More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2032 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2488  succinic-semialdehyde dehydrogenase, putative  71.49 
 
 		 463 aa  674    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1006  Aldehyde Dehydrogenase  68.47 
 
 		 463 aa  668    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6093  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  74.3 
 
 		 463 aa  717    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1820  aldehyde dehydrogenase  75.59 
 
 		 463 aa  701    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935448  normal  0.30191 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1223  Aldehyde Dehydrogenase  71.65 
 
 		 462 aa  679    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0984  aldehyde dehydrogenase  68.47 
 
 		 463 aa  669    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1706  Aldehyde Dehydrogenase  76.67 
 
 		 463 aa  719    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.588412 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9222  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  74.3 
 
 		 463 aa  711    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1018  aldehyde dehydrogenase  68.68 
 
 		 463 aa  670    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.752265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2946  aldehyde dehydrogenase  69.11 
 
 		 463 aa  674    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2032  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 460 aa  940    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3357  aldehyde dehydrogenase  69.33 
 
 		 463 aa  676    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3039  putative succinate-semialdehyde dehydrogenase  74.95 
 
 		 477 aa  717    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2400  Aldehyde Dehydrogenase  65.66 
 
 		 463 aa  625  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0775  aldehyde dehydrogenase  56.71 
 
 		 463 aa  556  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.442992  normal  0.410628 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0462  aldehyde dehydrogenase  54.59 
 
 		 526 aa  509  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.433916  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0523  putative aldehyde dehydrogenase  50.98 
 
 		 460 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2363  putative aldehyde dehydrogenase  49.46 
 
 		 460 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.97252  normal  0.760818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0160  aldehyde dehydrogenase  52.09 
 
 		 456 aa  471  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1971  aldehyde dehydrogenase  47.06 
 
 		 460 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1124  aldehyde dehydrogenase family protein  47.91 
 
 		 458 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.115238  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0508  aldehyde dehydrogenase  47.91 
 
 		 456 aa  435  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1120  aldehyde dehydrogenase  49.22 
 
 		 485 aa  437  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000801479 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0821  aldehyde dehydrogenase  46.89 
 
 		 457 aa  432  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.376923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0488  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  46.45 
 
 		 468 aa  425  1e-118  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.627083  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4853  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  47.03 
 
 		 456 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4926  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  47.03 
 
 		 456 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4926  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  47.25 
 
 		 456 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.515013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4876  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  47.03 
 
 		 456 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4778  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  46.81 
 
 		 456 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1299  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  44.52 
 
 		 470 aa  409  1e-113  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410405  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4188  aldehyde dehydrogenase  47.01 
 
 		 452 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4194  Aldehyde Dehydrogenase  45.9 
 
 		 487 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1626  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  42.76 
 
 		 463 aa  402  1e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.411023  normal  0.0128015 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1090  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  45.03 
 
 		 468 aa  400  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.033581  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0034  aldehyde dehydrogenase  44.47 
 
 		 457 aa  396  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000822234  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1159  Aldehyde Dehydrogenase  44.4 
 
 		 466 aa  392  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2321  Aldehyde Dehydrogenase  43.74 
 
 		 466 aa  384  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  42.16 
 
 		 465 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.909574  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0391  aldehyde dehydrogenase  42.83 
 
 		 454 aa  376  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.641534  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1926  aldehyde dehydrogenase  41.81 
 
 		 455 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.515635  normal  0.086374 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07850  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  43.64 
 
 		 471 aa  365  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2711  Aldehyde Dehydrogenase  41.99 
 
 		 464 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.275428  hitchhiker  0.000000324245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2008  Aldehyde Dehydrogenase  43.75 
 
 		 465 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0333  Aldehyde Dehydrogenase  44.44 
 
 		 452 aa  360  2e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.909996  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03968  succinate-semialdehyde dehydrogenase  39.91 
 
 		 462 aa  358  8e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0839  aldehyde Dehydrogenase  42.54 
 
 		 455 aa  358  8e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2911  Aldehyde Dehydrogenase  43.33 
 
 		 458 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3025  aldehyde dehydrogenase  41.85 
 
 		 469 aa  356  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2448  aldehyde dehydrogenase  41.28 
 
 		 452 aa  355  6.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4169  Aldehyde Dehydrogenase  43.17 
 
