More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10478 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_10478  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
473 aa  974    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128776  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1858  aldehyde dehydrogenase  59.87 
 
 
459 aa  598  1e-170  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0838083 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03968  succinate-semialdehyde dehydrogenase  58.41 
 
 
462 aa  573  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1911  aldehyde dehydrogenase  59.03 
 
 
458 aa  558  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1446  aldehyde dehydrogenase  59.25 
 
 
465 aa  538  9.999999999999999e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  0.248948 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2008  Aldehyde Dehydrogenase  45.13 
 
 
465 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6328  Aldehyde Dehydrogenase  44.12 
 
 
460 aa  443  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0373532  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1292  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP+]  44.15 
 
 
458 aa  431  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2399  Aldehyde Dehydrogenase  43.05 
 
 
460 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0388  Aldehyde Dehydrogenase_  45.15 
 
 
458 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000227501  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2100  Aldehyde Dehydrogenase  43.27 
 
 
457 aa  418  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.773732  normal  0.123203 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0330  aldehyde dehydrogenase family protein  42.07 
 
 
457 aa  414  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0316513  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1159  Aldehyde Dehydrogenase  44.05 
 
 
466 aa  409  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2321  Aldehyde Dehydrogenase  42.48 
 
 
466 aa  410  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2070  aldehyde dehydrogenase  43.93 
 
 
475 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0905776  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2056  Aldehyde Dehydrogenase  42.83 
 
 
457 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2448  aldehyde dehydrogenase  43.68 
 
 
452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1858  Aldehyde Dehydrogenase  42.42 
 
 
457 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1346  Aldehyde Dehydrogenase  42.63 
 
 
454 aa  401  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.211595  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0352  aldehyde dehydrogenase family protein  41.1 
 
 
457 aa  396  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000509141  normal  0.584654 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1825  Aldehyde Dehydrogenase  41.16 
 
 
461 aa  393  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1541  hypothetical protein  39.74 
 
 
462 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1442  hypothetical protein  39.74 
 
 
462 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1074  putative aldehyde dehydrogenase  40.53 
 
 
454 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000640606  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0462  aldehyde dehydrogenase  41.46 
 
 
526 aa  386  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.433916  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00454  aldehyde-dehydrogenase like protein YneI  41.59 
 
 
454 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0760178  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1120  aldehyde dehydrogenase  39.47 
 
 
485 aa  382  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000801479 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0160  aldehyde dehydrogenase  42.51 
 
 
456 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01482  predicted aldehyde dehydrogenase  41.87 
 
 
462 aa  378  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2121  Aldehyde Dehydrogenase  41.87 
 
 
462 aa  378  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0323198  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2133  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.87 
 
 
462 aa  378  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.753  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1607  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.87 
 
 
462 aa  378  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.764255  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1647  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.65 
 
 
462 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1681  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.87 
 
 
462 aa  378  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.956976  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3357  aldehyde dehydrogenase  40.44 
 
 
463 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2946  aldehyde dehydrogenase  40.44 
 
 
463 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01493  hypothetical protein  41.87 
 
 
462 aa  378  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2453  Aldehyde Dehydrogenase  41.28 
 
 
455 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1725  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.65 
 
 
462 aa  375  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.875923  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2138  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.43 
 
 
462 aa  375  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.752498  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0333  Aldehyde Dehydrogenase  40.35 
 
 
452 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.909996  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2005  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.65 
 
 
462 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.176912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2488  succinic-semialdehyde dehydrogenase, putative  40.74 
 
 
463 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101295  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1018  aldehyde dehydrogenase  39.78 
 
 
463 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.752265  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1637  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.2 
 
 
462 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1971  aldehyde dehydrogenase  40.35 
 
 
460 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1629  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.2 
 
 
462 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2363  putative aldehyde dehydrogenase  40.09 
 
 
460 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.97252  normal  0.760818 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1006  Aldehyde Dehydrogenase  40.04 
 
 
463 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1646  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.2 
 
 
462 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00984812  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1696  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.2 
 
