More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2793 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2793  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 464 aa  951    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145836  normal  0.229577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4672  Aldehyde Dehydrogenase  64.41 
 
 		 489 aa  615  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.17 
 
 		 466 aa  595  1e-169  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2205  hypothetical protein  59.91 
 
 		 465 aa  591  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2177  hypothetical protein  59.91 
 
 		 465 aa  591  1e-167  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2389  aldehyde dehydrogenase  63.08 
 
 		 487 aa  590  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0771  Aldehyde Dehydrogenase  61.84 
 
 		 462 aa  584  1.0000000000000001e-165  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0677  aldehyde dehydrogenase  60.04 
 
 		 462 aa  570  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  0.53339 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2102  aldehyde dehydrogenase  57.77 
 
 		 471 aa  565  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0577073  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2531  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  56.48 
 
 		 492 aa  552  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3882  aldehyde dehydrogenase  58.01 
 
 		 461 aa  545  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2129  aldehyde dehydrogenase  54.68 
 
 		 461 aa  506  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2782  aldehyde dehydrogenase  52.92 
 
 		 460 aa  502  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2632  Aldehyde Dehydrogenase  53.81 
 
 		 461 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.440837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2892  Aldehyde Dehydrogenase  53.16 
 
 		 461 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1869  aldehyde dehydrogenase  54.03 
 
 		 461 aa  496  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0287764  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1611  aldehyde dehydrogenase  55.6 
 
 		 462 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.917545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2318  putative aldehyde dehydrogenase  54.96 
 
 		 462 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0992  aldehyde dehydrogenase  55.17 
 
 		 462 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4548  aldehyde dehydrogenase  55.39 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.676442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0680  aldehyde dehydrogenase  55.08 
 
 		 459 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429817  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01720  aldehyde dehydrogenase, putative  45.79 
 
 		 477 aa  416  9.999999999999999e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.265916  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07141  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein (Eurofung)  45.36 
 
 		 466 aa  413  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.549697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4025  Aldehyde Dehydrogenase  46.98 
 
 		 463 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4702  aldehyde dehydrogenase  38.91 
 
 		 457 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0107  aldehyde dehydrogenase  37.72 
 
 		 455 aa  305  8.000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1238  Aldehyde Dehydrogenase  34.42 
 
 		 454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0821  aldehyde dehydrogenase  35.4 
 
 		 457 aa  263  6e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.376923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4244  aldehyde dehydrogenase  34.02 
 
 		 452 aa  249  8e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2100  Aldehyde Dehydrogenase  33.19 
 
 		 457 aa  248  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.773732  normal  0.123203 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3815  aldehyde dehydrogenase  35.24 
 
 		 501 aa  247  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.397992 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1940  aldehyde dehydrogenase  33.33 
 
 		 454 aa  246  6e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.613178  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1971  aldehyde dehydrogenase  33.12 
 
 		 460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2394  aldehyde dehydrogenase  34.32 
 
 		 463 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0666523  normal  0.869122 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6908  aldehyde dehydrogenase  34.13 
 
 		 483 aa  243  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0222  aldehyde dehydrogenase  34.71 
 
 		 456 aa  243  6e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  34.75 
 
 		 533 aa  243  7.999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2660  aldehyde dehydrogenase family protein  34.32 
 
 		 463 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.349181  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  33.63 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3276  aldehyde dehydrogenase  33.19 
 
 		 463 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0875007 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  35.93 
 
 		 499 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3586  aldehyde dehydrogenase  34.54 
 
 		 501 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.615905 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3151  aldehyde dehydrogenase family protein  32.52 
 
 		 461 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  32.74 
 
 		 465 aa  238  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.909574  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0139  Aldehyde Dehydrogenase  33.04 
 
 		 451 aa  238  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4188  aldehyde dehydrogenase  32.23 
 
 		 452 aa  237  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3617  Aldehyde Dehydrogenase  35.9 
 
 		 470 aa  237  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4057  Aldehyde Dehydrogenase  32.3 
 
 		 457 aa  237  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2894  aldehyde dehydrogenase  32.52 
 
