More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1128 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1128  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  663    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1256  hypothetical protein  68.75 
 
 
311 aa  432  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.554537 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1571  hypothetical protein  39.52 
 
 
363 aa  187  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0167434  hitchhiker  0.00710721 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3914  hypothetical protein  33.22 
 
 
294 aa  127  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  32.32 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  30.68 
 
 
246 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  31.95 
 
 
242 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  31.84 
 
 
251 aa  112  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2862  hypothetical protein  32.37 
 
 
261 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0229449  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  31.85 
 
 
243 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  31.23 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  31.32 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  29.48 
 
 
242 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0770  hypothetical cytosolic protein  29.75 
 
 
235 aa  110  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1195  hypothetical protein  29.75 
 
 
235 aa  110  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  30.3 
 
 
246 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  41.1 
 
 
243 aa  109  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3721  hypothetical protein  31.46 
 
 
256 aa  109  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0381859  normal  0.989712 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  41.1 
 
 
243 aa  109  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1137  hypothetical protein  31.73 
 
 
241 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302517  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  31.94 
 
 
264 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  30.68 
 
 
241 aa  108  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  30.68 
 
 
241 aa  109  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  31.85 
 
 
243 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01006  hypothetical protein  30.86 
 
 
242 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  28.73 
 
 
242 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  32.58 
 
 
254 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  40.49 
 
 
243 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  31.48 
 
 
243 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  40.49 
 
 
243 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  30.37 
 
 
246 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  30.08 
 
 
248 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  29.92 
 
 
246 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  29.96 
 
 
240 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  29.1 
 
 
242 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  32.21 
 
 
243 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  32.21 
 
 
243 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  32.21 
 
 
243 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  32.21 
 
 
243 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  29.7 
 
 
242 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  32.21 
 
 
243 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  31.85 
 
 
243 aa  106  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  32.84 
 
 
243 aa  106  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0968  hypothetical protein  32.13 
 
 
279 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1023  hypothetical protein  33.71 
 
 
244 aa  105  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000164344  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  29.55 
 
 
246 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  30.15 
 
 
285 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1336  hypothetical protein  30.68 
 
 
244 aa  105  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.013723  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1087  hypothetical protein  33.21 
 
 
244 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000824197  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  39.38 
 
 
243 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1120  hypothetical protein  32.96 
 
 
229 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000341688  normal  0.0668952 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  31.32 
 
 
262 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1018  hypothetical protein  33.58 
 
 
244 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000015532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3271  protein of unknown function DUF152  32.96 
 
 
244 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000428401  normal  0.0384904 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  31.32 
 
 
262 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  29.32 
 
 
242 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  29.15 
 
 
285 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3073  hypothetical protein  31.21 
 
 
262 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3264  hypothetical protein  29 
 
 
247 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1575  protein of unknown function DUF152  34.96 
 
 
229 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  32.74 
 
 
255 aa  103  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  31.62 
 
 
248 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2849  hypothetical protein  29.43 
 
 
241 aa  102  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  30.19 
 
 
242 aa  102  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3142  hypothetical protein  29.74 
 
 
241 aa  102  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.643342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  28.84 
 
 
240 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  28.95 
 
 
243 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2949  hypothetical protein  29.48 
 
 
239 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0109702  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3578  hypothetical protein  32.38 
 
 
257 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  31.11 
 
 
243 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  30.94 
 
 
260 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3498  hypothetical protein  29.48 
 
 
260 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.972564  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  32.09 
 
 
255 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  32.35 
 
 
255 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  30.3 
 
 
255 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1816  hypothetical protein  30.8 
 
 
279 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.570044 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  31.34 
 
 
244 aa  99.8  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  29.74 
 
 
248 aa  99.8  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  30.3 
 
 
243 aa  99.4  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3213  hypothetical protein  30.3 
 
 
243 aa  99.4  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000121495  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  30.94 
 
 
252 aa  99.4  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3476  hypothetical protein  30.3 
 
 
243 aa  99  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00372273  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  36.46 
 
 
265 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  31.7 
 
 
259 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  29.37 
 
 
253 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  30.3 
 
 
255 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  31.07 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  27.82 
 
 
242 aa  97.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2475  hypothetical protein  32.74 
 
 
269 aa  97.4  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1703  hypothetical protein  31.37 
 
 
279 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518116  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2557  hypothetical protein  31.58 
 
 
271 aa  96.3  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00303813  normal  0.0127768 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  31.44 
 
 
250 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3598  hypothetical protein  36.36 
 
 
281 aa  96.3  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0957834  normal  0.104911 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  28.68 
 
 
223 aa  96.3  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2020  protein of unknown function DUF152  30.69 
 
 
255 aa  96.3  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0922  hypothetical protein  29.12 
 
 
261 aa  95.9  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1369  hypothetical protein  27.86 
 
 
214 aa  95.9  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  29.52 
 
 
244 aa  95.9  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  30.07 
 
 
244 aa  95.9  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1482  hypothetical protein  29.62 
 
 
279 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181328  normal  0.125569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>