225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0225 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0225  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 		 180 aa  371  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0202  flavin reductase domain-containing protein  41.98 
 
 		 176 aa  114  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0853  flavin reductase domain-containing protein  35.76 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6111  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.66 
 
 		 374 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.575038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3957  flavoprotein oxidoreductase  31.03 
 
 		 175 aa  80.9  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  29.88 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5477  hypothetical protein  29.34 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1544  flavin reductase-like, FMN-binding  28.39 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.917406  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2298  flavin reductase domain-containing protein  30.07 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1415  flavin reductase-like, FMN-binding  28.39 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0331151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2059  flavin reductase-like, FMN-binding  30.32 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000136887  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  27.46 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2006  flavin reductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.77 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1029  flavin reductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736467  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1316  flavin reductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2295  flavin reductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  27.54 
 
 		 408 aa  67.8  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1403  flavin reductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3186  flavin reductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 226 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.528706  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3059  flavin reductase domain-containing protein  29.41 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2625  flavin reductase domain-containing protein  29.11 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7128  flavoprotein oxidoreductase  28.29 
 
 		 167 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  29.87 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0686  flavin reductase-like, FMN-binding  28.37 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.520782  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1705  flavin reductase domain-containing protein  26.58 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.190876 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  31.1 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3755  flavin reductase-like, FMN-binding  29.41 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.41 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3295  putative monooxygenase/flavin reductase-like, FMN-binding  28.06 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940039  normal  0.148638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0126  flavin reductase-like, FMN-binding  26.32 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4357  flavin reductase domain-containing protein  28.65 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0722  flavin reductase domain-containing protein  26.88 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1645 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3189  flavin reductase domain-containing protein  24.83 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3189  flavin reductase domain-containing protein  26.11 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4106  flavin reductase domain-containing protein  27.78 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0127  flavin reductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  26.32 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  26.97 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2949  flavin reductase domain-containing protein  30.52 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08811  hypothetical protein  28 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102678 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6858  flavin reductase-like, FMN-binding  28.12 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5906  flavin reductase-like, FMN-binding  27.21 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4641  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.32 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5310  flavoprotein oxidoreductase  27.56 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00829883  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  26.14 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  27.78 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000520403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1964  flavin reductase-like, FMN-binding  27.27 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277567  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2599  flavin reductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2575  flavin reductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0855  flavin reductase family protein  26.62 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0181581  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2494  flavin reductase domain-containing protein  26.88 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2623  flavin reductase domain-containing protein  26.88 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0470  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  25.48 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  26.14 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  25.15 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0917  hypothetical protein  27.46 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00504908  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0737  putative flavin reductase-like protein  25 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2278  flavin reductase domain-containing protein  23.6 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663724 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09781  hypothetical protein  31 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09761  hypothetical protein  31 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.432138  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0080  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.39 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  28.46 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  23.9 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8271  flavin reductase domain-containing protein  27.94 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  25.95 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  25.95 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0643  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.17 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0543494  normal  0.644181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.78 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0140  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.39 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.829164  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0847  flavin reductase protein  23.17 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.543841 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  23.17 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.426778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0092  flavin reductase domain-containing protein  26.75 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  25.19 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3225  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.39 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1364  hypothetical protein  30.69 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2646  flavin reductase-like, FMN-binding  26.9 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.99 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  25.95 
 
 		 327 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  23.78 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6441  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.6 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0182942 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1114  hypothetical protein  27.46 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  27.59 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14951  hypothetical protein  26.76 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.431741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3210  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.16 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  21.56 
 
 		 169 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0591  flavin reductase domain-containing protein  25.71 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1727  putative flavoprotein oxidoreductase  22.08 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  26.32 
 
 		 160 aa  54.3  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2488  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  24.53 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0934  flavin reductase domain-containing protein  27.16 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal  0.609948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  25.56 
 
 		 430 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0713  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.95 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0114519  normal  0.0515265 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  25.62 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1583  flavin reductase domain-containing protein  25.81 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  25.66 
 
 		 393 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  27.1 
 
 		 309 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2148  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.52 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09651  hypothetical protein  29 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.81 
 
 		 155 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>