 		 461 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0958  Betaine-aldehyde dehydrogenase  33.12 
 
 		 498 aa  236  7e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.448446  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08406  succinate-semialdehyde dehydrogenase  30.92 
 
 		 449 aa  236  8e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2704  aldehyde dehydrogenase  31.86 
 
 		 461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598513 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  33.41 
 
 		 496 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4269  Aldehyde Dehydrogenase  31.51 
 
 		 496 aa  234  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0607  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  34.83 
 
 		 501 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1472  phenylacetaldehyde dehydrogenase  33.33 
 
 		 499 aa  233  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2563  aldehyde dehydrogenase  32.52 
 
 		 461 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2270  phenylacetaldehyde dehydrogenase  33.33 
 
 		 499 aa  233  6e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01357  phenylacetaldehyde dehydrogenase  33.33 
 
 		 499 aa  232  9e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01370  hypothetical protein  33.33 
 
 		 499 aa  232  9e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  32.75 
 
 		 505 aa  232  9e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1883  betaine aldehyde dehydrogenase  33.48 
 
 		 485 aa  232  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3463  aldehyde dehydrogenase  33.69 
 
 		 497 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506857  normal  0.23094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2306  aldehyde dehydrogenase  33.69 
 
 		 497 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0985  phenylacetaldehyde dehydrogenase  32.04 
 
 		 499 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2363  putative aldehyde dehydrogenase  32.52 
 
 		 460 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.97252  normal  0.760818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2474  aldehyde dehydrogenase  33.69 
 
 		 497 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0391  aldehyde dehydrogenase  32.01 
 
 		 454 aa  231  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.641534  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0377  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  32.29 
 
 		 454 aa  230  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3311  aldehyde dehydrogenase  34.83 
 
 		 501 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5056  aldehyde dehydrogenase  34.83 
 
 		 501 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2321  Aldehyde Dehydrogenase  32.67 
 
 		 466 aa  231  3e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1159  Aldehyde Dehydrogenase  34.78 
 
 		 466 aa  230  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2132  Aldehyde Dehydrogenase  32.48 
 
 		 488 aa  230  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2260  Phenylacetaldehyde dehydrogenase  33.11 
 
 		 499 aa  230  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218221  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1570  phenylacetaldehyde dehydrogenase  33.11 
 
 		 499 aa  230  5e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1956  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.03 
 
 		 457 aa  230  5e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1887  aldehyde dehydrogenase  31.44 
 
 		 456 aa  229  7e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2453  Aldehyde Dehydrogenase  36.18 
 
 		 455 aa  229  9e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  33.03 
 
 		 483 aa  229  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  29.85 
 
 		 490 aa  229  9e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2695  Aldehyde Dehydrogenase  33.84 
 
 		 453 aa  229  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0816293  normal  0.880648 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2946  aldehyde dehydrogenase  33.05 
 
 		 497 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.264552 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5228  aldehyde dehydrogenase  34.62 
 
 		 501 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  33.7 
 
 		 500 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0508  aldehyde dehydrogenase  32.15 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15470  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  33.19 
 
 		 458 aa  228  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.580059  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  33.09 
 
 		 522 aa  227  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.26 
 
 		 477 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2446  aldehyde dehydrogenase  32.68 
 
 		 478 aa  226  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1807  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  33.93 
 
 		 468 aa  226  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0333  Aldehyde Dehydrogenase  32.46 
 
 		 452 aa  226  7e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.909996  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0523  putative aldehyde dehydrogenase  31.42 
 
 		 460 aa  226  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6328  Aldehyde Dehydrogenase  34.57 
 
 		 460 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0373532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  31.81 
 
 		 480 aa  225  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1926  aldehyde dehydrogenase  31.36 
 
 		 455 aa  225  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.515635  normal  0.086374 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  32.83 
 
 		 479 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  32.4 
 
 		 490 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3122  Aldehyde Dehydrogenase_  33.92 
 
 		 469 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781135  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1725  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.1 
 
 		 471 aa  224  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.450617  decreased coverage  0.000946553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>