  34.3 
 
 		 463 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0875007 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2446  aldehyde dehydrogenase  32.76 
 
 		 478 aa  231  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1442  hypothetical protein  32.08 
 
 		 462 aa  230  5e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15470  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  31.24 
 
 		 458 aa  229  6e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.580059  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1346  Aldehyde Dehydrogenase  30.24 
 
 		 454 aa  229  6e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.211595  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1541  hypothetical protein  31.2 
 
 		 462 aa  229  8e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3151  aldehyde dehydrogenase family protein  31.43 
 
 		 461 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  33.4 
 
 		 533 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0523  putative aldehyde dehydrogenase  30.67 
 
 		 460 aa  229  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2563  aldehyde dehydrogenase  31.87 
 
 		 461 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2660  aldehyde dehydrogenase family protein  32 
 
 		 463 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.349181  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2704  aldehyde dehydrogenase  31.21 
 
 		 461 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598513 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0222  aldehyde dehydrogenase  30.96 
 
 		 456 aa  227  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3815  aldehyde dehydrogenase  33.05 
 
 		 501 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.397992 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.26 
 
 		 479 aa  227  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4876  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  30.2 
 
 		 456 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2394  aldehyde dehydrogenase  33.58 
 
 		 463 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0666523  normal  0.869122 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1887  aldehyde dehydrogenase  32.54 
 
 		 456 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0050  phenylacetaldehyde dehydrogenase  33.88 
 
 		 501 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.03 
 
 		 479 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1124  aldehyde dehydrogenase family protein  32.61 
 
 		 458 aa  226  6e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.115238  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4853  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  30.2 
 
 		 456 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4057  Aldehyde Dehydrogenase  29.04 
 
 		 457 aa  226  7e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  33.03 
 
 		 479 aa  226  8e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.03 
 
 		 479 aa  226  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1681  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  31.56 
 
 		 462 aa  226  9e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.956976  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0714  betaine aldehyde dehydrogenase  33.12 
 
 		 487 aa  226  9e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0388139  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  31.67 
 
 		 461 aa  226  9e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01482  predicted aldehyde dehydrogenase  31.56 
 
 		 462 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2121  Aldehyde Dehydrogenase  31.56 
 
 		 462 aa  225  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0323198  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2488  succinic-semialdehyde dehydrogenase, putative  31.81 
 
 		 463 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101295  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.03 
 
 		 479 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  33.03 
 
 		 479 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2133  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  31.56 
 
 		 462 aa  225  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1725  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  31.63 
 
 		 462 aa  225  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.875923  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.03 
 
 		 479 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1607  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  31.56 
 
 		 462 aa  225  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.764255  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01493  hypothetical protein  31.56 
 
 		 462 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.03 
 
 		 479 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2711  Aldehyde Dehydrogenase  31.49 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.275428  hitchhiker  0.000000324245 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1647  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  31.56 
 
 		 462 aa  225  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0388  Aldehyde Dehydrogenase_  31.61 
 
 		 458 aa  224  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000227501  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4188  aldehyde dehydrogenase  31.96 
 
 		 452 aa  225  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.03 
 
 		 479 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0333  Aldehyde Dehydrogenase  31.22 
 
 		 452 aa  225  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.909996  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1159  Aldehyde Dehydrogenase  31.43 
 
 		 466 aa  224  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4778  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  29.98 
 
 		 456 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5835  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  30.56 
 
 		 488 aa  224  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>