More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2008 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2008  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 		 465 aa  938    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6328  Aldehyde Dehydrogenase  71.46 
 
 		 460 aa  667    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0373532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2100  Aldehyde Dehydrogenase  60.44 
 
 		 457 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.773732  normal  0.123203 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1074  putative aldehyde dehydrogenase  60.93 
 
 		 454 aa  560  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000640606  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1292  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP+]  58.71 
 
 		 458 aa  557  1e-157  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0330  aldehyde dehydrogenase family protein  56.7 
 
 		 457 aa  536  1e-151  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0316513  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2321  Aldehyde Dehydrogenase  59.03 
 
 		 466 aa  535  1e-151  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2399  Aldehyde Dehydrogenase  58.08 
 
 		 460 aa  535  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0388  Aldehyde Dehydrogenase_  57.27 
 
 		 458 aa  526  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000227501  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1858  Aldehyde Dehydrogenase  56.04 
 
 		 457 aa  525  1e-148  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2070  aldehyde dehydrogenase  57.3 
 
 		 475 aa  523  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0905776  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2448  aldehyde dehydrogenase  56.76 
 
 		 452 aa  519  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2056  Aldehyde Dehydrogenase  54.75 
 
 		 457 aa  521  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1541  hypothetical protein  53.86 
 
 		 462 aa  516  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1159  Aldehyde Dehydrogenase  56.8 
 
 		 466 aa  517  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1442  hypothetical protein  53.64 
 
 		 462 aa  514  1e-144  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1989  aldehyde dehydrogenase family protein  55.48 
 
 		 462 aa  507  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0391  aldehyde dehydrogenase  55.41 
 
 		 454 aa  502  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.641534  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0352  aldehyde dehydrogenase family protein  55.07 
 
 		 457 aa  504  1e-141  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000509141  normal  0.584654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2737  Aldehyde Dehydrogenase  54 
 
 		 454 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4169  Aldehyde Dehydrogenase  53.88 
 
 		 455 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4209  Aldehyde Dehydrogenase  53.88 
 
 		 455 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1926  aldehyde dehydrogenase  53.22 
 
 		 455 aa  499  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.515635  normal  0.086374 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3003  aldehyde dehydrogenase  59.24 
 
 		 469 aa  495  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000280927  normal  0.841466 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0333  Aldehyde Dehydrogenase  58.8 
 
 		 452 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.909996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  53.83 
 
 		 465 aa  495  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.909574  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3122  Aldehyde Dehydrogenase_  57.91 
 
 		 469 aa  491  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781135  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2711  Aldehyde Dehydrogenase  52.94 
 
 		 464 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.275428  hitchhiker  0.000000324245 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3223  Aldehyde Dehydrogenase  57.68 
 
 		 469 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.989475  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1887  aldehyde dehydrogenase  52.76 
 
 		 456 aa  487  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1346  Aldehyde Dehydrogenase  54 
 
 		 454 aa  485  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.211595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0377  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  52.78 
 
 		 454 aa  483  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0839  aldehyde Dehydrogenase  49.89 
 
 		 455 aa  481  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4057  Aldehyde Dehydrogenase  52.43 
 
 		 457 aa  478  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08406  succinate-semialdehyde dehydrogenase  49.22 
 
 		 449 aa  475  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3617  Aldehyde Dehydrogenase  54.08 
 
 		 470 aa  475  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03968  succinate-semialdehyde dehydrogenase  46.71 
 
 		 462 aa  472  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3025  aldehyde dehydrogenase  57.91 
 
 		 469 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3534  aldehyde dehydrogenase  52.11 
 
 		 455 aa  468  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.46589 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2318  Aldehyde Dehydrogenase  49.45 
 
 		 452 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00454  aldehyde-dehydrogenase like protein YneI  53.64 
 
 		 454 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0760178  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10478  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  44.93 
 
 		 473 aa  460  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128776  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4244  aldehyde dehydrogenase  56.98 
 
 		 452 aa  456  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0803768  normal  0.0353537 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1858  aldehyde dehydrogenase  45.37 
 
 		 459 aa  456  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0838083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1725  succinic semialdehyde dehydrogenase  52.51 
 
