More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4188 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4188  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
452 aa  915    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4194  Aldehyde Dehydrogenase  54.42 
 
 
487 aa  497  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0821  aldehyde dehydrogenase  52.55 
 
 
457 aa  498  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.376923  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1120  aldehyde dehydrogenase  54 
 
 
485 aa  494  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000801479 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2911  Aldehyde Dehydrogenase  53.22 
 
 
458 aa  475  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09770  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  50.33 
 
 
461 aa  470  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00172669  normal  0.0203425 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0462  aldehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
526 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.433916  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0160  aldehyde dehydrogenase  51.43 
 
 
456 aa  464  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07850  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  50.99 
 
 
471 aa  459  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10340  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  50.78 
 
 
461 aa  456  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.688946  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1844  aldehyde dehydrogenase  55.46 
 
 
453 aa  455  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434282  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1103  Aldehyde Dehydrogenase  54.82 
 
 
450 aa  451  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2363  putative aldehyde dehydrogenase  48.44 
 
 
460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.97252  normal  0.760818 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0523  putative aldehyde dehydrogenase  47.56 
 
 
460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1971  aldehyde dehydrogenase  45.68 
 
 
460 aa  443  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1223  Aldehyde Dehydrogenase  49.67 
 
 
462 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2946  aldehyde dehydrogenase  45.37 
 
 
463 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0984  aldehyde dehydrogenase  45.13 
 
 
463 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1018  aldehyde dehydrogenase  45.13 
 
 
463 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.752265  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1006  Aldehyde Dehydrogenase  45.13 
 
 
463 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1124  aldehyde dehydrogenase family protein  44.89 
 
 
458 aa  426  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.115238  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3357  aldehyde dehydrogenase  45.35 
 
 
463 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9222  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  47.57 
 
 
463 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0139  Aldehyde Dehydrogenase  46.37 
 
 
451 aa  425  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0775  aldehyde dehydrogenase  45.93 
 
 
463 aa  423  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.442992  normal  0.410628 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2488  succinic-semialdehyde dehydrogenase, putative  48.9 
 
 
463 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101295  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6093  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  47.57 
 
 
463 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0508  aldehyde dehydrogenase  44.67 
 
 
456 aa  418  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1706  Aldehyde Dehydrogenase  48.01 
 
 
463 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.588412 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2032  aldehyde dehydrogenase  47.01 
 
 
460 aa  414  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4876  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  45.11 
 
 
456 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4853  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  45.11 
 
 
456 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3039  putative succinate-semialdehyde dehydrogenase  46.9 
 
 
477 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4778  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  45.11 
 
 
456 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4926  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.89 
 
 
456 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.515013  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2400  Aldehyde Dehydrogenase  45.35 
 
 
463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4926  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.67 
 
 
456 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1820  aldehyde dehydrogenase  46.68 
 
 
463 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935448  normal  0.30191 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1299  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  41.11 
 
 
470 aa  402  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410405  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0034  aldehyde dehydrogenase  42.67 
 
 
457 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000822234  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0488  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  42.76 
 
 
468 aa  400  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.627083  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1090  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  42.32 
 
 
468 aa  399  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.033581  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2321  Aldehyde Dehydrogenase  44.74 
 
 
466 aa  397  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1159  Aldehyde Dehydrogenase  44.87 
 
 
466 aa  389  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2711  Aldehyde Dehydrogenase  42.67 
 
 
464 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.275428  hitchhiker  0.000000324245 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  42.63 
 
 
465 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.909574  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1725  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.68 
 
 
471 aa  377  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.450617  decreased coverage  0.000946553 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0391  aldehyde dehydrogenase  43.68 
 
 
454 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.641534  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2056  Aldehyde Dehydrogenase  42.11 
 
 
457 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1956  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.15 
 
 
457 aa  374  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3151  aldehyde dehydrogenase family protein  41.61 
 
