More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1096 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1096  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 		 333 aa  644    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.340288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6973  glycoside hydrolase family 3 protein  52.42 
 
 		 346 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6315  glycoside hydrolase family 3 protein  53.33 
 
 		 346 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.636822 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1514  glycoside hydrolase family protein  53.54 
 
 		 379 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6974  glycoside hydrolase family 3 protein  44.17 
 
 		 337 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6316  glycoside hydrolase family 3 protein  43.87 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.398008 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1513  glycoside hydrolase family protein  42.61 
 
 		 288 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2523  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.38 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.86 
 
 		 490 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.5 
 
 		 594 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.72 
 
 		 504 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  34.28 
 
 		 492 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  40.27 
 
 		 966 aa  124  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.52 
 
 		 484 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  35.71 
 
 		 604 aa  123  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  34.82 
 
 		 499 aa  122  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  32.97 
 
 		 589 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  29.04 
 
 		 520 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  34.52 
 
 		 520 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.22 
 
 		 511 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  37.59 
 
 		 503 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  31.36 
 
 		 511 aa  119  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.75 
 
 		 582 aa  119  7e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  33.65 
 
 		 498 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.3 
 
 		 591 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0256  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 		 400 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702378 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.47 
 
 		 698 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.9 
 
 		 530 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.96 
 
 		 596 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4486  glycoside hydrolase family 3 protein  35.26 
 
 		 468 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102459  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  34.88 
 
 		 365 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  33.05 
 
 		 592 aa  113  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  34.69 
 
 		 538 aa  112  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.52 
 
 		 365 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  31.03 
 
 		 557 aa  112  9e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.52 
 
 		 365 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.92 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  34.83 
 
 		 420 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.22 
 
 		 387 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4021  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.76 
 
 		 403 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0221723  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  34.21 
 
 		 542 aa  109  8.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31 
 
 		 976 aa  108  9.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.3 
 
 		 583 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  29.46 
 
 		 971 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  34.18 
 
 		 656 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.91 
 
 		 534 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.91 
 
 		 534 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.16 
 
 		 537 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0219  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.15 
 
 		 397 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07520  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  38.17 
 
 		 499 aa  106  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.139948 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  32.82 
 
 		 585 aa  106  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0229  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.15 
 
 		 401 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0813841  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  32.57 
 
 		 386 aa  106  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0239  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.15 
 
 		 401 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.716439 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.5 
 
 		 573 aa  105  8e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  32.09 
 
 		 427 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.45 
 
 		 543 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  38.35 
 
 		 631 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.47 
 
 		 543 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  27.27 
 
 		 517 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2600  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.46 
 
 		 575 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121893 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  32.49 
 
 		 1003 aa  103  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.62 
 
 		 953 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  31.87 
 
 		 992 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  32.5 
 
 		 538 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  28.73 
 
 		 990 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0523  Beta-glucosidase-related glycosidase  26.76 
 
 		 403 aa  100  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.328579  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.89 
 
 		 552 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0154  glycoside hydrolase family 3 protein  27.08 
 
 		 351 aa  98.6  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  33.07 
 
 		 624 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.97 
 
 		 1018 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  34.15 
 
 		 575 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  35.4 
 
 		 575 aa  97.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.77 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  28.41 
 
 		 363 aa  97.8  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01416  beta-N-acetylglucosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04060)  30.3 
 
 		 923 aa  97.4  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.249687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  32.76 
 
 		 490 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2968  beta-hexosaminidase  36.28 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0265184  hitchhiker  0.0000639415 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2332  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.93 
 
 		 409 aa  97.4  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  33.33 
 
 		 552 aa  97.1  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.72 
 
 		 568 aa  97.1  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0793  glycosy hydrolase family protein  28.28 
 
 		 350 aa  97.1  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0989068  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4322  putative Beta-hexosaminidase  32.21 
 
 		 476 aa  96.3  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.52 
 
 		 482 aa  96.3  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1531  glycoside hydrolase family 3 protein  30.84 
 
 		 478 aa  96.3  7e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000631966  unclonable  5.75811e-19 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  28.3 
 
 		 444 aa  96.3  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  31.56 
 
 		 1012 aa  96.3  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2890  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.85 
 
 		 553 aa  95.9  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  29.17 
 
 		 997 aa  95.9  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10240  lipoprotein lpqI  29.39 
 
 		 388 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000940475  normal  0.839336 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.21 
 
 		 358 aa  95.1  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  31.14 
 
 		 481 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01861  beta-N-acetylglucosaminidase  29.15 
 
 		 544 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0415  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.89 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0694223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.95 
 
 		 558 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  29.52 
 
 		 541 aa  95.1  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  31.37 
 
 		 357 aa  94  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01720  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  29.41 
 
 		 383 aa  94  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.651137  normal  0.324393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.82 
 
 		 414 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0897745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.84 
 
 		 600 aa  93.6  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>