More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1611 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2318  putative aldehyde dehydrogenase  91.77 
 
 
462 aa  823    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0992  aldehyde dehydrogenase  92.21 
 
 
462 aa  827    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2632  Aldehyde Dehydrogenase  71.55 
 
 
461 aa  697    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.440837  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1611  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
462 aa  943    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.917545  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2892  Aldehyde Dehydrogenase  71.33 
 
 
461 aa  694    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2782  aldehyde dehydrogenase  70.07 
 
 
460 aa  667    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1869  aldehyde dehydrogenase  69.58 
 
 
461 aa  659    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0287764  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2129  aldehyde dehydrogenase  69.58 
 
 
461 aa  674    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4548  aldehyde dehydrogenase  75.76 
 
 
462 aa  694    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.676442  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0680  aldehyde dehydrogenase  66.38 
 
 
459 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429817  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3882  aldehyde dehydrogenase  58.82 
 
 
461 aa  554  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0771  Aldehyde Dehydrogenase  60.22 
 
 
462 aa  541  9.999999999999999e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0677  aldehyde dehydrogenase  57.61 
 
 
462 aa  528  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  0.53339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2793  aldehyde dehydrogenase  55.6 
 
 
464 aa  509  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145836  normal  0.229577 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2177  hypothetical protein  52.83 
 
 
465 aa  496  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.63 
 
 
466 aa  496  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2102  aldehyde dehydrogenase  52.61 
 
 
471 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0577073  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4672  Aldehyde Dehydrogenase  54.17 
 
 
489 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2205  hypothetical protein  52.39 
 
 
465 aa  491  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2531  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  52.31 
 
 
492 aa  487  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2389  aldehyde dehydrogenase  56.8 
 
 
487 aa  477  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07141  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein (Eurofung)  41.94 
 
 
466 aa  377  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.549697 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01720  aldehyde dehydrogenase, putative  41.94 
 
 
477 aa  359  5e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.265916  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4025  Aldehyde Dehydrogenase  45.38 
 
 
463 aa  338  9.999999999999999e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4702  aldehyde dehydrogenase  41.48 
 
 
457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0107  aldehyde dehydrogenase  39.44 
 
 
455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1238  Aldehyde Dehydrogenase  37.5 
 
 
454 aa  281  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  36.54 
 
 
522 aa  252  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  32.82 
 
 
455 aa  249  8e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1971  aldehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  34.7 
 
 
510 aa  240  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4269  Aldehyde Dehydrogenase  34.99 
 
 
496 aa  239  8e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08406  succinate-semialdehyde dehydrogenase  31.65 
 
 
449 aa  237  3e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  35.96 
 
 
521 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  33.97 
 
 
533 aa  231  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2457  aldehyde dehydrogenase  33.71 
 
 
463 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0821  aldehyde dehydrogenase  33.77 
 
 
457 aa  231  3e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.376923  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1120  aldehyde dehydrogenase  33.41 
 
 
485 aa  229  8e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000801479 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1188  aldehyde dehydrogenase  35.41 
 
 
461 aa  228  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417271  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5835  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.05 
 
 
488 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  33.64 
 
 
480 aa  226  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4188  aldehyde dehydrogenase  34.43 
 
 
452 aa  225  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  31.93 
 
 
490 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  36.69 
 
 
504 aa  223  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4244  aldehyde dehydrogenase  30.7 
 
 
452 aa  223  6e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1620  aldehyde dehydrogenase  29.49 
 
 
454 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0293  aldehyde dehydrogenase  33.99 
 
 
477 aa  222  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974595  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7094  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  34.66 
 
 
491 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  38.68 
 
 
512 aa  220  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  37.68 
 
 
518 aa  220  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0391  aldehyde dehydrogenase  32.56 
 
 
454 aa  220  5e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.641534  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2894  aldehyde dehydrogenase  34.62 
 
 
461 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237665  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  41.25 
 
 
505 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3151  aldehyde dehydrogenase family protein  34.84 
 
 
461 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1940  aldehyde dehydrogenase  30.57 
 
 
454 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.613178  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.48 
 
 
482 aa  219  7.999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1299  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  31.31 
 
 
470 aa  219  7.999999999999999e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410405  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  32.64 
 
 
494 aa  218  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6093  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  33.74 
 
 
463 aa  219  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  30.56 
 
 
457 aa  218  2e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2363  putative aldehyde dehydrogenase  31.56 
 
 
460 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.97252  normal  0.760818 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1608  aldehyde dehydrogenase  32.49 
 
 
443 aa  218  2e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  32.69 
 
 
482 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.41 
 
 
479 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0535  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.19 
 
 
487 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0462  aldehyde dehydrogenase  32.52 
 
 
526 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.433916  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  33.7 
 
 
479 aa  217  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2704  aldehyde dehydrogenase  34.16 
 
 
461 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.598513 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  33.41 
 
 
479 aa  216  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.41 
 
 
479 aa  216  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.62 
 
 
479 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  38.68 
 
 
517 aa  216  7e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13620  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  34.2 
 
 
497 aa  216  7e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  32.29 
 
 
508 aa  216  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.19 
 
 
479 aa  216  8e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.19 
 
 
479 aa  216  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2446  aldehyde dehydrogenase  34.88 
 
 
478 aa  216  9e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.41 
 
 
479 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.19 
 
 
479 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2563  aldehyde dehydrogenase  35.07 
 
 
461 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  31.77 
 
 
490 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2053  aldehyde dehydrogenase family protein  34.33 
 
 
499 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2400  Aldehyde Dehydrogenase  32.62 
 
 
463 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1708  Betaine-aldehyde dehydrogenase  33.71 
 
 
494 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  35.35 
 
 
501 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.41 
 
 
477 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4194  Aldehyde Dehydrogenase  32.12 
 
 
487 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  33.19 
 
 
479 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2321  Aldehyde Dehydrogenase  30.85 
 
 
466 aa  213  3.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0333  Aldehyde Dehydrogenase  31.95 
 
 
452 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.909996  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0222  aldehyde dehydrogenase  33.09 
 
 
456 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6328  Aldehyde Dehydrogenase  32.38 
 
 
460 aa  213  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0373532  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  34.71 
 
 
461 aa  213  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1858  Aldehyde Dehydrogenase  31.6 
 
 
457 aa  213  7e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16034  predicted protein  33.48 
 
 
510 aa  212  1e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0673665  normal  0.542124 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1939  aldehyde dehydrogenase  37.15 
 
 
501 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2911  Aldehyde Dehydrogenase  32.65 
 
 
458 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2399  Aldehyde Dehydrogenase  31.07 
 
 
460 aa  211  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3240  aldehyde dehydrogenase  33.77 
 
 
535 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.5112  normal  0.0278699 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2448  aldehyde dehydrogenase  33.56 
 
 
452 aa  211  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>