 
461 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1074  putative aldehyde dehydrogenase  42.73 
 
 
454 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000640606  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1887  aldehyde dehydrogenase  43.3 
 
 
456 aa  368  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3003  aldehyde dehydrogenase  43.82 
 
 
469 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000280927  normal  0.841466 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1926  aldehyde dehydrogenase  39.87 
 
 
455 aa  368  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.515635  normal  0.086374 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1626  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  39.42 
 
 
463 aa  365  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.411023  normal  0.0128015 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10236  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.71 
 
 
511 aa  365  1e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3276  aldehyde dehydrogenase  40.72 
 
 
463 aa  364  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0875007 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0377  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  41.07 
 
 
454 aa  363  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2704  aldehyde dehydrogenase  41.16 
 
 
461 aa  362  9e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.598513 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0839  aldehyde Dehydrogenase  40.31 
 
 
455 aa  361  1e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2894  aldehyde dehydrogenase  41.16 
 
 
461 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237665  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.27 
 
 
455 aa  360  3e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2563  aldehyde dehydrogenase  41.61 
 
 
461 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1742  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.57 
 
 
470 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6328  Aldehyde Dehydrogenase  42.6 
 
 
460 aa  356  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0373532  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2008  Aldehyde Dehydrogenase  43.11 
 
 
465 aa  355  1e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4209  Aldehyde Dehydrogenase  41.02 
 
 
455 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4169  Aldehyde Dehydrogenase  41.02 
 
 
455 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1620  aldehyde dehydrogenase  38.65 
 
 
454 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1858  aldehyde dehydrogenase  39.2 
 
 
459 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0838083 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1858  Aldehyde Dehydrogenase  40.75 
 
 
457 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10478  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  38.14 
 
 
473 aa  352  1e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128776  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1825  Aldehyde Dehydrogenase  42.25 
 
 
461 aa  352  1e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1292  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP+]  39.82 
 
 
458 aa  350  3e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0352  aldehyde dehydrogenase  39.64 
 
 
459 aa  348  8e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.491139  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2448  aldehyde dehydrogenase  40.76 
 
 
452 aa  347  2e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3924  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.84 
 
 
457 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  decreased coverage  0.00345047 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4057  Aldehyde Dehydrogenase  39.51 
 
 
457 aa  347  3e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2797  Aldehyde Dehydrogenase  42.6 
 
 
457 aa  347  3e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1541  hypothetical protein  37.95 
 
 
462 aa  345  7e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3534  aldehyde dehydrogenase  40.98 
 
 
455 aa  345  8e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.46589 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1442  hypothetical protein  37.95 
 
 
462 aa  345  8.999999999999999e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03968  succinate-semialdehyde dehydrogenase  39.24 
 
 
462 aa  345  1e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2394  aldehyde dehydrogenase  40.45 
 
 
463 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0666523  normal  0.869122 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1646  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.57 
 
 
462 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00984812  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0333  Aldehyde Dehydrogenase  43.5 
 
 
452 aa  344  2e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.909996  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4244  aldehyde dehydrogenase  38.27 
 
 
452 aa  343  2.9999999999999997e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3122  Aldehyde Dehydrogenase_  42.19 
 
 
469 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781135  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0222  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 
456 aa  343  4e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3025  aldehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
469 aa  343  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2660  aldehyde dehydrogenase family protein  40.45 
 
 
463 aa  342  7e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.349181  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1696  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.35 
 
 
462 aa  342  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.087576  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1811  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.35 
 
 
462 aa  342  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3223  Aldehyde Dehydrogenase  41.96 
 
 
469 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.989475  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1346  Aldehyde Dehydrogenase  41.39 
 
 
454 aa  341  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.211595  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1647  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.12 
 
 
462 aa  341  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2070  aldehyde dehydrogenase  39.65 
 
 
475 aa  340  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0905776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1637  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.12 
 
 
462 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1681  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  40.9 
 
 
462 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.956976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>