 
462 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.087576  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0984  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 
463 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1811  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.2 
 
 
462 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3617  Aldehyde Dehydrogenase  39.82 
 
 
470 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0391  aldehyde dehydrogenase  38.55 
 
 
454 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.641534  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1989  aldehyde dehydrogenase family protein  39.47 
 
 
462 aa  368  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344108  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0523  putative aldehyde dehydrogenase  39.51 
 
 
460 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0775  aldehyde dehydrogenase  39.04 
 
 
463 aa  365  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.442992  normal  0.410628 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0352  aldehyde dehydrogenase  38.36 
 
 
459 aa  365  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.491139  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6093  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  42.23 
 
 
463 aa  363  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9222  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  42.95 
 
 
463 aa  363  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2737  Aldehyde Dehydrogenase  39.38 
 
 
454 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1887  aldehyde dehydrogenase  40.31 
 
 
456 aa  363  4e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4408  Aldehyde Dehydrogenase  41.1 
 
 
457 aa  362  9e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1299  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  37.22 
 
 
470 aa  360  3e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410405  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2400  Aldehyde Dehydrogenase  42.23 
 
 
463 aa  360  4e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0222  aldehyde dehydrogenase  41.69 
 
 
456 aa  359  5e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1223  Aldehyde Dehydrogenase  41.01 
 
 
462 aa  359  6e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  39.02 
 
 
465 aa  359  6e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.909574  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1742  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.53 
 
 
470 aa  358  8e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4057  Aldehyde Dehydrogenase  38.22 
 
 
457 aa  358  8e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08406  succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.13 
 
 
449 aa  358  8e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09770  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  39.12 
 
 
461 aa  358  9.999999999999999e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00172669  normal  0.0203425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4244  aldehyde dehydrogenase  39.02 
 
 
452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2894  aldehyde dehydrogenase  38.27 
 
 
461 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237665  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1725  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.67 
 
 
471 aa  355  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.450617  decreased coverage  0.000946553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2711  Aldehyde Dehydrogenase  36.88 
 
 
464 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.275428  hitchhiker  0.000000324245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3276  aldehyde dehydrogenase  38.98 
 
 
463 aa  354  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0875007 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3003  aldehyde dehydrogenase  38.63 
 
 
469 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000280927  normal  0.841466 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4244  aldehyde dehydrogenase  41.58 
 
 
452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0803768  normal  0.0353537 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1956  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.58 
 
 
457 aa  353  5e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1124  aldehyde dehydrogenase family protein  37.99 
 
 
458 aa  352  5.9999999999999994e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.115238  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1706  Aldehyde Dehydrogenase  40.22 
 
 
463 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.588412 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1926  aldehyde dehydrogenase  38 
 
 
455 aa  352  8e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.515635  normal  0.086374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3039  putative succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.17 
 
 
477 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3151  aldehyde dehydrogenase family protein  37.61 
 
 
461 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2704  aldehyde dehydrogenase  37.39 
 
 
461 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.598513 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0034  aldehyde dehydrogenase  37.75 
 
 
457 aa  349  5e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000822234  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  39.82 
 
 
455 aa  349  5e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2318  Aldehyde Dehydrogenase  38.58 
 
 
452 aa  349  6e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170105  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0508  aldehyde dehydrogenase  38.77 
 
 
456 aa  348  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1820  aldehyde dehydrogenase  40.22 
 
 
463 aa  347  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.935448  normal  0.30191 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4194  Aldehyde Dehydrogenase  36.88 
 
 
487 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4853  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.55 
 
 
456 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4876  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.55 
 
 
456 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4169  Aldehyde Dehydrogenase  38.41 
 
 
455 aa  343  5e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4188  aldehyde dehydrogenase  38.14 
 
 
452 aa  342  5.999999999999999e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4778  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  38.55 
 
 
456 aa  342  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4209  Aldehyde Dehydrogenase  38.19 
 
 
455 aa  342  8e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15470  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  38.36 
 
 
458 aa  342  8e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.580059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>