 		 471 aa  457  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.450617  decreased coverage  0.000946553 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0222  aldehyde dehydrogenase  49.67 
 
 		 456 aa  451  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  50.66 
 
 		 455 aa  449  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4408  Aldehyde Dehydrogenase  47.05 
 
 		 457 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1956  succinic semialdehyde dehydrogenase  53.3 
 
 		 457 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15470  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  52.32 
 
 		 458 aa  444  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.580059  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1911  aldehyde dehydrogenase  44.3 
 
 		 458 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4244  aldehyde dehydrogenase  46.77 
 
 		 452 aa  441  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3924  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  51.54 
 
 		 457 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  decreased coverage  0.00345047 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1620  aldehyde dehydrogenase  47.56 
 
 		 454 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2457  aldehyde dehydrogenase  47.22 
 
 		 463 aa  435  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2542  aldehyde dehydrogenase  46.44 
 
 		 454 aa  436  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3843  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.54 
 
 		 458 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1742  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.21 
 
 		 470 aa  438  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0352  aldehyde dehydrogenase  46.49 
 
 		 459 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.491139  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2216  Aldehyde Dehydrogenase  49.34 
 
 		 474 aa  422  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273207  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2453  Aldehyde Dehydrogenase  49.89 
 
 		 455 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11010  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  50.56 
 
 		 458 aa  421  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.148552  normal  0.0213171 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01482  predicted aldehyde dehydrogenase  47.99 
 
 		 462 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2121  Aldehyde Dehydrogenase  47.99 
 
 		 462 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0323198  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1681  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  47.99 
 
 		 462 aa  415  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.956976  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1647  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  47.99 
 
 		 462 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2394  aldehyde dehydrogenase  48.21 
 
 		 463 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0666523  normal  0.869122 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2894  aldehyde dehydrogenase  45.55 
 
 		 461 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2133  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  47.99 
 
 		 462 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1607  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  47.99 
 
 		 462 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.764255  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2202  Aldehyde Dehydrogenase  48.46 
 
 		 456 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01493  hypothetical protein  47.99 
 
 		 462 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1646  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  48.21 
 
 		 462 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00984812  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2660  aldehyde dehydrogenase family protein  47.77 
 
 		 463 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.349181  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10236  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.91 
 
 		 511 aa  412  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1446  aldehyde dehydrogenase  44.52 
 
 		 465 aa  412  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  0.248948 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1696  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  48.21 
 
 		 462 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.087576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3276  aldehyde dehydrogenase  46.2 
 
 		 463 aa  415  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0875007 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1811  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  48.21 
 
 		 462 aa  415  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2704  aldehyde dehydrogenase  46.1 
 
 		 461 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598513 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1637  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  48.21 
 
 		 462 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2138  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  47.54 
 
 		 462 aa  412  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.752498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0462  aldehyde dehydrogenase  45.01 
 
 		 526 aa  412  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.433916  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1642  adenylosuccinate lyase  45.41 
 
 		 461 aa  413  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1629  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  48.21 
 
 		 462 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1725  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  47.77 
 
 		 462 aa  412  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.875923  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3151  aldehyde dehydrogenase family protein  45.88 
 
 		 461 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4111  Aldehyde Dehydrogenase  50.75 
 
 		 461 aa  408  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3357  aldehyde dehydrogenase  45.71 
 
 		 463 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2946  aldehyde dehydrogenase  45.3 
 
 		 463 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2563  aldehyde dehydrogenase  45.88 
 
 		 461 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0984  aldehyde dehydrogenase  45.49 
 
 		 463 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0523  putative aldehyde dehydrogenase  43.68 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2797  Aldehyde Dehydrogenase  49.45 
 
 		 457 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0914  aldehyde dehydrogenase  43.08 
 
 		 457 aa  403  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.929249 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2005  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  48.21 
 
 		 462 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176912 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1006  Aldehyde Dehydrogenase  45.71 
 
 		 463 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1018  aldehyde dehydrogenase  45.71 
 
 		 463 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.752265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1188  aldehyde dehydrogenase  48.57 
 
 		 461 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417271  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1608  aldehyde dehydrogenase  44.8 
 
 		 443 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>