More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2129 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2632  Aldehyde Dehydrogenase  85.25 
 
 		 461 aa  844    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.440837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2318  putative aldehyde dehydrogenase  70.46 
 
 		 462 aa  638    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2782  aldehyde dehydrogenase  70.52 
 
 		 460 aa  689    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0992  aldehyde dehydrogenase  70.24 
 
 		 462 aa  638    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2892  Aldehyde Dehydrogenase  85.9 
 
 		 461 aa  850    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1869  aldehyde dehydrogenase  77.87 
 
 		 461 aa  753    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0287764  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2129  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 461 aa  953    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1611  aldehyde dehydrogenase  69.58 
 
 		 462 aa  634  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.917545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0680  aldehyde dehydrogenase  68.78 
 
 		 459 aa  619  1e-176  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429817  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4548  aldehyde dehydrogenase  67.83 
 
 		 462 aa  610  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.676442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3882  aldehyde dehydrogenase  57.27 
 
 		 461 aa  540  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0771  Aldehyde Dehydrogenase  57.92 
 
 		 462 aa  527  1e-148  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0677  aldehyde dehydrogenase  54.68 
 
 		 462 aa  508  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  0.53339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2793  aldehyde dehydrogenase  54.68 
 
 		 464 aa  506  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145836  normal  0.229577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2102  aldehyde dehydrogenase  53.8 
 
 		 471 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0577073  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.51 
 
 		 466 aa  507  9.999999999999999e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4672  Aldehyde Dehydrogenase  54.61 
 
 		 489 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2177  hypothetical protein  52.72 
 
 		 465 aa  490  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2531  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  52.97 
 
 		 492 aa  489  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.670411 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2205  hypothetical protein  51.85 
 
 		 465 aa  484  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2389  aldehyde dehydrogenase  54.05 
 
 		 487 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07141  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein (Eurofung)  41.48 
 
 		 466 aa  371  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.549697 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01720  aldehyde dehydrogenase, putative  41.39 
 
 		 477 aa  368  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.265916  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4025  Aldehyde Dehydrogenase  45.83 
 
 		 463 aa  352  5e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4702  aldehyde dehydrogenase  39.13 
 
 		 457 aa  311  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0107  aldehyde dehydrogenase  39.13 
 
 		 455 aa  304  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1238  Aldehyde Dehydrogenase  35.93 
 
 		 454 aa  260  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  33.26 
 
 		 455 aa  258  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1443  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  35.56 
 
 		 522 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0821  aldehyde dehydrogenase  35.43 
 
 		 457 aa  250  4e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.376923  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1442  hypothetical protein  32.38 
 
 		 462 aa  249  7e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  35.48 
 
 		 533 aa  249  7e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1971  aldehyde dehydrogenase  32.23 
 
 		 460 aa  249  8e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1541  hypothetical protein  32.16 
 
 		 462 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2321  Aldehyde Dehydrogenase  32.02 
 
 		 466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08406  succinate-semialdehyde dehydrogenase  31.65 
 
 		 449 aa  243  7e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2363  putative aldehyde dehydrogenase  32.07 
 
 		 460 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.97252  normal  0.760818 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0391  aldehyde dehydrogenase  33.57 
 
 		 454 aa  241  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.641534  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  35.98 
 
 		 505 aa  240  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2711  Aldehyde Dehydrogenase  34.06 
 
 		 464 aa  240  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.275428  hitchhiker  0.000000324245 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2457  aldehyde dehydrogenase  32.37 
 
 		 463 aa  239  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4249  Aldehyde Dehydrogenase  35.14 
 
 		 521 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1620  aldehyde dehydrogenase  30.97 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1175  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.7 
 
 		 521 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2008  Aldehyde Dehydrogenase  34.06 
 
 		 465 aa  237  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2100  Aldehyde Dehydrogenase  31.37 
 
 		 457 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.773732  normal  0.123203 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4269  Aldehyde Dehydrogenase  33.55 
 
