More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3300 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4672  Aldehyde Dehydrogenase  67.03 
 
 
489 aa  649    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
466 aa  954    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0771  Aldehyde Dehydrogenase  71.24 
 
 
462 aa  682    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2793  aldehyde dehydrogenase  61.17 
 
 
464 aa  601  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145836  normal  0.229577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2102  aldehyde dehydrogenase  59.87 
 
 
471 aa  594  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0577073  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0677  aldehyde dehydrogenase  63.88 
 
 
462 aa  588  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  0.53339 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2177  hypothetical protein  60.3 
 
 
465 aa  583  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2531  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  59.57 
 
 
492 aa  580  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2205  hypothetical protein  59.65 
 
 
465 aa  578  1.0000000000000001e-163  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2389  aldehyde dehydrogenase  59.91 
 
 
487 aa  549  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2129  aldehyde dehydrogenase  55.51 
 
 
461 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2632  Aldehyde Dehydrogenase  54.82 
 
 
461 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.440837  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2892  Aldehyde Dehydrogenase  54.39 
 
 
461 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3882  aldehyde dehydrogenase  54.55 
 
 
461 aa  507  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1869  aldehyde dehydrogenase  53.95 
 
 
461 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0287764  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2782  aldehyde dehydrogenase  51.19 
 
 
460 aa  485  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1611  aldehyde dehydrogenase  54.39 
 
 
462 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.917545  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0992  aldehyde dehydrogenase  53.29 
 
 
462 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2318  putative aldehyde dehydrogenase  53.29 
 
 
462 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4548  aldehyde dehydrogenase  53.56 
 
 
462 aa  468  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.676442  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0680  aldehyde dehydrogenase  52.64 
 
 
459 aa  460  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429817  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07141  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein (Eurofung)  45.57 
 
 
466 aa  412  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.549697 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01720  aldehyde dehydrogenase, putative  44.8 
 
 
477 aa  400  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.265916  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4025  Aldehyde Dehydrogenase  46.97 
 
 
463 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4702  aldehyde dehydrogenase  37.55 
 
 
457 aa  295  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0107  aldehyde dehydrogenase  37.79 
 
 
455 aa  283  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1971  aldehyde dehydrogenase  35.43 
 
 
460 aa  280  5e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  34.43 
 
 
455 aa  273  7e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1940  aldehyde dehydrogenase  34.44 
 
 
454 aa  265  1e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.613178  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1238  Aldehyde Dehydrogenase  34.04 
 
 
454 aa  260  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0821  aldehyde dehydrogenase  34.41 
 
 
457 aa  260  4e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.376923  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4244  aldehyde dehydrogenase  31.65 
 
 
452 aa  256  9e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0139  Aldehyde Dehydrogenase  35.5 
 
 
451 aa  254  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2363  putative aldehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
460 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.97252  normal  0.760818 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  35.29 
 
 
505 aa  247  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2660  aldehyde dehydrogenase family protein  35.4 
 
 
463 aa  247  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.349181  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  34.43 
 
 
465 aa  247  4e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.909574  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7094  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  34.88 
 
 
491 aa  246  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2394  aldehyde dehydrogenase  34.96 
 
 
463 aa  246  9e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0666523  normal  0.869122 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0561  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  33.85 
 
 
490 aa  243  6e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2100  Aldehyde Dehydrogenase  33.26 
 
 
457 aa  243  7.999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.773732  normal  0.123203 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3151  aldehyde dehydrogenase family protein  33.62 
 
 
461 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2704  aldehyde dehydrogenase  33.41 
 
 
461 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.598513 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2711  Aldehyde Dehydrogenase  34.93 
 
 
464 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.275428  hitchhiker  0.000000324245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2894  aldehyde dehydrogenase  33.19 
 
 
461 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237665  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1188  aldehyde dehydrogenase  35.65 
 
 
461 aa  239  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417271  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0391  aldehyde dehydrogenase  35.67 
 
