More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4672 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4672  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
489 aa  1014    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.03 
 
 
466 aa  642    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0771  Aldehyde Dehydrogenase  64.35 
 
 
462 aa  620  1e-176  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2793  aldehyde dehydrogenase  64.41 
 
 
464 aa  615  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145836  normal  0.229577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2102  aldehyde dehydrogenase  60.65 
 
 
471 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0577073  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0677  aldehyde dehydrogenase  61.84 
 
 
462 aa  597  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  0.53339 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2531  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  58.86 
 
 
492 aa  592  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2205  hypothetical protein  60.52 
 
 
465 aa  589  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2177  hypothetical protein  60.3 
 
 
465 aa  590  1e-167  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2389  aldehyde dehydrogenase  61.93 
 
 
487 aa  569  1e-161  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3882  aldehyde dehydrogenase  55.68 
 
 
461 aa  512  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2129  aldehyde dehydrogenase  54.61 
 
 
461 aa  503  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2632  Aldehyde Dehydrogenase  53.73 
 
 
461 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.440837  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2892  Aldehyde Dehydrogenase  53.51 
 
 
461 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2782  aldehyde dehydrogenase  52.84 
 
 
460 aa  476  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1869  aldehyde dehydrogenase  52.63 
 
 
461 aa  478  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0287764  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1611  aldehyde dehydrogenase  54.17 
 
 
462 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.917545  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2318  putative aldehyde dehydrogenase  52.63 
 
 
462 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0992  aldehyde dehydrogenase  52.85 
 
 
462 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4548  aldehyde dehydrogenase  53.28 
 
 
462 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.676442  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0680  aldehyde dehydrogenase  53.51 
 
 
459 aa  450  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429817  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07141  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein (Eurofung)  46.29 
 
 
466 aa  412  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.549697 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01720  aldehyde dehydrogenase, putative  45.34 
 
 
477 aa  401  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.265916  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4025  Aldehyde Dehydrogenase  44.27 
 
 
463 aa  343  5e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4702  aldehyde dehydrogenase  36.3 
 
 
457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0107  aldehyde dehydrogenase  35.24 
 
 
455 aa  276  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1238  Aldehyde Dehydrogenase  35.51 
 
 
454 aa  273  5.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1971  aldehyde dehydrogenase  34.2 
 
 
460 aa  272  9e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  33.7 
 
 
455 aa  260  3e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0821  aldehyde dehydrogenase  35.23 
 
 
457 aa  257  3e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.376923  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4244  aldehyde dehydrogenase  32.64 
 
 
452 aa  247  4e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4057  Aldehyde Dehydrogenase  32.24 
 
 
457 aa  245  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1188  aldehyde dehydrogenase  33.85 
 
 
461 aa  244  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417271  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0222  aldehyde dehydrogenase  33.26 
 
 
456 aa  243  5e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2363  putative aldehyde dehydrogenase  32.38 
 
 
460 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.97252  normal  0.760818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4194  Aldehyde Dehydrogenase  33.41 
 
 
487 aa  237  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2660  aldehyde dehydrogenase family protein  33.26 
 
 
463 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.349181  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1940  aldehyde dehydrogenase  31.39 
 
 
454 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.613178  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0139  Aldehyde Dehydrogenase  33.77 
 
 
451 aa  236  6e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2394  aldehyde dehydrogenase  33.48 
 
 
463 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0666523  normal  0.869122 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  32.17 
 
 
465 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.909574  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08406  succinate-semialdehyde dehydrogenase  31.14 
 
 
449 aa  234  3e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0160  aldehyde dehydrogenase  32.31 
 
 
456 aa  233  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1620  aldehyde dehydrogenase  29.89 
 
 
454 aa  233  9e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0508  aldehyde dehydrogenase  33.55 
 
 
456 aa  232  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1159  Aldehyde Dehydrogenase  30.94 
 
 
466 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0391  aldehyde dehydrogenase  32.03 
 
 
454 aa  231  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.641534  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3617  Aldehyde Dehydrogenase  33.04 
 
 
470 aa  231  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  33.94 
 
 
484 aa  230  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00454  aldehyde-dehydrogenase like protein YneI  31.74 
 
 
454 aa  229  7e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4876  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  32.32 
 
 
456 aa  229  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1887  aldehyde dehydrogenase  32.18 
 
 
456 aa  229  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2321  Aldehyde Dehydrogenase  30.89 
 
 
466 aa  229  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0462  aldehyde dehydrogenase  31.29 
 
 
526 aa  229  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.433916  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0523  putative aldehyde dehydrogenase  30.84 
 
 
460 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  32.89 
 
 
457 aa  228  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0914  aldehyde dehydrogenase  29.61 
 
 
457 aa  227  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.929249 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4853  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  32.09 
 
 
456 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1681  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  32.66 
 
 
462 aa  226  6e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.956976  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1725  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  32.66 
 
 
462 aa  226  6e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.875923  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0808  Aldehyde Dehydrogenase  33.48 
 
 
486 aa  226  6e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01482  predicted aldehyde dehydrogenase  32.66 
 
 
462 aa  226  7e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2121  Aldehyde Dehydrogenase  32.66 
 
 
462 aa  226  7e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0323198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.69 
 
 
477 aa  226  7e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01493  hypothetical protein  32.66 
 
 
462 aa  226  7e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07850  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  32.5 
 
 
471 aa  226  7e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1647  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  32.66 
 
 
462 aa  226  7e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3357  aldehyde dehydrogenase  31.51 
 
 
463 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4778  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  32.09 
 
 
456 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3276  aldehyde dehydrogenase  31.36 
 
 
463 aa  226  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0875007 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2448  aldehyde dehydrogenase  31.64 
 
 
452 aa  225  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1346  Aldehyde Dehydrogenase  31.02 
 
 
454 aa  225  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.211595  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4926  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  31.89 
 
 
456 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2946  aldehyde dehydrogenase  31.36 
 
 
463 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1124  aldehyde dehydrogenase family protein  31.65 
 
 
458 aa  225  2e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.115238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2133  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  32.43 
 
 
462 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.753  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09770  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  32.38 
 
 
461 aa  224  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00172669  normal  0.0203425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2100  Aldehyde Dehydrogenase  31.6 
 
 
457 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.773732  normal  0.123203 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.05 
 
 
479 aa  225  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0984  aldehyde dehydrogenase  31.51 
 
 
463 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15470  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  32.67 
 
 
458 aa  224  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.580059  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1607  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  32.43 
 
 
462 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.764255  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2894  aldehyde dehydrogenase  31.5 
 
 
461 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237665  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.05 
 
 
479 aa  224  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1018  aldehyde dehydrogenase  31.51 
 
 
463 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.752265  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2400  Aldehyde Dehydrogenase  33.49 
 
 
463 aa  224  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.61 
 
 
479 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1006  Aldehyde Dehydrogenase  31.51 
 
 
463 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  32.83 
 
 
479 aa  223  6e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2704  aldehyde dehydrogenase  31.06 
 
 
461 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.598513 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1299  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  30.67 
 
 
470 aa  223  6e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.83 
 
 
479 aa  223  7e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  32.83 
 
 
479 aa  223  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2138  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  32.21 
 
 
462 aa  223  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.752498  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.83 
 
 
479 aa  223  8e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  30.7 
 
 
466 aa  223  8e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0333  Aldehyde Dehydrogenase  32.02 
 
 
452 aa  223  9e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.909996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.4 
 
 
482 aa  223  9e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  32.05 
 
 
479 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0377  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  31.43 
 
 
454 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>