 		 496 aa  236  8e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4188  aldehyde dehydrogenase  32.6 
 
 		 452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2318  Aldehyde Dehydrogenase  31.66 
 
 		 452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1120  aldehyde dehydrogenase  34 
 
 		 485 aa  235  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000801479 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2394  aldehyde dehydrogenase  32.89 
 
 		 463 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0666523  normal  0.869122 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2542  aldehyde dehydrogenase  31.3 
 
 		 454 aa  234  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0222  aldehyde dehydrogenase  34 
 
 		 456 aa  234  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0523  putative aldehyde dehydrogenase  31.66 
 
 		 460 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3633  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.11 
 
 		 540 aa  234  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2453  Aldehyde Dehydrogenase  34.8 
 
 		 455 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2400  Aldehyde Dehydrogenase  34.37 
 
 		 463 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  33.11 
 
 		 457 aa  233  5e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4277  succinate semialdehyde dehydrogenase  34.44 
 
 		 491 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0293  aldehyde dehydrogenase  32.16 
 
 		 477 aa  233  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1105  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  34.39 
 
 		 510 aa  233  8.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1299  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  31.75 
 
 		 470 aa  233  8.000000000000001e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410405  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2660  aldehyde dehydrogenase family protein  31.78 
 
 		 463 aa  232  9e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.349181  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03968  succinate-semialdehyde dehydrogenase  32.95 
 
 		 462 aa  232  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0395  betaine-aldehyde dehydrogenase  34.34 
 
 		 475 aa  232  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1159  Aldehyde Dehydrogenase  31.22 
 
 		 466 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2448  aldehyde dehydrogenase  32.32 
 
 		 452 aa  231  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4057  Aldehyde Dehydrogenase  29.87 
 
 		 457 aa  229  7e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0160  aldehyde dehydrogenase  38.42 
 
 		 456 aa  229  8e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31599  succinate semialdehyde dehydrogenase  31.26 
 
 		 471 aa  229  9e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0462  aldehyde dehydrogenase  32.29 
 
 		 526 aa  228  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.433916  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2222  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  34.06 
 
 		 489 aa  228  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0132587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0377  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  31.72 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.83 
 
 		 492 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2053  aldehyde dehydrogenase family protein  33.05 
 
 		 499 aa  227  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  33.55 
 
 		 498 aa  227  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4194  Aldehyde Dehydrogenase  33.04 
 
 		 487 aa  227  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5835  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  36.89 
 
 		 488 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  32.49 
 
 		 476 aa  226  6e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10478  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  30.53 
 
 		 473 aa  226  6e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128776  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0627  aldehyde dehydrogenase  37.12 
 
 		 518 aa  226  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3240  aldehyde dehydrogenase  33.7 
 
 		 535 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.5112  normal  0.0278699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1940  aldehyde dehydrogenase  29.76 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.613178  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  32.52 
 
 		 465 aa  225  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.909574  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3067  succinic semialdehyde dehydrogenase  32.75 
 
 		 508 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0865866  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  33.56 
 
 		 493 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2065  aldehyde dehydrogenase  31.93 
 
 		 472 aa  223  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1608  aldehyde dehydrogenase  32.43 
 
 		 443 aa  224  4e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6328  Aldehyde Dehydrogenase  32.83 
 
 		 460 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0373532  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  35.06 
 
 		 504 aa  223  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3276  aldehyde dehydrogenase  30.55 
 
 		 463 aa  223  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0875007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1018  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.2 
 
 		 550 aa  222  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0148351 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2590  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.79 
 
 		 525 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  36.31 
 
 		 490 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  32.41 
 
 		 490 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0330  aldehyde dehydrogenase family protein  30.7 
 
 		 457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0316513  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  31.49 
 
 		 494 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5639  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.82 
 
 		 492 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0034  aldehyde dehydrogenase  32.37 
 
 		 457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000822234  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1326  elongation factor P (EF-P)  33.19 
 
 		 491 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>