More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1103 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1103  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
450 aa  903    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0821  aldehyde dehydrogenase  52.86 
 
 
457 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.376923  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4188  aldehyde dehydrogenase  55.04 
 
 
452 aa  456  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0139  Aldehyde Dehydrogenase  50.44 
 
 
451 aa  451  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07850  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  52.53 
 
 
471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10340  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  51.76 
 
 
461 aa  435  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.688946  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09770  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  50.22 
 
 
461 aa  425  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00172669  normal  0.0203425 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4194  Aldehyde Dehydrogenase  48.46 
 
 
487 aa  418  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1120  aldehyde dehydrogenase  50.77 
 
 
485 aa  419  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000801479 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1844  aldehyde dehydrogenase  54.67 
 
 
453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434282  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1971  aldehyde dehydrogenase  47.47 
 
 
460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0160  aldehyde dehydrogenase  48.9 
 
 
456 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0462  aldehyde dehydrogenase  48.02 
 
 
526 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.433916  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0508  aldehyde dehydrogenase  45.58 
 
 
456 aa  401  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4778  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  47.12 
 
 
456 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4876  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  46.9 
 
 
456 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2911  Aldehyde Dehydrogenase  50.22 
 
 
458 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4853  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  46.9 
 
 
456 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2946  aldehyde dehydrogenase  45.18 
 
 
463 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2363  putative aldehyde dehydrogenase  46.92 
 
 
460 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.97252  normal  0.760818 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4926  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  46.68 
 
 
456 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.515013  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4926  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  46.46 
 
 
456 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3357  aldehyde dehydrogenase  44.96 
 
 
463 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1124  aldehyde dehydrogenase family protein  44.05 
 
 
458 aa  391  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.115238  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1006  Aldehyde Dehydrogenase  43.86 
 
 
463 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0984  aldehyde dehydrogenase  43.86 
 
 
463 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0523  putative aldehyde dehydrogenase  45.61 
 
 
460 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9222  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  46.51 
 
 
463 aa  388  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1018  aldehyde dehydrogenase  44.08 
 
 
463 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.752265  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2488  succinic-semialdehyde dehydrogenase, putative  47.15 
 
 
463 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101295  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0775  aldehyde dehydrogenase  45.41 
 
 
463 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.442992  normal  0.410628 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1223  Aldehyde Dehydrogenase  45.05 
 
 
462 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1706  Aldehyde Dehydrogenase  46.93 
 
 
463 aa  381  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.588412 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0488  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  44.66 
 
 
468 aa  379  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.627083  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1159  Aldehyde Dehydrogenase  46.1 
 
 
466 aa  377  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1299  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  42.64 
 
 
470 aa  373  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410405  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2321  Aldehyde Dehydrogenase  45.58 
 
 
466 aa  370  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6093  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  46.07 
 
 
463 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2400  Aldehyde Dehydrogenase  45.39 
 
 
463 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0034  aldehyde dehydrogenase  43.14 
 
 
457 aa  365  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000822234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3039  putative succinate-semialdehyde dehydrogenase  45.41 
 
 
477 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2032  aldehyde dehydrogenase  45.73 
 
 
460 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1090  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  45.1 
 
 
468 aa  368  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.033581  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2711  Aldehyde Dehydrogenase  43.04 
 
 
464 aa  362  6e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.275428  hitchhiker  0.000000324245 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1820  aldehyde dehydrogenase  44.52 
 
 
463 aa  361  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935448  normal  0.30191 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3003  aldehyde dehydrogenase  46.36 
 
 
469 aa  360  4e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000280927  normal  0.841466 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1725  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.69 
 
 
471 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.450617  decreased coverage  0.000946553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1956  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.25 
 
 
457 aa  354  2e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  43.46 
 
 
465 aa  353  4e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.909574  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0377  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  43.46 
 
 
454 aa  351  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4057  Aldehyde Dehydrogenase  41.29 
 
 
457 aa  348  9e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1926  aldehyde dehydrogenase  41.89 
 