 
454 aa  239  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.641534  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0933  betaine-aldehyde dehydrogenase  33.41 
 
 
500 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  33.33 
 
 
493 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0462  aldehyde dehydrogenase  34.22 
 
 
526 aa  237  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.433916  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0395  betaine-aldehyde dehydrogenase  33.41 
 
 
475 aa  237  3e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  34.78 
 
 
504 aa  237  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6908  aldehyde dehydrogenase  33.48 
 
 
483 aa  236  7e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0160  aldehyde dehydrogenase  34.96 
 
 
456 aa  236  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4164  betaine-aldehyde dehydrogenase  32.97 
 
 
500 aa  236  9e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2563  aldehyde dehydrogenase  33.41 
 
 
461 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01482  predicted aldehyde dehydrogenase  34 
 
 
462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2946  aldehyde dehydrogenase  32.24 
 
 
463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2121  Aldehyde Dehydrogenase  34 
 
 
462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0323198  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1647  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  34 
 
 
462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1006  Aldehyde Dehydrogenase  32.24 
 
 
463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01493  hypothetical protein  34 
 
 
462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1607  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  34 
 
 
462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.764255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2133  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  34 
 
 
462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.753  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1681  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  34 
 
 
462 aa  234  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.956976  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0523  putative aldehyde dehydrogenase  31.57 
 
 
460 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3357  aldehyde dehydrogenase  32.46 
 
 
463 aa  234  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  32.97 
 
 
500 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3276  aldehyde dehydrogenase  32.53 
 
 
463 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0875007 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1725  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  34.07 
 
 
462 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.875923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1018  aldehyde dehydrogenase  32.02 
 
 
463 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.752265  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0984  aldehyde dehydrogenase  32.02 
 
 
463 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1090  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  32.6 
 
 
468 aa  234  4.0000000000000004e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.033581  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2399  Aldehyde Dehydrogenase  32.25 
 
 
460 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5502  betaine-aldehyde dehydrogenase  32.97 
 
 
500 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3586  betaine-aldehyde dehydrogenase  32.97 
 
 
500 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4781  betaine-aldehyde dehydrogenase  32.97 
 
 
500 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494412  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2916  betaine aldehyde dehydrogenase  34.14 
 
 
490 aa  233  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4188  aldehyde dehydrogenase  32.96 
 
 
452 aa  233  6e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1472  phenylacetaldehyde dehydrogenase  33.18 
 
 
499 aa  231  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0142  aldehyde dehydrogenase  33.26 
 
 
489 aa  232  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0508  aldehyde dehydrogenase  32.37 
 
 
456 aa  232  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2270  phenylacetaldehyde dehydrogenase  33.18 
 
 
499 aa  231  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.22 
 
 
550 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1201  phenylacetaldehyde dehydrogenase  34.67 
 
 
500 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00454  aldehyde-dehydrogenase like protein YneI  33.41 
 
 
454 aa  231  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1742  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.66 
 
 
470 aa  232  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.737233 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2260  Phenylacetaldehyde dehydrogenase  32.95 
 
 
499 aa  231  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218221  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6158  betaine aldehyde dehydrogenase  33.84 
 
 
490 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2138  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  33.55 
 
 
462 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.752498  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08406  succinate-semialdehyde dehydrogenase  31.29 
 
 
449 aa  231  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2466  phenylacetaldehyde dehydrogenase  34.67 
 
 
500 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1570  phenylacetaldehyde dehydrogenase  32.95 
 
 
499 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1274  phenylacetaldehyde dehydrogenase  34.67 
 
 
500 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.226491  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2222  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  35.76 
 
 
489 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0132587  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4269  Aldehyde Dehydrogenase  32.4 
 
 
496 aa  231  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  33.63 
 
 
493 aa  230  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2454  aldehyde dehydrogenase  34.01 
 
 
506 aa  230  4e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.88404  normal  0.901985 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1626  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  31.03 
 
 
463 aa  230  4e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.411023  normal  0.0128015 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  32.39 
 
 
496 aa  229  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>