 		 455 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1858  aldehyde dehydrogenase  41.02 
 
 		 459 aa  355  1e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0838083 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0377  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.58 
 
 		 454 aa  355  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4209  Aldehyde Dehydrogenase  43.17 
 
 		 455 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2737  Aldehyde Dehydrogenase  42.16 
 
 		 454 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3122  Aldehyde Dehydrogenase_  41.63 
 
 		 469 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781135  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6328  Aldehyde Dehydrogenase  41.59 
 
 		 460 aa  354  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0373532  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10236  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.7 
 
 		 511 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4244  aldehyde dehydrogenase  41.16 
 
 		 452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1292  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP+]  42.11 
 
 		 458 aa  353  4e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09770  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  41.85 
 
 		 461 aa  352  7e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00172669  normal  0.0203425 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10478  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  40.4 
 
 		 473 aa  352  8.999999999999999e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128776  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1103  Aldehyde Dehydrogenase  45.73 
 
 		 450 aa  351  1e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3003  aldehyde dehydrogenase  41.15 
 
 		 469 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000280927  normal  0.841466 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2056  Aldehyde Dehydrogenase  40 
 
 		 457 aa  351  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3223  Aldehyde Dehydrogenase  41.65 
 
 		 469 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.989475  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2318  Aldehyde Dehydrogenase  40.71 
 
 		 452 aa  349  6e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1074  putative aldehyde dehydrogenase  40.18 
 
 		 454 aa  349  7e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000640606  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1844  aldehyde dehydrogenase  46.04 
 
 		 453 aa  348  8e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0330  aldehyde dehydrogenase family protein  38.9 
 
 		 457 aa  347  2e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0316513  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1346  Aldehyde Dehydrogenase  41.94 
 
 		 454 aa  348  2e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.211595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.98 
 
 		 455 aa  347  3e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1887  aldehyde dehydrogenase  41.45 
 
 		 456 aa  346  5e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08406  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.49 
 
 		 449 aa  345  1e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3534  aldehyde dehydrogenase  42.26 
 
 		 455 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.46589 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2453  Aldehyde Dehydrogenase  44.3 
 
 		 455 aa  342  7e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0352  aldehyde dehydrogenase  40.67 
 
 		 459 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.491139  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00454  aldehyde-dehydrogenase like protein YneI  41.72 
 
 		 454 aa  339  5.9999999999999996e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1725  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.69 
 
 		 471 aa  338  8e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.450617  decreased coverage  0.000946553 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0352  aldehyde dehydrogenase family protein  40.22 
 
 		 457 aa  338  9e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000509141  normal  0.584654 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1825  Aldehyde Dehydrogenase  40.67 
 
 		 461 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1858  Aldehyde Dehydrogenase  39.69 
 
 		 457 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10340  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  40 
 
 		 461 aa  337  1.9999999999999998e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.688946  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0139  Aldehyde Dehydrogenase  41.16 
 
 		 451 aa  336  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1911  aldehyde dehydrogenase  38.85 
 
 		 458 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3924  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  41.14 
 
 		 457 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  decreased coverage  0.00345047 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4057  Aldehyde Dehydrogenase  39.51 
 
 		 457 aa  333  3e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3151  aldehyde dehydrogenase family protein  38.65 
 
 		 461 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2399  Aldehyde Dehydrogenase  38.82 
 
 		 460 aa  332  6e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2100  Aldehyde Dehydrogenase  37.94 
 
 		 457 aa  332  7.000000000000001e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.773732  normal  0.123203 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1620  aldehyde dehydrogenase  37.75 
 
 		 454 aa  332  8e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3617  Aldehyde Dehydrogenase  40.44 
 
 		 470 aa  331  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2704  aldehyde dehydrogenase  38.2 
 
 		 461 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598513 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2070  aldehyde dehydrogenase  38.9 
 
 		 475 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0905776  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2894  aldehyde dehydrogenase  38.2 
 
 		 461 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0388  Aldehyde Dehydrogenase_  40.04 
 
 		 458 aa  329  6e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000227501  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3843  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.22 
 
 		 458 aa  329  7e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1811  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  40.67 
 
 		 462 aa  326  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1742  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.74 
 
 		 470 aa  325  8.000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1637  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  40.67 
 
 		 462 aa  325  9e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>