 
455 aa  348  9e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.515635  normal  0.086374 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1629  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  44.86 
 
 
462 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1811  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  44.86 
 
 
462 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0352  aldehyde dehydrogenase family protein  43.24 
 
 
457 aa  347  3e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000509141  normal  0.584654 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1887  aldehyde dehydrogenase  41.78 
 
 
456 aa  347  3e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1346  Aldehyde Dehydrogenase  43.68 
 
 
454 aa  347  3e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.211595  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4169  Aldehyde Dehydrogenase  43.27 
 
 
455 aa  346  5e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1637  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  44.64 
 
 
462 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4209  Aldehyde Dehydrogenase  43.27 
 
 
455 aa  345  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1696  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  44.64 
 
 
462 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.087576  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1646  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  44.2 
 
 
462 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00984812  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1742  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.26 
 
 
470 aa  342  7e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00454  aldehyde-dehydrogenase like protein YneI  44.42 
 
 
454 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0760178  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0391  aldehyde dehydrogenase  41.63 
 
 
454 aa  339  7e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.641534  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10236  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.89 
 
 
511 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4408  Aldehyde Dehydrogenase  40.79 
 
 
457 aa  338  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0330  aldehyde dehydrogenase family protein  40.84 
 
 
457 aa  336  5e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0316513  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3223  Aldehyde Dehydrogenase  43.43 
 
 
469 aa  335  7e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.989475  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0839  aldehyde Dehydrogenase  41.89 
 
 
455 aa  335  7.999999999999999e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2448  aldehyde dehydrogenase  41.91 
 
 
452 aa  335  9e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2399  Aldehyde Dehydrogenase  41.28 
 
 
460 aa  335  1e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3122  Aldehyde Dehydrogenase_  43.43 
 
 
469 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781135  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2056  Aldehyde Dehydrogenase  40.57 
 
 
457 aa  335  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1989  aldehyde dehydrogenase family protein  41.94 
 
 
462 aa  334  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344108  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0352  aldehyde dehydrogenase  43.08 
 
 
459 aa  334  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.491139  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2737  Aldehyde Dehydrogenase  42.48 
 
 
454 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0914  aldehyde dehydrogenase  39.02 
 
 
457 aa  333  3e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.929249 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1626  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  39.52 
 
 
463 aa  333  3e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.411023  normal  0.0128015 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01482  predicted aldehyde dehydrogenase  43.08 
 
 
462 aa  333  4e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2121  Aldehyde Dehydrogenase  43.08 
 
 
462 aa  333  4e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0323198  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01493  hypothetical protein  43.08 
 
 
462 aa  333  4e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1541  hypothetical protein  41.2 
 
 
462 aa  333  4e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1442  hypothetical protein  41.2 
 
 
462 aa  333  4e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4244  aldehyde dehydrogenase  40.31 
 
 
452 aa  333  4e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2133  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  43.08 
 
 
462 aa  333  5e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.753  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1607  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  43.08 
 
 
462 aa  333  5e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.764255  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3924  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  42.38 
 
 
457 aa  333  5e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  decreased coverage  0.00345047 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1681  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  43.08 
 
 
462 aa  333  5e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.956976  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1825  Aldehyde Dehydrogenase  42.19 
 
 
461 aa  333  5e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3025  aldehyde dehydrogenase  43.21 
 
 
469 aa  332  6e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2138  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
462 aa  332  9e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.752498  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1725  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  42.86 
 
 
462 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.875923  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1647  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  42.64 
 
 
462 aa  329  7e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6328  Aldehyde Dehydrogenase  42.54 
 
 
460 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0373532  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3843  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.08 
 
 
458 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2005  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  43.74 
 
 
462 aa  328  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.176912 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08406  succinate-semialdehyde dehydrogenase  38.57 
 
 
449 aa  325  1e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1858  Aldehyde Dehydrogenase  41.79 
 
 
457 aa  323  4e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2100  Aldehyde Dehydrogenase  39.38 
 
 
457 aa  323  5e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.773732  normal  0.123203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>